Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480523
• Subject: XM_006515113.3
• Aligned Length: 3328
• Identities: 2710
• Gaps: 209

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGGAGAACTATAAACAGCCCGTGGTGCTGAGAGAGGACAACTGCCGAAGGCGCCGGAGGATGAAGCC  74
            ||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.||||||||||||..|||..|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGGAGAACTATGAACAACCGGTGGTTCTAAGAGAGGACAACCTCCGCCGGCGCCGGAGGATGAAGCC  74

Query   75  GCGCAGTGCTGCGGCCAGCCTGTCCTCCATGGAGCTCATCCCCATCGAGTTCGTGCTGCCCACCAGCCAGCGCA  148
            .|||||.||.||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGCAGCGCAGCAGGCAGCCTGTCTTCCATGGAGCTCATCCCCATTGAGTTCGTACTGCCCACCAGCCAGCGCA  148

Query  149  AATGCAAGAGCCCCGAAACGGCGCTGCTGCACGTGGCCGGCCACGGCAACGTGGAGCAGATGAAGGCCCAGGTG  222
            ...||||||..||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TCAGCAAGACTCCAGAAACAGCGCTGCTGCATGTGGCTGGCCATGGCAATGTGGAACAGATGAAAGCTCAGGTG  222

Query  223  TGGCTGCGAGCGCTGGAGACCAGCGTGGCGGCGGACTTCTACCACCGGCTGGGACCGCATCACTTCCTCCTGCT  296
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct  223  TGGCTGCGCGCACTGGAGACCAGTGTGGCTGCGGAGTTCTACCACCGATTGGGCCCGGACCAATTCCTCCTGCT  296

Query  297  CTATCAGAAGAAGGGGCAGTGGTACGAGATCTACGACAAGTACCAGGTGGTGCAGACTCTGGACTGCCTGCGCT  370
            |||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||.||||||.|||||||||||.||.||||||||||..|
Sbjct  297  CTACCAGAAGAAAGGACAATGGTATGAGATCTATGACAGGTACCAAGTGGTGCAGACCCTAGACTGCCTGCATT  370

Query  371  ACTGGAAGGCCACGCACCGGAGCCCGGGCCAGATCCACCTGGTGCAGCGGCACCCGCCCTCCGAGGAGTCCCAA  444
            ||||||||...|.||||..||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||...||.||.||||||.||...
Sbjct  371  ACTGGAAGTTGATGCACAAGAGCCCTGGCCAGATCCACGTGGTACAGCGACACGTACCTTCTGAGGAGACCTTG  444

Query  445  GCCTTCCAGCGGCAGCTCACGGCGCTGATTGGCTATGACGTCACTGACGTCAGCAACGTGCACGACGATGAGCT  518
            ||.||||||..|||||||||..|.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  GCTTTCCAGAAGCAGCTCACCTCCCTGATTGGCTATGACGTCACTGACATCAGCAATGTGCACGATGATGAGCT  518

Query  519  GGAGTTCACGCGCCGTGGCTTGGTGACCCCGCGCATGGCGGAGGTGGCCAGCCGCGACCCCAAGCTCTACGCCA  592
            .||||||||.|||||..|..||||.||.||.||||||||.||.|||||..||||.||..||||.|||||.||.|
Sbjct  519  AGAGTTCACTCGCCGCCGTCTGGTTACGCCCCGCATGGCTGAAGTGGCTGGCCGGGATGCCAAACTCTATGCTA  592

Query  593  TGCACCCGTGGGTGACGTCCAAGCCCCTCCCGGAGTACCTGTGGAAGAAGATTGCCAACAACTGCATCTTCATC  666
            |||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCACCCTTGGGTAACGTCCAAACCTCTCCCAGACTACCTGTCAAAAAAGATTGCCAACAACTGCATCTTCATC  666

Query  667  GTCATTCACCGCAGCACCACCAGCCAGACCATTAAGGTCTCACCCGACGACACCCCCGGCGCCATCCTGCAGAG  740
            |||||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||..|.||.||.||.||.||..|||||||.|||||
Sbjct  667  GTCATCCACCGCGGTACCACCAGCCAAACCATCAAGGTCTCCGCAGATGATACTCCTGGTACCATCCTCCAGAG  740

Query  741  CTTCTTCACCAAGATGGCCAAGAAGAAATCTCTGATGGATATTCCCGAAAGCCAAAGCGAACAGGATTTTGTGC  814
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||..
Sbjct  741  CTTCTTCACCAAGATGGCCAAGAAGAAGTCCCTAATGAATATCTCAGAAAGTCAAAGTGAGCAGGATTTTGTAT  814

