Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480583
• Subject: XM_011516398.1
• Aligned Length: 1254
• Identities: 1168
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGAGCATCGAGATCCCGGCGGGACTGACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCATCGAGATCCCGGCGGGACTGACGGAGCTGCTGCAGGGCTTCACGGTGGAGGTGCTGAGGCACCAGCC  74

Query   75  CGCGGACCTGCTGGAGTTCGCTCTGCAGCACTTCACCCGCCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAAGGCACCGCGC  148
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCGGACCTGCTGGAGTTCGCGCTGCAGCACTTCACCCGCCTGCAGCAGGAGAACGAGCGCAAAGGCACCGCGC  148

Query  149  GCTTCTGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACCTGGGCGCCGCTGCCGGGGGCGGCACCCCCAGCAAGGGGGTC  222
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCGGCCATGAGGGCAGGACCTGGGGGGACCTGGGCGCCGCTGCCGGGGGCGGCACCCCCAGCAAGGGGGTC  222

Query  223  AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCAGTCCGACTCCGAGGACGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCCGCGGACGCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTTCGCCGAGGAGCCCATGCAGTCCGACTCCGAGGACGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCCGCGGACGCAGG  296

Query  297  GGCGTTCAATGCTCCAGTAATAAACCGATTCACAAGGCGTGCCTCAGTATGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCGTTCAATGCTCCAGTAATAAACCGATTCACAAGGCGTGCCTCAGTATGTGCAGAAGCTTATAATCCTGATG  370

Query  371  AAGAAGAAGATGATGCAGAGTCCAGGATTATACATCCAAAAACTGATGATCAAAGAAATAGGTTGCAAGAGGCT  444
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  371  AAGAAGAAGATGATGCAGAGTCCAG-------------------------------------------------  395

Query  445  TGCAAAGACATCCTGCTGTTTAAGAATCTGGATCCGGAGCAGATGTCTCAAGTATTAGATGCCATGTTTGAAAA  518
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  -----------------------------------GGAGCAGATGTCTCAAGTATTAGATGCCATGTTTGAAAA  434

Query  519  ATTGGTCAAAGATGGGGAGCATGTAATTGATCAAGGTGACGATGGTGACAACTTTTATGTAATTGATAGAGGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  ATTGGTCAAAGATGGGGAGCATGTAATTGATCAAGGTGACGATGGTGACAACTTTTATGTAATTGATAGAGGCA  508

Query  593  CATTTGATATTTATGTGAAATGTGATGGTGTTGGAAGATGTGTTGGTAACTATGATAATCGTGGGAGTTTCGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  CATTTGATATTTATGTGAAATGTGATGGTGTTGGAAGATGTGTTGGTAACTATGATAATCGTGGGAGTTTCGGC  582

Query  667  GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  GAACTGGCCTTAATGTACAATACACCCAGAGCAGCTACAATCACTGCTACCTCTCCTGGTGCTCTGTGGGGTTT  656

Query  741  GGACAGGGTAACCTTCAGGAGAATAATTGTGAAAAACAATGCCAAAAAGAGAAAAATGTATGAAAGCTTTATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GGACAGGGTAACCTTCAGGAGAATAATTGTGAAAAACAATGCCAAAAAGAGAAAAATGTATGAAAGCTTTATTG  730

Query  815  AGTCACTGCCATTCCTTAAATCTTTGGAGTTTTCTGAACGCCTGAAAGTAGTAGATGTGATAGGCACCAAAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  AGTCACTGCCATTCCTTAAATCTTTGGAGTTTTCTGAACGCCTGAAAGTAGTAGATGTGATAGGCACCAAAGTA  804

Query  889  TACAACGATGGAGAACAAATCATTGCTCAGGGAGATTCGGCTGATTCTTTTTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  TACAACGATGGAGAACAAATCATTGCTCAGGGAGATTCGGCTGATTCTTTTTTCATTGTAGAATCTGGAGAAGT  878

Query  963  GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTGGAAGAGAATGGTGCAGTAGAAATCGCTCGATGCTCGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GAAAATTACTATGAAAAGAAAGGGTAAATCAGAAGTGGAAGAGAATGGTGCAGTAGAAATCGCTCGATGCTCGC  952

Query 1037  GGGGACAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTAACTAACAAACCTCGAGCAGCTTCTGCCCACGCCATTGGGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  GGGGACAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTAACTAACAAACCTCGAGCAGCTTCTGCCCACGCCATTGGGACT  1026

Query 1111  GTCAAATGTTTAGCAATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTCTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAAAGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  GTCAAATGTTTAGCAATGGATGTGCAAGCATTTGAAAGGCTTCTGGGACCTTGCATGGAAATTATGAAAAGGAA  1100

Query 1185  CATCGCTACCTATGAAGAACAGTTAGTTGCCCTGTTTGGAACGAACATGGATATTGTTGAACCCACTGCA  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CATCGCTACCTATGAAGAACAGTTAGTTGCCCTGTTTGGAACGAACATGGATATTGTTGAACCCACTGCA  1170