Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480455
• Subject: XM_024446324.1
• Aligned Length: 1234
• Identities: 1202
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT  74

Query   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT  148

Query  149  TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG  222

Query  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC  296

Query  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG  370

Query  371  CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC  444

Query  445  CACCTNANCANTCCCANCCTTNTCGNTGGTNGAAGGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTNAAC  518
            |||||.|.||.| |||.||||.|||.||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  445  CACCTCAACACT-CCAGCCTTCTCGCTGGTGGAA-GACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTCAAC  516

Query  519  CCGTGGGNCNNNNAATGCCACCAGNCCCACNTGACCCCGCCTGTGCTCNNAGTACCCANAGAACAAGCGGGCAT  592
            |||||||.|....|||||||||||.|||||.||| |||||||||||||..||||||||.||||||||| |||||
Sbjct  517  CCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGA-CCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAGAACAAGC-GGCAT  588

Query  593  CGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATNCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  CGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCG  662

Query  667  GCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  GCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCT  736

Query  741  GCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGNAGTACTTTCTNNNNNAAGACAAGTAC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.....|||||||||||
Sbjct  737  GCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGCAAAGACAAGTAC  810

Query  815  TATGGNAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCG  888
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  TATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCG  884

Query  889  GAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCCATCATTAGGAGCCAGAGTTCATACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  GAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCCAGAGTTCATACC  958

Query  963  GCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  GCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCAT  1032

Query 1037  CCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  CCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGA  1106

Query 1111  CTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTT  1180

Query 1185  TTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA  1230