Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480524
• Subject: XM_006513880.1
• Aligned Length: 1612
• Identities: 1235
• Gaps: 194

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCAGCGTCTGCTGTCTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCGATTCCCCCTGGACCAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAA  148

Query    1  ----------------------------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAG  33
                                        ||||             ||||||||.||.||.||||||||.|.|||
Sbjct  149  CTGAGGCAGAGAGTGGTCAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAG  222

Query   34  CTGCCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGAC  107
            |||||.|||||||||||.|||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.||
Sbjct  223  CTGCCCGAACTGACCTTACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAAC  296

Query  108  TTTGTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTG  181
            ||||||||||||.||..|||.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  297  TTTGTCCCAAGCTCCCAAGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTG  370

Query  182  AACTGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCT  255
            |.|||||.||||||||.|.||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  AGCTGGTGGAAACAGAAAGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCT  444

Query  256  GCTCAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTG  329
            .||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  ACTCAGGGGGTACCTGAGAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTG  518

Query  330  GCACCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCA  403
            ||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCACCGAGACTACTTCCTGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCA  592

Query  404  AACACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAG  477
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  AACATGAGCGCCGACTGCATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAG  666

Query  478  TTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAA  551
            ||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAA  740

Query  552  ACCTGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGG  625
            |||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.||
Sbjct  741  ACCAGTGCAGCGAATCATGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGG  814

Query  626  ATACTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTG  699
            ||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||
Sbjct  815  ATACTGAAGAGCTGGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTG  888

Query  700  GGGAGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCAC  773
            ||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||
Sbjct  889  GGGAGACTTCGGGGATTTGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTAC  962

Query  774  CGAGCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCA  847
            .||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  963  AGAGCCTGAAGCTGGGGGTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCA  1036

Query  848  TCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAG  921
            ||||||||||.||||||||||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  TCTTCAGTGAGGCCCTGGGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAG  1110

Query  922  GTGAGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGA  995
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GTGAGCTGCCTAGGGCTGGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGA  1184

Query  996  GGGTGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTC  1069
            .|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1185  AGGTGGGATCCAGCGCTACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCC  1258

Query 1070  AGATCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAG  1143
            |||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  AGATCCTGGAAAGCCAGCGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAG  1332

Query 1144  ACCAACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCA  1217
            |||||.|||||||||||.|||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||
Sbjct 1333  ACCAATAGCCTGGGGCGACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCA  1406

Query 1218  GGGCAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGA  1290
            ||.|||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1407  GGCCAGCATGCACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGA  1479

Query 1291  GCCCTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCC  1364
            |..||.|||||.|||||||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.|||||||   ||||||.|..|||
Sbjct 1480  GTGCTGTTGCCCCTGGATACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCC  1550

Query 1365  AACTCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1422
            .|||...||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  CACTGTGAACACTCCTCCCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1608