Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480537
• Subject: NM_001005242.2
• Aligned Length: 2511
• Identities: 2511
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCAGCCCCCGGCGCCCCAGCTGAGTACGGCTACATCCGGACCGTCCTGGGCCAGCAGATCCTGGGACAACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCCCCCGGCGCCCCAGCTGAGTACGGCTACATCCGGACCGTCCTGGGCCAGCAGATCCTGGGACAACT  74

Query   75  GGACAGCTCCAGCCTGGCGCTGCCCTCCGAGGCCAAGCTGAAGCTGGCGGGGAGCAGCGGCCGCGGCGGCCAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACAGCTCCAGCCTGGCGCTGCCCTCCGAGGCCAAGCTGAAGCTGGCGGGGAGCAGCGGCCGCGGCGGCCAGA  148

Query  149  CAGTCAAGAGCCTGCGGATCCAGGAGCAGGTGCAGCAGACCCTCGCCCGGAAGGGCCGCAGCTCCGTGGGCAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTCAAGAGCCTGCGGATCCAGGAGCAGGTGCAGCAGACCCTCGCCCGGAAGGGCCGCAGCTCCGTGGGCAAC  222

Query  223  GGAAATCTTCACCGAACCAGCAGTGTTCCTGAGTATGTCTACAACCTACACTTGGTTGAAAATGATTTTGTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAAATCTTCACCGAACCAGCAGTGTTCCTGAGTATGTCTACAACCTACACTTGGTTGAAAATGATTTTGTTGG  296

Query  297  AGGCCGTTCCCCTGTTCCTAAAACCTATGACATGCTAAAGGCTGGCACAACTGCCACTTATGAAGGTCGCTGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCGTTCCCCTGTTCCTAAAACCTATGACATGCTAAAGGCTGGCACAACTGCCACTTATGAAGGTCGCTGGG  370

Query  371  GAAGAGGAACAGCACAGTACAGCTCCCAGAAGTCCGTGGAAGAAAGGTCCTTGAGGCATCCTCTGAGGAGACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGAGGAACAGCACAGTACAGCTCCCAGAAGTCCGTGGAAGAAAGGTCCTTGAGGCATCCTCTGAGGAGACTG  444

Query  445  GAGATTTCTCCTGACAGCAGCCCGGAGAGGGCTCACTACACGCACAGCGATTACCAGTACAGCCAGAGAAGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGATTTCTCCTGACAGCAGCCCGGAGAGGGCTCACTACACGCACAGCGATTACCAGTACAGCCAGAGAAGCCA  518

Query  519  GGCTGGGCACACCCTGCACCACCAAGAAAGCAGGCGGGCCGCCCTCCTAGTGCCACCGAGATATGCTCGTTCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTGGGCACACCCTGCACCACCAAGAAAGCAGGCGGGCCGCCCTCCTAGTGCCACCGAGATATGCTCGTTCCG  592

Query  593  AGATCGTGGGGGTCAGCCGTGCTGGCACCACAAGCAGGCAGCGCCACTTTGACACATACCACAGACAGTACCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATCGTGGGGGTCAGCCGTGCTGGCACCACAAGCAGGCAGCGCCACTTTGACACATACCACAGACAGTACCAG  666

Query  667  CATGGCTCTGTTAGCGACACCGTTTTTGACAGCATCCCTGCCAACCCGGCCCTGCTCACGTACCCCAGGCCAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGGCTCTGTTAGCGACACCGTTTTTGACAGCATCCCTGCCAACCCGGCCCTGCTCACGTACCCCAGGCCAGG  740

Query  741  GACCAGCCGCAGCATGGGCAACCTCTTGGAGAAGGAGAACTACCTGACGGCAGGGCTCACTGTCGGGCAGGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACCAGCCGCAGCATGGGCAACCTCTTGGAGAAGGAGAACTACCTGACGGCAGGGCTCACTGTCGGGCAGGTCA  814