Query  815  TGCGCGTCTGTGGCCGGGATGAGTACCTGGTGGGCGAAACGCCCATCAAAAACTTCCAGTGGGTGAGGCACTGC  888
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TGCGGGTTTGTGGCCGCGATGAGTACCTGGTGGGTGAAACACCCCTCAAAAATTTCCAGTGGGTGAGGCAGTGC  888

Query  889  CTCAAGAACGGAGAAGAGATTCACGTGGTACTGGACACGCCTCCAGACCCGGCCCTAGACGAGGTGAGGAAGGA  962
            ||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  CTCAAGAACGGAGATGAAATACACCTGGTGCTCGACACGCCTCCAGACCCAGCCCTTGATGAGGTGAGGAAGGA  962

Query  963  AGAGTGGCCGCTGGTGGACGACTGCACGGGAGTCACCGGCTACCATGAGCAGCTTACCATCCACGGCAAGGACC  1036
            |||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  AGAATGGCCGCTGGTGGATGACTGCACTGGAGTCACCGGCTACCACGAGCAGCTGACCATCCATGGCAAGGACC  1036

Query 1037  ACGAGAGTGTGTTCACCGTGTCCCTGTGGGACTGCGACCGCAAGTTCAGGGTCAAGATCAGAGGCATTGATATC  1110
            ||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGAGAGTGTGTTCACAGTGTCTTTGTGGGACTGCGACCGAAAGTTCAGGGTCAAGATCAGAGGCATTGATATC  1110

Query 1111  CCCGTCCTGCCTCGGAACACCGACCTCACAGTTTTTGTAGAGGCAAACATCCAGCATGGGCAACAAGTCCTTTG  1184
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  CCTGTCCTGCCTCGGAACACCGACCTCACTGTGTTTGTGGAAGCGAACATCCAGCACGGGCAACAAGTCCTCTG  1184

Query 1185  CCAAAGGAGAACCAGCCCCAAACCCTTCACAGAGGAGGTGCTGTGGAATGTGTGGCTTGAGTTCAGTATCAAAA  1258
            ||||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||
Sbjct 1185  CCAAAGGAGAACCAGCCCTAAGCCCTTCGCAGAAGAGGTACTCTGGAATGTGTGGCTGGAGTTTGGCATCAAAA  1258

Query 1259  TCAAAGACTTGCCCAAAGGGGCTCTACTGAACCTCCAGATCTACTGCGGTAAAGCTCCAGCACTGTCCAGCAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAAAGACTTGCCCAAAGGGGCTCTATTGAACCTACAGATCTACTGCTGCAAAACCCCATCACTGTCCAGCAAG  1332

Query 1333  GCCTCTGCAGAGTCCCCCAGTTCTGAGTCCAAGGGCAAAGTTCAGCTTCTCTATTATGTGAACCTGCTGCTGAT  1406
            ||.|||||||||.|.||..|.||.||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||.|||||.|.||
Sbjct 1333  GCTTCTGCAGAGACTCCAGGCTCCGAGTCCAAGGGCAAAGCCCAGCTTCTCTATTACGTGAACTTGCTGTTAAT  1406

Query 1407  AGACCACCGTTTCCTCCTGCGCCGTGGAGAATACGTCCTCCACATGTGGCAGATATCTGGGAAGGGAGAAGACC  1480
            ||||||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.|
Sbjct 1407  AGACCACCGTTTCCTCCTCCGCCACGGGGACTATGTGCTCCACATGTGGCAGATATCTGGCAAGGCAGAGGAGC  1480

Query 1481  AAGGAAGCTTCAATGCTGACAAACTCACGTCTGCAACTAACCCAGACAAGGAGAACTCAATGTCCATCTCCATT  1554
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1481  AGGGCAGCTTCAATGCTGACAAGCTCACATCCGCAACCAATCCTGACAAGGAGAACTCAATGTCCATTTCCATC  1554

Query 1555  CTTCTGGACAATTACTGCCACCCGATAGCCCTGCCTAAGCATCAGCCCACCCCTGACCCGGAAGGGGACCGGGT  1628
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||.|||.||||
Sbjct 1555  CTGCTGGACAATTACTGTCACCCCATAGCTTTGCCTAAGCACCGGCCCACCCCTGACCCAGAGGGAGACAGGGT  1628

