Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480501
• Subject: NM_001283061.1
• Aligned Length: 1968
• Identities: 1837
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296
            ||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  223  ACTGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATATGGCACTGGGACTTATGA  296

Query  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370
            .|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  CAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCATATGGCACCCAGCCTGCCT  370

Query  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444
            |.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct  371  ACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGTAACAAGCCTGCTGAGACT  444

Query  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGCTATCC  518

Query  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTCCTACCAGCTACTCCTCTT  592

Query  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  593  CACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAGCCGAGCAGCTATGGACAA  666

Query  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCCCCCTCAGACTGGATCCTA  740

Query  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814

Query  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCTTGAGTGGC  888

Query  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962

Query  963  CGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC  1033
            |||||||.|||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGTGGACTGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC  1036

Query 1034  TTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGAC  1107
            ||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTGCAAGGATTAAATGAC  1110

Query 1108  AGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCA  1181
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  AATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGATGAACAAGAGAACTGGACA  1184

Query 1182  ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACC  1255
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  ACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCACAGTGTCCTATGAAGATC  1258

Query 1256  CACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTT  1329
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259  CACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAACTTAAAGTGTCTCTT  1332

Query 1330  GCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACC  1403
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1333  GCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAGGGGGATGCCACCACC  1406

Query 1404  ACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATA  1477
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  ACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGACA  1480

Query 1478  GAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGA  1551
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGAAATGTCCAGCACCGA  1554

Query 1552  GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTG  1625
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAACAGAATGCAACCAGTG  1628

Query 1626  TAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCC  1699
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1629  TAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATCGTGGACGAGGTGGCC  1702

Query 1700  CTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGT  1773
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1703  CTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATGTTCAGAGGTGGCAGA  1776

Query 1774  GGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG  1847
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG  1850

Query 1848  CCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAA  1921
            .|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  TCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTGGAGGACCTGGGAAAA  1924

Query 1922  TGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1965
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  TGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC  1968