Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480469
• Subject: NM_001291765.1
• Aligned Length: 1233
• Identities: 1069
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGATGCCGGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTCAAGGTCTTCATAGACCAGAACCTTAGTCCCGG  74
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCAAAAGATGCCAGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTAAAGGTCTTTATAGACCAGAATCTTAGTCCTGG  74

Query   75  GAAAGGCGTGGTGTCCCTCGTGGCCGTTCACCCCTCCACCGTCAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCAAAAA  148
            ||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GAAAGGTGTGGTATCTCTTGTAGCCGTCCACCCGTCCACAGTCAACACACTTGGGAAGCAGCTTTTGCCAAAAA  148

Query  149  CCTTTGGACAGTCCAATGTCAACATTGCCCAGCAAGTGGTAATTGGTACGCCTCAGAGACCGGCAGCGTCAAAC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  CCTTCGGACAGTCCAATGTCAATATCACACAGCAAGTGGTGATTGGCACGCCTCAGAGACCGGCAGCATCCAAC  222

Query  223  ACCCTGGTGGTAGGAAGCCCACACACCCCCAGCACTCACTTTGCCTCTCAGAACCAGCCTTCCGACTCCTCACC  296
            ||..|.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct  223  ACTATTGTGGTAGGAAGCCCACACACTCCCAACACGCATTTTGTGTCACAGAACCAGACGTCTGACTCCTCACC  296

Query  297  TTGGTCTGCCGGGAAGCGCAACAGGAAAGGAGAGAAGAATGGCAAGGGCCTACGGCATTTCTCCATGAAGGTCT  370
            |||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TTGGTCTGCTGGGAAGCGGAACAGGAAGGGCGAGAAGAATGGCAAGGGCCTGCGGCATTTCTCCATGAAGGTGT  370

Query  371  GCGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGGACCACTTCCTACAACGAAGTGGCAGACGAGCTGGTTGCGGAGTTCAGTGCT  444
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  371  GTGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGAACCACCTCCTACAATGAGGTGGCTGACGAGCTGGTGGCAGAGTTCAGCGCT  444

Query  445  GCCGACAACCACATCTTACCAAACGAGTCAGCTTATGACCAGAAAAACATAAGACGGCGCGTCTACGATGCCTT  518
            ||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGACAACCACATTCTACCAAACGAATCAGCTTATGACCAGAAGAACATCCGGCGGCGTGTCTACGATGCCTT  518

Query  519  AAACGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAGTGGATTGGTCTGCCCACCAACT  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  AAATGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAATGGATCGGCCTGCCCACCAACT  592

Query  593  CGGCTCAGGAATGTCAGAACTTAGAGGTGGAAAGACAGAGGAGACTTGAAAGAATAAAACAGAAACAGTCTCAA  666
            |.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||.
Sbjct  593  CAGCTCAGGAGTGCCAGAACTTAGAGGTAGAGAGGCAGAGGAGGCTGGAGAGGATCAAACAGAAGCAGTCACAG  666

Query  667  CTTCAAGAACTTATTCTACAGCAAATTGCCTTCAAGAACCTGGTGCAGAGAAACCGGCATGCGGAGCAGCAGGC  740
            ||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct  667  CTCCAGGAGCTCATCCTGCAGCAAATTGCCTTCAAGAACTTGGTGCAGAGAAATCGCCAAGCTGAGCAGCAGGC  740

Query  741  CAGCCGGCCACCGCCACCCAACTCAGTCATCCACCTGCCCTTCATCATCGTCAACACCAGCAAGAAGACGGTCA  814
            |.||.||||.||.||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  741  CCGCAGGCCGCCTCCTCCCAACTCTGTCATCCACTTGCCCTTCATCATTGTCAACACCAGCAGGAAGACAGTCA  814

Query  815  TCGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAATTTTGACAACACATTTGAAATCCACGATGAC  888
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  815  TTGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAACTTTGACAACACGTTTGAGATCCACGATGAC  888

Query  889  ATAGAAGTGCTGAAGCGGATGGGCATGGCTTGCGGGCTGGAGTCGGGGAGCTGCTCTGCCGAAGACCTTAAAAT  962
            ||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|.|||||||||.||||||||.||..|
Sbjct  889  ATTGAGGTGCTCAAGCGCATGGGCATGGCATGTGGGCTGGAGTCTGGCAACTGCTCTGCTGAAGACCTCAAGGT  962

Query  963  GGCCAGAAGTCTGGTCCCCAAGGCTCTGGAGCCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGAACTGTTGGAGGCGTGT  1036
            ||||||||||.||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||.||.|
Sbjct  963  GGCCAGAAGTTTGGTACCAAAAGCTCTAGAACCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGATCCATTGGTGGAGTAT  1036

Query 1037  TCATCACGACGGCAGGTTCCACGTCTAACGGCACAAGGTTCTCTGCCAGTGACCTGACCAACGGTGCAGATGGG  1110
            ||.|||||||..|||||||.||.||.||.|||||||||.|.|||||||||||..|||.|||.||||||||||||
Sbjct 1037  TCGTCACGACAACAGGTTCTACATCCAATGGCACAAGGCTTTCTGCCAGTGATTTGAGCAATGGTGCAGATGGG  1110

Query 1111  ATGCTGGCCACAAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTGGAGACTCCGGTGTCCTACGTCGGGGA  1184
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  ATGCTGGCCACGAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTCGAGACCCCTGTGTCCTACGTTGGGGA  1184

Query 1185  GGACGACGAGGAGGACGATGACTTCAACGAGAATGACGACGACGCG---  1230
            |||.||.||.||.||.||||||||.||.||||   |||||||.|.|   
Sbjct 1185  GGATGATGACGACGATGATGACTTTAATGAGA---ACGACGAGGAGGAT  1230