Query 1629  TCGAGCAGAAATGCCCAACCAGCTTCGCAAGCAATTGGAGGCGATCATAGCCACTGATCCACTTAACCCTCTCA  1702
            |||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  TCGGGCTGAAATGCCCAATCAGCTTCGAAAGCAATTGGAGGCGATCATAGCCACAGATCCACTTAACCCCCTCA  1702

Query 1703  CAGCAGAGGACAAAGAATTGCTCTGGCATTTTAGATACGAAAGCCTTAAGCACCCAAAAGCATATCCTAAGCTA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1703  CAGCAGAGGACAAAGAATTGCTCTGGCATTTTCGATATGAAAGCCTGAAGCATCCGAAGGCTTACCCTAAGCTA  1776

Query 1777  TTTAGTTCAGTGAAATGGGGACAGCAAGAAATTGTGGCCAAAACATACCAATTGTTGGCCAGAAGGGAAGTCTG  1850
            ||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.|||||||||||..||||
Sbjct 1777  TTCAGCTCAGTGAAATGGGGGCAGCAAGAAATTGTTGCCAAAACGTACCAGCTGTTAGCCAGAAGGGAGATCTG  1850

Query 1851  GGATCAAAGTGCTTTGGATGTTGGGTTAACAATGCAGCTCCTGGACTGCAACTTCTCAGATGAAAATGTAAGAG  1924
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|
Sbjct 1851  GGATCAAAGTGCTTTGGACGTTGGCTTAACCATGCAGCTCCTGGACTGCAACTTTTCAGACGAGAATGTCCGGG  1924

Query 1925  CCATTGCAGTTCAGAAACTGGAGAGCTTGGAGGACGATGATGTTCTGCATTACCTTCTACAATTGGTCCAGGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||..||||.||||||
Sbjct 1925  CCATTGCAGTTCAGAAACTGGAGAGCTTAGAGGACGATGACGTTTTACATTACCTTCTCCAGCTGGTACAGGCT  1998

Query 1999  GTGAAATTTGAACCATACCATGATAGTGCCCTTGCCAGATTTCTGCTGAAGCGTGGTTTAAGAAACAAAAGAAT  2072
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1999  GTGAAATTTGAACCGTACCACGACAGTGCGCTGGCCAGATTCCTGCTGAAGCGTGGCTTGAGGAACAAAAGAAT  2072

Query 2073  TGGTCACTTTTTGTTTTGGTTCTTGAGAAGTGAGATAGCCCAGTCCAGACACTATCAGCAGAGGTTCGCTGTGA  2146
            .||||||||.|||||.||||||.||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGGTCACTTCTTGTTCTGGTTCCTGCGAAGTGAGATCGCACAGTCCAGACACTATCAGCAGAGGTTCGCTGTGA  2146

Query 2147  TTCTGGAAGCCTATCTGAGGGGCTGTGGCACAGCCATGCTGCACGACTTTACCCAACAAGTCCAAGTAATCGAG  2220
            |.|||||.||.||.|||.|.||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 2147  TCCTGGAGGCGTACCTGCGAGGCTGTGGCACAGCCATGTTGCAGGACTTCACACAGCAGGTCCATGTGATTGAG  2220

Query 2221  ATGTTACAAAAAGTCACCCTTGATATTAAATCGCTCTCTGCTGAAAAGTATGACGTCAGTTCCCAAGTTATTTC  2294
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATGTTACAGAAAGTCACCATTGATATTAAATCGCTCTCGGCAGAGAAGTATGACGTCAGTTCCCAAGTTATTTC  2294

Query 2295  ACAACTTAAACAAAAGCTTGAAAACCTGCAGAATTCTCAA-CTCCCCGAAAGCTTTAGAGTTCCATATGATCCT  2367
            |||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||.|| ||| ||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2295  ACAGCTTAAGCAAAAGCTTGAAAGCCTTCAGAACTC-CAATCTCCCCGAGAGCTTTAGAGTTCCCTATGATCCT  2367

Query 2368  GGACTGAAAGCAGGAGCGCTGGCAATTGAAAAATGTAAAGTAATGGCCTCCAAGAAAAAACCACTATGGCTTGA  2441
            |||||.|||||.||..|.||||..||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2368  GGACTAAAAGCCGGTACCCTGGTGATCGAGAAATGCAAAGTGATGGCCTCCAAGAAGAAGCCCCTGTGGCTTGA  2441

