Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480645
• Subject: NM_001038613.1
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1247
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGCCAGGTCGTTGGAGGTGGCAGCGAGACATGCACCCGGCCCGGAAGCTCCTCAGCCTCCTCTTCCTCATCCT  74
                                          |||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|..|
Sbjct    1  ------------------------------ATGCAACCGGCCCGGAAGCTCCTCAGCCTCCTGGTCCTCCTGGT  44

Query   75  GATGGGCACTGAACTCACTCAAGTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCAGG  148
            |||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  GATGGGCACCGAACTCACCCAAGTGTTGCCCACCAACCCCGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCAGG  118

Query  149  ACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCACAGCAGACCATGTGTTCACGGGATGCCCGCACAAAA  222
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  119  ACAGTGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCCCAGCAGACCATGTGTTCGCGGGATGCCCGCACAAAA  192

Query  223  CAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTTGGACAGGCGGACCCAGAG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  193  CAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAAAACATGTCTCAATCCATAGAAGTCTTGGACAGGCGAACTCAGAG  266

Query  297  AGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGTTCAAACAGGTGGAGGAGA  370
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  267  AGACCTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAGATGAAAGGCCTGGAGACCAAGTTCAAGCAGGTGGAGGAGA  340

Query  371  GTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATACCT  444
            |.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  341  GCCATAAGCAGCATCTAGCCAGGCAGTTCAAGGCAATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATTCCT  414

Query  445  GTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCAGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAGGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCAGT  488

Query  519  GCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGAAG  592
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  GCTTAACGAACTGCAAGAGGAGATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGAAG  562

Query  593  AAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGTGACCCCGTGACTGTCAAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  563  AAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCCTGCGGGAAGCTGACAGGCATAAGTGACCCAGTGACTGTCAAG  636

Query  667  ACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGATAACCGGGTGTGGTACAT  740
            |||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  637  ACCTCTGGCTCAAGGTTCGGGTCCTGGATGACAGACCCGCTGGCCCCAGAAGGCGATAACCGGGTCTGGTACAT  710

Query  741  GGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCATGAACACGGACAATTTCA  814
            |||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  711  GGATGGTTATCACAACAACCGCTTCGTCCGTGAGTACAAGTCCATGGTGGACTTCATGAACACGGACAACTTTA  784

Query  815  CCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGTTCTATCTACTTCAACAAG  888
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  785  CCTCTCACCGTCTCCCACACCCCTGGTCAGGTACGGGCCAGGTGGTCTACAATGGCTCCATCTATTTCAACAAA  858

Query  889  TTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGACCCGCAGCCTGGACTATGC  962
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  859  TTCCAGAGTCACATTATCATTAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACGATTCTGAAGACGCGCAGCCTGGACTATGC  932

Query  963  CGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAGCGGGC  1036
            .||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  933  TGGCTACAACAATATGTATCACTATGCCTGGGGCGGCCACTCAGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAATGGGC  1006

Query 1037  TGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTGGACCCCGTGTCCCTGCAG  1110
            |.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||..||||.|.||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 1007  TCTGGGCTGTCTATGCCACAAACCAGAACGCAGGCAACATTGTCATCAGCAAGCTGGATCCTGTCTCACTGCAG  1080

Query 1111  ACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACGCTGTA  1184
            |.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1081  ATCCTCCAGACCTGGAACACCAGCTACCCCAAGCGCAGTGCCGGTGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACCCTCTA  1154

Query 1185  CGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATGCCTCCACCTATGAATACA  1258
            .|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1155  TGTCACCAACGGTTACTCGGGGGGCACCAAGGTCCACTATGCCTACCAAACCAACGCCTCGACCTACGAGTACA  1228

Query 1259  TCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCCAAGGACCGGGCCCTGTAT  1332
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1229  TTGACATCCCCTTCCAGAACAAATACTCTCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCTAAAGACCGCGCGCTGTAC  1302

Query 1333  GCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCGCTCCGACGAGTTG  1401
            |||||||||||.|||||.||||.||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1303  GCCTGGAACAATGGCCATCAGACCCTCTATAATGTCACCCTCTTCCATGTCATCCGCTCCGATGAGTTG  1371