Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480628
• Subject: XM_011517570.2
• Aligned Length: 1311
• Identities: 866
• Gaps: 444

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTCTCGGGAAGCGCAGGGGCCAGGCAGCTGCTTTCCTGCCTCTTTGCTGGCTCTTTTTGAAGATTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAACCGGGGCACAGCCACCTTTATAACAACCGCTATGCTGGTGATAAAGTGATAAGATTTATTCCCAAAACAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGAGGAAGCATATGCACTGAAGAAAATATCCTATCAACTTAAGGTGGACCTGTGGCAGCCCAGCAGTATCTCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TATGTATCAGAGGGAACAGTTACTGATGTCCATATCCCCCAAAATGGTTCCCGAGCCCTGTTAGCCTTCTTACA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAAGCCAACATCCAGTACAAGGTCCTCATAGAAGATCTTCAGAAAACACTGGAGAAGGGAAGCAGCTTGCACA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCAGAGAAACCGAAGATCCCTCTCTGGATATAATTATGAAGTTTATCACTCCTTAGAAGAAATTCAAAATTGG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATGCATCATCTGAATAAAACTCACTCAGGCCTCATTCACATGTTCTCTATTGGAAGATCATATGAGGGAAGATG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGCATCATCTGAATAAAACTCACTCAGGCCTCATTCACATGTTCTCTATTGGAAGATCATATGAGGGAAGATC  74

Query  519  TCTTTTTATTTTAAAGCTGGGCAGACGATCACGACTCAAAAGAGCTGTTTGGATAGACTGTGGTATTCATGCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTTTTATTTTAAAGCTGGGCAGACGATCACGACTCAAAAGAGCTGTTTGGATAGACTGTGGTATTCATGCAA  148

Query  593  GAGAATGGATTGGTCCTGCCTTTTGTCAGTGGTTTGTAAAAGAAGCTCTTCTAACATATAAGAGTGACCCAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGAATGGATTGGTCCTGCCTTTTGTCAGTGGTTTGTAAAAGAAGCTCTTCTAACATATAAGAGTGACCCAGCC  222

Query  667  ATGAGAAAAATGTTGAATCATCTATATTTCTATATCATGCCTGTGTTTAACGTCGATGGATACCATTTTAGTTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGAGAAAAATGTTGAATCATCTATATTTCTATATCATGCCTGTGTTTAACGTCGATGGATACCATTTTAGTTG  296

Query  741  GACCAATGATCGATTTTGGAGAAAAACAAGGTCAAGGAACTCAAGGTTTCGCTGCCGTGGAGTGGATGCCAATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCAATGATCGATTTTGGAGAAAAACAAGGTCAAGGAACTCAAGGTTTCGCTGCCGTGGAGTGGATGCCAATA  370

Query  815  GAAACTGGAAAGTGAAGTGGTGTGATGAAGGAGCTTCTATGCACCCTTGTGATGACACATACTGTGGCCCTTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAACTGGAAAGTGAAGTGGTGTGATGAAGGAGCTTCTATGCACCCTTGTGATGACACATACTGTGGCCCTTTT  444

Query  889  CCAGAATCTGAGCCGGAAGTGAAGGCTGTAGCTAACTTCCTTCGAAAACACAGAAAGCACATTAGGGCTTATCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGAATCTGAGCCGGAAGTGAAGGCTGTAGCTAACTTCCTTCGAAAACACAGAAAGCACATTAGGGCTTATCT  518

Query  963  CTCCTTTCATGCATATGCTCAGATGTTACTGTATCCCTATTCTTACAAATATGCAACAATTCCCAATTTTAGAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCCTTTCATGCATATGCTCAGATGTTACTGTATCCCTATTCTTACAAATATGCAACAATTCCCAATTTTAGAT  592

Query 1037  GTGTGGAATCTGCAGCTTATAAAGCTGTGAATGCACTTCAGTCAGTATACGGGGTACGATACAGATATGGACCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGGAATCTGCAGCTTATAAAGCTGTGAATGCACTTCAGTCAGTATACGGGGTACGATACAGATATGGACCA  666

Query 1111  GCCTCCACAACGTTGTATGTGAGCTCTGGTAGCTCAATGGATTGGGCCTACAAAAATGGAATACCTTATGCATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTCCACAACGTTGTATGTGAGCTCTGGTAGCTCAATGGATTGGGCCTACAAAAATGGAATACCTTATGCATT  740

Query 1185  TGCTTTCGAACTACGTGACACTGGATATTTTGGATTTTTACTCCCAGAGATGCTCATCAAACCCACCTGTACAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTTTCGAACTACGTGACACTGGATATTTTGGATTTTTACTCCCAGAGATGCTCATCAAACCCACCTGTACAG  814

Query 1259  AAACTATGCTGGCTGTGAAAAATATCACAATGCACCTGCTAAAGAAATGTCCC  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAACTATGCTGGCTGTGAAAAATATCACAATGCACCTGCTAAAGAAATGTCCC  867