Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480501
• Subject: XM_006514509.2
• Aligned Length: 2001
• Identities: 1837
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA  278
            |||                  |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATA  296

Query  279  TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT  352
            |||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||
Sbjct  297  TGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCAT  370

Query  353  ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA  426
            |||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  ATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGT  444

Query  427  AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA  500
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA  518

Query  501  GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC  574
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  519  GAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTC  592

Query  575  CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA  648
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  CTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAG  666

Query  649  CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC  722
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCC  740

Query  723  ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT  796
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT  814

Query  797  CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG  888

Query  871  AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG  944
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG  962

Query  945  TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGG  1018
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGG  1036

Query 1019  ATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTA  1092
            |||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  ATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTG  1110

Query 1093  CAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAA  1166
            ||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGATGAA  1184

Query 1167  CAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAG  1240
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1185  CAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCACAG  1258

Query 1241  TGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAA  1314
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  TGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAA  1332

Query 1315  CTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAG  1388
            ||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAG  1406

Query 1389  AGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAG  1462
            .||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAG  1480

Query 1463  GCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGA  1536
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGA  1554

Query 1537  AACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAAC  1610
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  AATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAAC  1628

Query 1611  AGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATC  1684
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1629  AGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATC  1702

Query 1685  GTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATG  1758
            ||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1703  GTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATG  1776

Query 1759  TTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGG  1832
            ||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGG  1850

Query 1833  AGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTG  1906
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851  AGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTG  1924

Query 1907  GAGGACCTGGAAAAATGGATAA------------------AGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCC  1962
            ||||||||||.|||||||||||                  ||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1925  GAGGACCTGGGAAAATGGATAAGGTCCCTTTGCTTTGCAGAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCC  1998

Query 1963  TAC  1965
            |||
Sbjct 1999  TAC  2001