Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480524
- Subject:
- XM_006513881.2
- Aligned Length:
- 1612
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 194
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCAGCGTCTGCTGTCTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCGATTCCCCCTGGACCAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAA 148
Query 1 ----------------------------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAG 33
|||| ||||||||.||.||.||||||||.|.|||
Sbjct 149 CTGAGGCAGAGAGTGGTCAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAG 222
Query 34 CTGCCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGAC 107
|||||.|||||||||||.|||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.||
Sbjct 223 CTGCCCGAACTGACCTTACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAAC 296
Query 108 TTTGTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTG 181
||||||||||||.||..|||.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 297 TTTGTCCCAAGCTCCCAAGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTG 370
Query 182 AACTGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCT 255
|.|||||.||||||||.|.||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 AGCTGGTGGAAACAGAAAGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCT 444
Query 256 GCTCAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTG 329
.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 ACTCAGGGGGTACCTGAGAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTG 518
Query 330 GCACCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCA 403
||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCACCGAGACTACTTCCTGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCA 592
Query 404 AACACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAG 477
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 593 AACATGAGCGCCGACTGCATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAG 666
Query 478 TTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAA 551
||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 667 TTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAA 740
Query 552 ACCTGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGG 625
|||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.||
Sbjct 741 ACCAGTGCAGCGAATCATGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGG 814
Query 626 ATACTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTG 699
||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||
Sbjct 815 ATACTGAAGAGCTGGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTG 888
Query 700 GGGAGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCAC 773
||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||
Sbjct 889 GGGAGACTTCGGGGATTTGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTAC 962
Query 774 CGAGCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCA 847
.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 963 AGAGCCTGAAGCTGGGGGTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCA 1036
Query 848 TCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAG 921
||||||||||.||||||||||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 TCTTCAGTGAGGCCCTGGGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAG 1110
Query 922 GTGAGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGA 995
|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 GTGAGCTGCCTAGGGCTGGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGA 1184
Query 996 GGGTGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTC 1069
.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1185 AGGTGGGATCCAGCGCTACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCC 1258
Query 1070 AGATCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAG 1143
|||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 AGATCCTGGAAAGCCAGCGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAG 1332
Query 1144 ACCAACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCA 1217
|||||.|||||||||||.|||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||
Sbjct 1333 ACCAATAGCCTGGGGCGACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCA 1406
Query 1218 GGGCAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGA 1290
||.|||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1407 GGCCAGCATGCACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGA 1479
Query 1291 GCCCTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCC 1364
|..||.|||||.|||||||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.||||||| ||||||.|..|||
Sbjct 1480 GTGCTGTTGCCCCTGGATACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCC 1550
Query 1365 AACTCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1422
.|||...||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 CACTGTGAACACTCCTCCCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1608