Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480469
• Subject: XM_017312657.1
• Aligned Length: 1239
• Identities: 1069
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGATGCCGGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTCAAGGTCTTCATAGACCAGAACCTTAGTCCCGG  74
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCAAAAGATGCCAGTCTAATTGAAGCCAACGGAGAACTAAAGGTCTTTATAGACCAGAATCTTAGTCCTGG  74

Query   75  GAAAGGCGTGGTGTCCCTCGTGGCCGTTCACCCCTCCACCGTCAACCCGCTCGGGAAGCAGCTCTTGCCAAAAA  148
            ||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GAAAGGTGTGGTATCTCTTGTAGCCGTCCACCCGTCCACAGTCAACACACTTGGGAAGCAGCTTTTGCCAAAAA  148

Query  149  CCTTTGGACAGTCCAATGTCAACATTGCCCAGCAAGTGGTAATTGGTACGCCTCAGAGACCGGCAGCGTCAAAC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  CCTTCGGACAGTCCAATGTCAATATCACACAGCAAGTGGTGATTGGCACGCCTCAGAGACCGGCAGCATCCAAC  222

Query  223  ACCCTGGTGGTAGGAAGCCCACACACCCCCAGCACTCACTTTGCCTCTCAGAACCAGCCTTCCGACTCCTCACC  296
            ||..|.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||..||.|||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct  223  ACTATTGTGGTAGGAAGCCCACACACTCCCAACACGCATTTTGTGTCACAGAACCAGACGTCTGACTCCTCACC  296

Query  297  TTGGTCTGC------CGGGAAGCGCAACAGGAAAGGAGAGAAGAATGGCAAGGGCCTACGGCATTTCTCCATGA  364
            |||||||||      |.|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGGTCTGCTGGGCACAGGAAGCGGAACAGGAAGGGCGAGAAGAATGGCAAGGGCCTGCGGCATTTCTCCATGA  370

Query  365  AGGTCTGCGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGGACCACTTCCTACAACGAAGTGGCAGACGAGCTGGTTGCGGAGTTC  438
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  AGGTGTGTGAGAAGGTGCAGAGGAAAGGAACCACCTCCTACAATGAGGTGGCTGACGAGCTGGTGGCAGAGTTC  444

Query  439  AGTGCTGCCGACAACCACATCTTACCAAACGAGTCAGCTTATGACCAGAAAAACATAAGACGGCGCGTCTACGA  512
            ||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct  445  AGCGCTGCCGACAACCACATTCTACCAAACGAATCAGCTTATGACCAGAAGAACATCCGGCGGCGTGTCTACGA  518

Query  513  TGCCTTAAACGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAGTGGATTGGTCTGCCCA  586
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct  519  TGCCTTAAATGTGCTAATGGCCATGAACATCATCTCCAAGGAGAAGAAGGAGATCAAATGGATCGGCCTGCCCA  592

Query  587  CCAACTCGGCTCAGGAATGTCAGAACTTAGAGGTGGAAAGACAGAGGAGACTTGAAAGAATAAAACAGAAACAG  660
            |||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct  593  CCAACTCAGCTCAGGAGTGCCAGAACTTAGAGGTAGAGAGGCAGAGGAGGCTGGAGAGGATCAAACAGAAGCAG  666

Query  661  TCTCAACTTCAAGAACTTATTCTACAGCAAATTGCCTTCAAGAACCTGGTGCAGAGAAACCGGCATGCGGAGCA  734
            ||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct  667  TCACAGCTCCAGGAGCTCATCCTGCAGCAAATTGCCTTCAAGAACTTGGTGCAGAGAAATCGCCAAGCTGAGCA  740

Query  735  GCAGGCCAGCCGGCCACCGCCACCCAACTCAGTCATCCACCTGCCCTTCATCATCGTCAACACCAGCAAGAAGA  808
            |||||||.||.||||.||.||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct  741  GCAGGCCCGCAGGCCGCCTCCTCCCAACTCTGTCATCCACTTGCCCTTCATCATTGTCAACACCAGCAGGAAGA  814

Query  809  CGGTCATCGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAATTTTGACAACACATTTGAAATCCAC  882
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  815  CAGTCATTGACTGCAGCATCTCCAATGACAAATTTGAGTATCTGTTTAACTTTGACAACACGTTTGAGATCCAC  888

Query  883  GATGACATAGAAGTGCTGAAGCGGATGGGCATGGCTTGCGGGCTGGAGTCGGGGAGCTGCTCTGCCGAAGACCT  956
            ||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|.|||||||||.||||||||
Sbjct  889  GATGACATTGAGGTGCTCAAGCGCATGGGCATGGCATGTGGGCTGGAGTCTGGCAACTGCTCTGCTGAAGACCT  962

Query  957  TAAAATGGCCAGAAGTCTGGTCCCCAAGGCTCTGGAGCCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGAACTGTTGGAG  1030
            .||..|||||||||||.||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..||||.|
Sbjct  963  CAAGGTGGCCAGAAGTTTGGTACCAAAAGCTCTAGAACCATACGTGACAGAAATGGCTCAGGGATCCATTGGTG  1036

Query 1031  GCGTGTTCATCACGACGGCAGGTTCCACGTCTAACGGCACAAGGTTCTCTGCCAGTGACCTGACCAACGGTGCA  1104
            |.||.|||.|||||||..|||||||.||.||.||.|||||||||.|.|||||||||||..|||.|||.||||||
Sbjct 1037  GAGTATTCGTCACGACAACAGGTTCTACATCCAATGGCACAAGGCTTTCTGCCAGTGATTTGAGCAATGGTGCA  1110

Query 1105  GATGGGATGCTGGCCACAAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTGGAGACTCCGGTGTCCTACGT  1178
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  GATGGGATGCTGGCCACGAGCTCCAATGGGTCTCAGTACAGCGGCTCCAGGGTCGAGACCCCTGTGTCCTACGT  1184

Query 1179  CGGGGAGGACGACGAGGAGGACGATGACTTCAACGAGAATGACGACGACGCG---  1230
            .||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||||   |||||||.|.|   
Sbjct 1185  TGGGGAGGATGATGACGACGATGATGACTTTAATGAGA---ACGACGAGGAGGAT  1236