Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480501
- Subject:
- XM_006514508.2
- Aligned Length:
- 2004
- Identities:
- 1837
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA 278
||| |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATA 296
Query 279 TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT 352
|||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||
Sbjct 297 TGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCAT 370
Query 353 ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA 426
|||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 ATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGT 444
Query 427 AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA 500
||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA 518
Query 501 GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC 574
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 519 GAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTC 592
Query 575 CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA 648
||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 CTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAG 666
Query 649 CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC 722
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCC 740
Query 723 ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 796
.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 814
Query 797 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 888
Query 871 AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 944
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 962
Query 945 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCA 1015
|||||||||||||||||||||||||.||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCA 1036
Query 1016 TGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTAT 1089
||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTAT 1110
Query 1090 GTACAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGAT 1163
||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGAT 1184
Query 1164 GAACAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCA 1237
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185 GAACAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCA 1258
Query 1238 CAGTGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGC 1311
||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 CAGTGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGC 1332
Query 1312 AAACTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGG 1385
|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.||||||||
Sbjct 1333 AAACTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGG 1406
Query 1386 CAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGG 1459
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGGGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGG 1480
Query 1460 GAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGA 1533
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGGCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGA 1554
Query 1534 GGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAG 1607
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 GGAAATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAG 1628
Query 1608 AACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTG 1681
||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1629 AACAGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTG 1702
Query 1682 ATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGA 1755
|||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1703 ATCGTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGA 1776
Query 1756 ATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGG 1829
|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGTTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGG 1850
Query 1830 TGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGAC 1903
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 TGGAGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGAC 1924
Query 1904 GTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAA------------------AGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGG 1959
|||||||||||||.||||||||||| ||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1925 GTGGAGGACCTGGGAAAATGGATAAGGTCCCTTTGCTTTGCAGAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGG 1998
Query 1960 CCCTAC 1965
||||||
Sbjct 1999 CCCTAC 2004