Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480501
- Subject:
- XM_011530001.2
- Aligned Length:
- 2010
- Identities:
- 1797
- Gaps:
- 213
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACC---CAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG 145
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTG 148
Query 146 ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGTCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCT 222
Query 220 CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTA 296
Query 294 TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTG 370
Query 368 CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAG 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACA------------------------------ 414
Query 442 ACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTA 515
Sbjct 415 -------------------------------------------------------------------------- 414
Query 516 TCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCT 589
||||||||||
Sbjct 415 ----------------------------------------------------------------AGCTATTCCT 424
Query 590 CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 CTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGA 498
Query 664 CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATC 572
Query 738 CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACC 646
Query 812 ACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 ACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGT 720
Query 886 GGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGG 794
Query 960 ACGCGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAG 1030
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 ACGCGGTGGAATGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAG 868
Query 1031 ATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAAT 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 ATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAAT 942
Query 1105 GACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGG 1178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 GACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGG 1016
Query 1179 GCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAG 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 GCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAG 1090
Query 1253 ACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCC 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 ACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCC 1164
Query 1327 CTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 CTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACC 1238
Query 1401 ACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAG 1474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 ACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAG 1312
Query 1475 ATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCAC 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 ATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCAC 1386
Query 1549 CGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCC---------------------------------------GGGTTG 1583
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1387 CGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCTTCAATTGGTGATTTCTGCTGTGATGTAATTGTATGCAGGGGTTG 1460
Query 1584 TGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGC 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 TGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGC 1534
Query 1658 CACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTC 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 CACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTC 1608
Query 1732 ATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCG 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 ATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCG 1682
Query 1806 GGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAAC 1879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 GGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAAC 1756
Query 1880 AGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGA 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 AGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGA 1830
Query 1954 GATCGGCCCTAC 1965
||||||||||||
Sbjct 1831 GATCGGCCCTAC 1842