Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480645
- Subject:
- NM_019498.2
- Aligned Length:
- 1493
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATG--CCAG-- 7
||| ||||
Sbjct 1 ATGTCGGTGCCGCTGCTGAAGATCGGGGTCGTGCTAAGCACCATGGCCATGATCACCAACTGGATGTCCCAGAC 74
Query 8 ------GTCGTTGGAGGTGGCAGCGAGACATGCACCCGGC----------------CCGGAAGCT---CCTCAG 56
.|||.|||.| |||..|.|.|| |||||||| |.|||.||| ||.|||
Sbjct 75 GCTGCCCTCGCTGGTG--GGCCTCAATAC---CACCCGGCTTTCGGCCGCCAGCGGCGGGACGCTGGACCGCAG 143
Query 57 CCTCCTCTTCCTCATCCTGATGGGCACTGAACTCACTCAAGTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGG 130
| |..||| |||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 144 C------------------ACCGGC---------------GTGTTGCCCACCAACCCCGAGGAGAGCTGGCAGG 184
Query 131 TGTACAGCTCTGCCCAGGACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCACAGCAGACCATGTGTTCA 204
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 185 TGTACAGCTCTGCCCAGGACAGTGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCCCAGCAGACCATGTGTTCG 258
Query 205 CGGGATGCCCGCACAAAACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTT 278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 259 CGGGATGCCCGCACAAAACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAAAACATGTCTCAATCCATAGAAGTCTT 332
Query 279 GGACAGGCGGACCCAGAGAGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGT 352
|||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 333 GGACAGGCGAACTCAGAGAGACCTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAGATGAAAGGCCTGGAGACCAAGT 406
Query 353 TCAAACAGGTGGAGGAGAGTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAA 426
||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 407 TCAAGCAGGTGGAGGAGAGCCATAAGCAGCATCTAGCCAGGCAGTTCAAGGCAATAAAAGCGAAAATGGATGAA 480
Query 427 CTTAGGCCTTTGATACCTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGT 500
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 481 CTTAGGCCTTTGATTCCTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAGGAGGAGGT 554
Query 501 CCAGAATCTGACGTCAGTGCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCA 574
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 CCAGAATCTGACGTCAGTGCTTAACGAACTGCAAGAGGAGATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCA 628
Query 575 GAGTGTCCAATCTTGAAGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGT 648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||
Sbjct 629 GAGTGTCCAATCTTGAAGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCCTGCGGGAAGCTGACAGGCATAAGT 702
Query 649 GACCCCGTGACTGTCAAGACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGA 722
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 703 GACCCAGTGACTGTCAAGACCTCTGGCTCAAGGTTCGGGTCCTGGATGACAGACCCGCTGGCCCCAGAAGGCGA 776
Query 723 TAACCGGGTGTGGTACATGGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCA 796
|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 777 TAACCGGGTCTGGTACATGGATGGTTATCACAACAACCGCTTCGTCCGTGAGTACAAGTCCATGGTGGACTTCA 850
Query 797 TGAACACGGACAATTTCACCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGT 870
|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 851 TGAACACGGACAACTTTACCTCTCACCGTCTCCCACACCCCTGGTCAGGTACGGGCCAGGTGGTCTACAATGGC 924
Query 871 TCTATCTACTTCAACAAGTTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGAC 944
||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 925 TCCATCTATTTCAACAAATTCCAGAGTCACATTATCATTAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACGATTCTGAAGAC 998
Query 945 CCGCAGCCTGGACTATGCCGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCA 1018
.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 999 GCGCAGCCTGGACTATGCTGGCTACAACAATATGTATCACTATGCCTGGGGCGGCCACTCAGACATCGACCTCA 1072
Query 1019 TGGTGGACGAGAGCGGGCTGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTG 1092
||||||||||||..|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||..||||.|.||||
Sbjct 1073 TGGTGGACGAGAATGGGCTCTGGGCTGTCTATGCCACAAACCAGAACGCAGGCAACATTGTCATCAGCAAGCTG 1146
Query 1093 GACCCCGTGTCCCTGCAGACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCAT 1166
||.||.||.||.|||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1147 GATCCTGTCTCACTGCAGATCCTCCAGACCTGGAACACCAGCTACCCCAAGCGCAGTGCCGGTGAGGCCTTCAT 1220
Query 1167 CATCTGCGGCACGCTGTACGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATG 1240
||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1221 CATCTGCGGCACCCTCTATGTCACCAACGGTTACTCGGGGGGCACCAAGGTCCACTATGCCTACCAAACCAACG 1294
Query 1241 CCTCCACCTATGAATACATCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCC 1314
||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1295 CCTCGACCTACGAGTACATTGACATCCCCTTCCAGAACAAATACTCTCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCT 1368
Query 1315 AAGGACCGGGCCCTGTATGCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCG 1388
||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1369 AAAGACCGCGCGCTGTACGCCTGGAACAATGGCCATCAGACCCTCTATAATGTCACCCTCTTCCATGTCATCCG 1442
Query 1389 CTCCGACGAGTTG 1401
||||||.||||||
Sbjct 1443 CTCCGATGAGTTG 1455