Query 2442  GTTTAAATGTGCCGATCCTACAGCCCTATCAAATGAAACAATTGGAATTATCTTTAAACATGGTGATGATCTGC  2515
            ||||||.|||||.|||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442  GTTTAAGTGTGCTGATCCCACAGTCCTATCCAACGAAACCATTGGAATCATCTTTAAACATGGTGATGATCTGC  2515

Query 2516  GCCAAGACATGCTTATTTTACAGATTCTACGAATCATGGAGTCTATTTGGGAGACTGAATCTTTGGATCTATGC  2589
            |||||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||
Sbjct 2516  GCCAAGACATGTTGATCTTGCAGATTCTACGCATCATGGAGTCCATTTGGGAGACTGAATCTCTGGACCTGTGC  2589

Query 2590  CTCCTGCCATATGGTTGCATTTCAACTGGTGACAAAATAGGAATGATCGAGATTGTGAAAGACGCCACGACAAT  2663
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 2590  CTTCTGCCTTACGGTTGCATCTCAACTGGTGACAAAATAGGAATGATCGAGATTGTAAAGGATGCCACAACGAT  2663

Query 2664  TGCCAAAATTCAGCAAAGCACAGTGGGCAACACGGGAGCATTTAAAGATGAAGTCCTGAATCACTGGCTCAAAG  2737
            .||..||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2664  CGCTCAAATTCAGCAAAGCACAGTGGGTAACACGGGGGCATTCAAAGATGAAGTCCTGAATCACTGGCTCAAGG  2737

Query 2738  AAAAATCCCCTACTGAAGAAAAGTTTCAGGCAGCAGTGGAGAGATTTGTTTATTCCTGTGCAGGCTACTGTGTG  2811
            ||||||..||||.||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2738  AAAAATGTCCTATTGAAGAAAAGTTTCAGGCCGCAGTGGAAAGGTTTGTTTACTCCTGTGCAGGCTACTGTGTG  2811

Query 2812  GCAACCTTTGTTCTTGGAATAGGCGACAGACACAATGACAATATTATGATCACCGAGACAGGAAACCTATTTCA  2885
            ||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  GCCACATTTGTTCTTGGGATCGGTGACAGGCACAACGACAACATTATGATCTCAGAGACAGGAAACCTATTTCA  2885

Query 2886  TATTGACTTCGGGCACATTCTTGGGAATTACAAAAGTTTCCTGGGCATTAATAAAGAGAGAGTGCCATTTGTGC  2959
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2886  TATAGACTTCGGACACATTCTTGGGAATTACAAGAGTTTCCTGGGCATCAATAAAGAGAGAGTGCCCTTCGTCC  2959

Query 2960  TAACCCCTGACTTCCTCTTTGTGATGGGAACTTCTGGAAAGAAGACAAGCCCACACTTCCAGAAATTTCAGGAC  3033
            |||||||.||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||   
Sbjct 2960  TAACCCCAGACTTCTTGTTTGTGATGGGATCTTCTGGAAAAAAGACAAGTCCACACTTCCAGAAATTCCAG---  3030

Query 3034  ATCTGTGTTAAGGCTTATCTAGCCCTTCGTCATC-----ACA-CAAACCTACTGATCATCCTGTTCTCCATGAT  3101
              |||         ||||||.|.|| ||.| |||     ||| ||..|||     |||.|||            
Sbjct 3031  --CTG---------TTATCTTGTCC-TCAT-ATCAAGGTACAGCACGCCT-----TCAGCCT------------  3074

Query 3102  GCTGATGACAGGAATGCCCCAGTTAACAAGCA-----AAGAAGACATTGAATATATCCGGGATGCC---CTCAC  3167
                   ||||    |.||.|||      |||     |||  ||||              ||.|||   |||| 
Sbjct 3075  -------ACAG----GTCCAAGT------GCATGTCCAAG--GACA--------------GAGGCCTGACTCA-  3114

Query 3168  AGTGGGGAAAAATG---AGGA----GGATGCTAAAAAGTATTTTCTTGATCAGATCGAAGTTTGCAGAGACAAA  3234
                   .||.|||   ||||    |||.|            ||||                            
Sbjct 3115  -------GAAGATGGCCAGGAACCTGGAGG------------TTCT----------------------------  3141

Query 3235  GGATGGACTGTGCAGTTTAATTGGTTTCTACATCTTGTTCTTGGCATCAAACAAGGAGAGAAACATACAGCC  3306
                                                                                    
Sbjct 3142  ------------------------------------------------------------------------  3141