Query  815  GGCCGCTGGTGCCCCTGCAGCCCGTCACTCAGAACAGGGCTTCCAGGTCCTCCTGGCATCAGAGCTCCTTCCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCCGCTGGTGCCCCTGCAGCCCGTCACTCAGAACAGGGCTTCCAGGTCCTCCTGGCATCAGAGCTCCTTCCAC  888

Query  889  AGCACCCGCACGCTGAGGGAAGCTGGGCCCAGTGTCGCCGTGGATTCCAGCGGGAGGAGAGCGCACTTGACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCACCCGCACGCTGAGGGAAGCTGGGCCCAGTGTCGCCGTGGATTCCAGCGGGAGGAGAGCGCACTTGACTGT  962

Query  963  CGGCCAGGCGGCCGCAGGGGGAAGTGGGAATCTGCTCACTGAGAGAAGCACTTTCACTGACTCCCAGCTGGGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGCCAGGCGGCCGCAGGGGGAAGTGGGAATCTGCTCACTGAGAGAAGCACTTTCACTGACTCCCAGCTGGGGA  1036

Query 1037  ATGCAGACATGGAGATGACTCTGGAGCGAGCAGTGAGTATGCTCGAGGCAGACCACATGCTGCCATCCAGGATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGCAGACATGGAGATGACTCTGGAGCGAGCAGTGAGTATGCTCGAGGCAGACCACATGCTGCCATCCAGGATT  1110

Query 1111  TCTGCTGCAGCTACTTTCATACAGCACGAGTGCTTCCAGAAATCTGAAGCTCGGAAGAGGGTTAACCAGCTTCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGCTGCAGCTACTTTCATACAGCACGAGTGCTTCCAGAAATCTGAAGCTCGGAAGAGGGTTAACCAGCTTCG  1184

Query 1185  TGGCATCCTCAAGCTTCTGCAGCTCCTAAAAGTTCAGAATGAAGACGTTCAGCGAGCTGTGTGTGGGGCCTTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCATCCTCAAGCTTCTGCAGCTCCTAAAAGTTCAGAATGAAGACGTTCAGCGAGCTGTGTGTGGGGCCTTGA  1258

Query 1259  GAAACTTAGTATTTGAAGACAATGACAACAAATTGGAGGTGGCTGAACTAAATGGGGTACCTCGGCTGCTCCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAAACTTAGTATTTGAAGACAATGACAACAAATTGGAGGTGGCTGAACTAAATGGGGTACCTCGGCTGCTCCAG  1332

Query 1333  GTGCTGAAGCAAACCAGAGACTTGGAGACTAAAAAACAAATAACAGGTTTGCTGTGGAATTTGTCATCTAATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCTGAAGCAAACCAGAGACTTGGAGACTAAAAAACAAATAACAGGTTTGCTGTGGAATTTGTCATCTAATGA  1406

Query 1407  CAAACTCAAGAATCTCATGATAACAGAAGCATTGCTTACGCTGACGGAGAATATCATCATCCCCTTTTCTGGGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAACTCAAGAATCTCATGATAACAGAAGCATTGCTTACGCTGACGGAGAATATCATCATCCCCTTTTCTGGGT  1480

Query 1481  GGCCTGAAGGAGACTACCCAAAAGCAAATGGTTTGCTCGATTTTGACATATTCTACAACGTCACTGGATGCCTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCCTGAAGGAGACTACCCAAAAGCAAATGGTTTGCTCGATTTTGACATATTCTACAACGTCACTGGATGCCTA  1554

Query 1555  AGAAACATGAGTTCTGCTGGCGCTGATGGGAGAAAAGCGATGAGAAGATGTGACGGACTCATTGACTCACTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGAAACATGAGTTCTGCTGGCGCTGATGGGAGAAAAGCGATGAGAAGATGTGACGGACTCATTGACTCACTGGT  1628

Query 1629  CCATTATGTCAGAGGAACCATTGCAGATTACCAGCCAGATGACAAGGCCACGGAGAATTGTGTGTGCATTCTTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCATTATGTCAGAGGAACCATTGCAGATTACCAGCCAGATGACAAGGCCACGGAGAATTGTGTGTGCATTCTTC  1702

