Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480524
- Subject:
- XM_006513879.3
- Aligned Length:
- 1669
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 251
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGCCGTACCCGGGCAGGAGGGGAATCCTATTCTATTGCCGTCAGTGAGGGGAGCATGTCAGCGTCTGCTGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTCTCCGATTCCCCCTGGAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGAGAGTGGT 222
Query 1 -----------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTT 50
|||| ||||||||.||.||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 CAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAGCTGCCCGAACTGACCTT 296
Query 51 GCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTG 124
.|||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||..
Sbjct 297 ACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAACTTTGTCCCAAGCTCCCA 370
Query 125 AGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAG 198
|||.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 AGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTGAGCTGGTGGAAACAGAA 444
Query 199 AAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGA 272
|.||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct 445 AGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCTACTCAGGGGGTACCTGA 518
Query 273 GAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCT 346
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 519 GAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTGGCACCGAGACTACTTCC 592
Query 347 TGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTG 420
||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 593 TGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCAAACATGAGCGCCGACTG 666
Query 421 CATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTT 494
||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTT 740
Query 495 TGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCA 568
|||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 741 TGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAAACCAGTGCAGCGAATCA 814
Query 569 TGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAG 642
|||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct 815 TGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGGATACTGAAGAGCTGGAG 888
Query 643 CAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATT 716
||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||.|.||||||||
Sbjct 889 CAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTGGGGAGACTTCGGGGATT 962
Query 717 TGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAG 790
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 963 TGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTACAGAGCCTGAAGCTGGGG 1036
Query 791 GGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTG 864
|.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 GTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAGGCCCTG 1110
Query 865 GGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACT 938
||||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 GGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAGGTGAGCTGCCTAGGGCT 1184
Query 939 GGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCT 1012
|||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGAAGGTGGGATCCAGCGCT 1258
Query 1013 ATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAA 1086
|.||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||.
Sbjct 1259 ACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCCAGATCCTGGAAAGCCAG 1332
Query 1087 CGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCG 1160
||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 CGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAGACCAATAGCCTGGGGCG 1406
Query 1161 GCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACAC 1234
.|||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||.|||||..|||||||
Sbjct 1407 ACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCAGGCCAGCATGCACACAC 1480
Query 1235 CCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGA 1307
|||||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.||||||..||.|||||.|||||
Sbjct 1481 CCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGAGTGCTGTTGCCCCTGGA 1553
Query 1308 TAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTC 1381
||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.||||||| ||||||.|..|||.|||...||.||.||||
Sbjct 1554 TACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCCCACTGTGAACACTCCTC 1624
Query 1382 CCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1422
||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1665