Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480524
- Subject:
- NM_028027.3
- Aligned Length:
- 1858
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 440
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGCCCCCGGACCGCCCCACCCCTGGCCGCACTGACCGGATACTGGGGGTCATGGGTGGCATGCTGCGCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATGCGCCGTACCCGGGCAGGAGGGGCCCCCGGAGAGAGATCCCTTAGGGCCTGGGAGTACCAAGACAGAGAGTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATTGTATCGAGGAGGATCAGACAGGGCAGCGCGAACCTGAGGTCCTCGCCTGGGCTCCGCAGCCCGAATCCTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCTATTGCCGTCAGTGAGGGGAGCATGTCAGCGTCTGCTGTCTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTCTCCGATTCCCCCTGGACCAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATT 370
Query 1 ----------------------------------------------------ATGT-------------TGGAG 9
|||| |||||
Sbjct 371 CCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGAGAGTGGTCAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAG 444
Query 10 CCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAA 83
|||.||.||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.||.|||||||.||||||||.||
Sbjct 445 CCAACTTTAACCACAGGACAAGAGCTGCCCGAACTGACCTTACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAA 518
Query 84 GACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGG 157
|.|.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||..|||.||||||.||.||||||||||.||||||||
Sbjct 519 GGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAACTTTGTCCCAAGCTCCCAAGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGG 592
Query 158 AAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTG 231
||||||||||||.|||||||.||||.|||||.||||||||.|.||..||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 593 AAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTGAGCTGGTGGAAACAGAAAGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTA 666
Query 232 GAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGG 305
||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGGTTACATGGCTACCATGGCTACTCAGGGGGTACCTGAGAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGG 740
Query 306 GAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTG 379
|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.|
Sbjct 741 GAACATTCAGCAGATCTATGAGTGGCACCGAGACTACTTCCTGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCG 814
Query 380 ATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCC 453
|||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 815 ATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCAAACATGAGCGCCGACTGCATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCC 888
Query 454 AAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCT 527
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 889 AAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACT 962
Query 528 GCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCA 601
||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|
Sbjct 963 GCAGCTCAATGACCTCCTCATTAAACCAGTGCAGCGAATCATGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAA 1036
Query 602 AGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAG 675
|||||||||..||||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1037 AGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGGATACTGAAGAGCTGGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAG 1110
Query 676 CGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTT 749
||.|||||.|||||||||.|.|||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGATGCAATGATATGATGTCCCTGGGGAGACTTCGGGGATTTGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTT 1184
Query 750 GGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCG 823
||||||||||||.||||.|||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185 GGGCCAGGACACATTCTTGGTTACAGAGCCTGAAGCTGGGGGTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTG 1258
Query 824 TCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGA 897
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||...|||||||..|.||||||||.
Sbjct 1259 TCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAGGCCCTGGGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGC 1332
Query 898 TATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTT 971
||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||||.||
Sbjct 1333 TACGTGTACAAGAACAGCATCAAGGTGAGCTGCCTAGGGCTGGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTT 1406
Query 972 TGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTC 1045
|||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1407 TGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGAAGGTGGGATCCAGCGCTACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTC 1480
Query 1046 AGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATT 1119
|.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481 AAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCCAGATCCTGGAAAGCCAGCGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATT 1554
Query 1120 GAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAG 1193
||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||.|.||.|||||||||||.||
Sbjct 1555 GAATACCAGAGACGTGAGAGCCAGACCAATAGCCTGGGGCGACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAG 1628
Query 1194 AATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGT 1267
|||.||||.||||||.|.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|| |
Sbjct 1629 AATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCAGGCCAGCATGCACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-T 1701
Query 1268 C-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCC 1340
| .||||.||||||||||.||||||..||.|||||.|||||||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||
Sbjct 1702 CTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGAGTGCTGTTGCCCCTGGATACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCC 1775
Query 1341 CCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAG 1414
.||||||| ||||||.|..|||.|||...||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1776 TCATGACT---CTCCAGCCCTTCCCACTGTGAACACTCCTCCCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAG 1846
Query 1415 ATGAGCTG 1422
||||||||
Sbjct 1847 ATGAGCTG 1854