Query 1703  ATAACCTCTCCTACCAGCTGGAGGCAGAGCTCCCAGAGAAATATTCCCAGAATATCTATATTCAAAACCGGAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATAACCTCTCCTACCAGCTGGAGGCAGAGCTCCCAGAGAAATATTCCCAGAATATCTATATTCAAAACCGGAAT  1776

Query 1777  ATCCAGACTGACAACAACAAAAGTATTGGATGTTTTGGCAGTCGAAGCAGGAAAGTAAAAGAGCAATACCAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCCAGACTGACAACAACAAAAGTATTGGATGTTTTGGCAGTCGAAGCAGGAAAGTAAAAGAGCAATACCAGGA  1850

Query 1851  CGTGCCGATGCCGGAGGAAAAGAGCAACCCCAAGGGCGTGGAGTGGCTGTGGCATTCCATTGTTATAAGGATGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGTGCCGATGCCGGAGGAAAAGAGCAACCCCAAGGGCGTGGAGTGGCTGTGGCATTCCATTGTTATAAGGATGT  1924

Query 1925  ATCTGTCCTTGATCGCCAAAAGTGTCCGCAACTACACACAAGAAGCATCCTTAGGAGCTCTGCAGAACCTCACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATCTGTCCTTGATCGCCAAAAGTGTCCGCAACTACACACAAGAAGCATCCTTAGGAGCTCTGCAGAACCTCACG  1998

Query 1999  GCCGGAAGTGGACCAATGCCGACATCAGTGGCTCAGACAGTTGTCCAGAAGGAAAGTGGCCTGCAGCACACCCG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCGGAAGTGGACCAATGCCGACATCAGTGGCTCAGACAGTTGTCCAGAAGGAAAGTGGCCTGCAGCACACCCG  2072

Query 2073  AAAGATGCTGCATGTTGGTGACCCAAGTGTGAAAAAGACAGCCATCTCGCTGCTGAGGAATCTGTCCCGGAATC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAAGATGCTGCATGTTGGTGACCCAAGTGTGAAAAAGACAGCCATCTCGCTGCTGAGGAATCTGTCCCGGAATC  2146

Query 2147  TTTCTCTGCAGAATGAAATTGCCAAAGAAACTCTCCCTGATTTGGTTTCCATCATTCCTGACACAGTCCCGAGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTTCTCTGCAGAATGAAATTGCCAAAGAAACTCTCCCTGATTTGGTTTCCATCATTCCTGACACAGTCCCGAGT  2220

Query 2221  ACTGACCTTCTCATTGAAACTACAGCCTCTGCCTGTTACACATTGAACAACATAATCCAAAACAGTTACCAGAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACTGACCTTCTCATTGAAACTACAGCCTCTGCCTGTTACACATTGAACAACATAATCCAAAACAGTTACCAGAA  2294

Query 2295  TGCACGCGACCTTCTAAACACCGGGGGCATCCAGAAAATTATGGCCATTAGTGCAGGCGATGCCTATGCCTCCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCACGCGACCTTCTAAACACCGGGGGCATCCAGAAAATTATGGCCATTAGTGCAGGCGATGCCTATGCCTCCA  2368

Query 2369  ACAAAGCAAGTAAAGCTGCTTCCGTCCTTCTGTATTCTCTGTGGGCACACACGGAACTGCATCATGCCTACAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACAAAGCAAGTAAAGCTGCTTCCGTCCTTCTGTATTCTCTGTGGGCACACACGGAACTGCATCATGCCTACAAG  2442

Query 2443  AAGGCTCAGTTTAAGAAGACAGATTTTGTCAACAGCCGGACTGCCAAAGCCTACCACTCCCTTAAAGAC  2511
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAGGCTCAGTTTAAGAAGACAGATTTTGTCAACAGCCGGACTGCCAAAGCCTACCACTCCCTTAAAGAC  2511