Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480501
- Subject:
- XM_006514510.2
- Aligned Length:
- 1986
- Identities:
- 1837
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
||||||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 223 ACTGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATATGGCACTGGGACTTATGA 296
Query 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 CAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCATATGGCACCCAGCCTGCCT 370
Query 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
|.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct 371 ACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGTAACAAGCCTGCTGAGACT 444
Query 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGCTATCC 518
Query 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTCCTACCAGCTACTCCTCTT 592
Query 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 CACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAGCCGAGCAGCTATGGACAA 666
Query 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCCCCCTCAGACTGGATCCTA 740
Query 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
Query 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCTTGAGTGGC 888
Query 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG 962
Query 963 CGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC 1033
|||||||.||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGGTGGACTGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC 1036
Query 1034 TTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGAC 1107
||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTGCAAGGATTAAATGAC 1110
Query 1108 AGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCA 1181
|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 AATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGATGAACAAGAGAACTGGACA 1184
Query 1182 ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACC 1255
||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 ACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCACAGTGTCCTATGAAGATC 1258
Query 1256 CACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTT 1329
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259 CACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAACTTAAAGTGTCTCTT 1332
Query 1330 GCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACC 1403
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1333 GCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAGGGGGATGCCACCACC 1406
Query 1404 ACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATA 1477
|||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 ACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGACA 1480
Query 1478 GAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGA 1551
||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 GAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGAAATGTCCAGCACCGA 1554
Query 1552 GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTG 1625
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAACAGAATGCAACCAGTG 1628
Query 1626 TAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCC 1699
|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1629 TAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATCGTGGACGAGGTGGCC 1702
Query 1700 CTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGT 1773
|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1703 CTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATGTTCAGAGGTGGCAGA 1776
Query 1774 GGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG 1847
||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG 1850
Query 1848 CCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAA 1921
.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 TCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTGGAGGACCTGGGAAAA 1924
Query 1922 TGGATAA------------------AGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC 1965
||||||| ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925 TGGATAAGGTCCCTTTGCTTTGCAGAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC 1986