Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480501
- Subject:
- XM_006514512.3
- Aligned Length:
- 1983
- Identities:
- 1837
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA 278
||| |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATA 296
Query 279 TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT 352
|||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||
Sbjct 297 TGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCAT 370
Query 353 ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA 426
|||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 ATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGT 444
Query 427 AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA 500
||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA 518
Query 501 GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC 574
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 519 GAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTC 592
Query 575 CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA 648
||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 CTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAG 666
Query 649 CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC 722
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCC 740
Query 723 ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 796
.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 814
Query 797 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 888
Query 871 AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 944
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 962
Query 945 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGG 1018
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGG 1036
Query 1019 ATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTA 1092
|||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 ATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTG 1110
Query 1093 CAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAA 1166
||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 CAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGATGAA 1184
Query 1167 CAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAG 1240
||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1185 CAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCACAG 1258
Query 1241 TGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAA 1314
|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 TGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGCAAA 1332
Query 1315 CTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAG 1388
||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 CTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGGCAG 1406
Query 1389 AGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAG 1462
.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGGGAG 1480
Query 1463 GCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGA 1536
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGAGGA 1554
Query 1537 AACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAAC 1610
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 AATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAGAAC 1628
Query 1611 AGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATC 1684
|||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1629 AGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTGATC 1702
Query 1685 GTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATG 1758
||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1703 GTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGAATG 1776
Query 1759 TTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGG 1832
||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGG 1850
Query 1833 AGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTG 1906
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851 AGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGACGTG 1924
Query 1907 GAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC 1965
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925 GAGGACCTGGGAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC 1983