Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480645
• Subject: NM_001282611.2
• Aligned Length: 1477
• Identities: 1366
• Gaps: 98

Alignment

Query    1  ------------ATGC-CA-------GGTCGTTGGAGGTG-GCAGCGA--GACATG--CAC---CCGG----CC  42
                        .||| ||       ||||||    |.|| ||| |.|  |.||||  |||   |.||    ||
Sbjct    1  ATGTCGGTGCCGCTGCTCAAGATCGGGGTCGT----GCTGAGCA-CCATGGCCATGATCACTAACTGGATGTCC  69

Query   43  CGGAAGCTCCTCAGCCTCCTCTTCCTCATCCTGATGGGCACTGAAC-TCACTCAA-------------------  96
            |.||.|||.|    ||||           .|||.||||| ||.||| .||| |||                   
Sbjct   70  CAGACGCTGC----CCTC-----------GCTGGTGGGC-CTCAACACCAC-CAAGCTCTCGGCGGCCGGCGGC  126

Query   97  ------------------------GTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCA  146
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  GGGACGCTGGACCGCAGCACCGGCGTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCA  200

Query  147  GGACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCACAGCAGACCATGTGTTCACGGGATGCCCGCACAA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  GGACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCTCCACAGCAGACCATGTGTTCACGGGATGCCCGCACAA  274

Query  221  AACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTTGGACAGGCGGACCCAG  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  AACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTTGGACAGGCGGACCCAG  348

Query  295  AGAGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGTTCAAACAGGTGGAGGA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  AGAGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGTTCAAACAGGTGGAGGA  422

Query  369  GAGTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATAC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GAGTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATAC  496

Query  443  CTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCA  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  CTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCA  570

Query  517  GTGCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGA  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GTGCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGA  644

Query  591  AGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGTGACCCCGTGACTGTCA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  AGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGTGACCCCGTGACTGTCA  718

Query  665  AGACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGATAACCGGGTGTGGTAC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AGACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGATAACCGGGTGTGGTAC  792

Query  739  ATGGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCATGAACACGGACAATTT  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  ATGGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCATGAACACGGACAATTT  866

Query  813  CACCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGTTCTATCTACTTCAACA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CACCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGTTCTATCTACTTCAACA  940

Query  887  AGTTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGACCCGCAGCCTGGACTAT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  AGTTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGACCCGCAGCCTGGACTAT  1014

Query  961  GCCGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAGCGG  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  GCCGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAGCGG  1088

Query 1035  GCTGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTGGACCCCGTGTCCCTGC  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GCTGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTGGACCCCGTGTCCCTGC  1162

Query 1109  AGACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACGCTG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AGACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACGCTG  1236

Query 1183  TACGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATGCCTCCACCTATGAATA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  TACGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATGCCTCCACCTATGAATA  1310

Query 1257  CATCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCCAAGGACCGGGCCCTGT  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CATCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCCAAGGACCGGGCCCTGT  1384

Query 1331  ATGCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCGCTCCGACGAGTTG  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  ATGCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCGCTCCGACGAGTTG  1455