Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480671
• Subject: NM_139118.2
• Aligned Length: 2448
• Identities: 2190
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGAGGAGGCGAGCCGCAGCGCCGCGGCGACGAACCCAGGGAGTCGGCTTACCCGCTGGCCGCCTCCTGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAAGCGGGAGGGATCCGCGGTGGACCCAGGGAAGCGGAGGAGCCTGGCGGCCACCCCCTCTTCCTCACTTCCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTC  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTACTCTCATCGCTCTCGGCCTCCGACACGAAAAGGAAGCAAATGAGCTGATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTC  222

Query   25  CAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGC  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGAGGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGC  296

Query   99  TAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAG  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACCTACTAAATGAACAACATCAGATAG  370

Query  173  CGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAA  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAGCAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAA  444

Query  247  CCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCA  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAGGAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCA  518

Query  321  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACCCCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTA  592

Query  395  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATCGCCCTTCACCATCAGTACAACCCC  666

Query  469  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCTGATTGAAGACTTCAGCACACATGT  740

Query  543  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAATTTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGG  814

Query  617  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCAGTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAAT  888

Query  691  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTTAGGACTGAAGCATTTTGAAGGGAC  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  889  CCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAA------------------------------------  926

Query  765  TGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  838
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  ------------------------CAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTGCCCGCCAACTGACAGTGAGAATCA  976

Query  839  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  AGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAGAAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTA  1050

Query  913  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  GGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGAGAGAGAAGAACACCGGCTCCCATT  1124

Query  987  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  CTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGGCTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAA  1198

Query 1061  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  ATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGACAACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACT  1272

Query 1135  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  CGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGTTGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGC  1346

Query 1209  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347  TTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCAGCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCA  1420

Query 1283  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421  ACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGCAAAATGGTGCTCCGGATTCCTCAC  1494

Query 1357  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495  CCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACTGGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTT  1568

Query 1431  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569  TGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCTTCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTT  1642

Query 1505  TGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643  TGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCTTCCATGTTTCGAAAGCCATATGTG  1716

Query 1579  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717  AGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAAACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGC  1790

Query 1653  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791  ATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTGGCGGTGGCTGTAACATGATCCAGC  1864

Query 1727  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865  CTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACCCTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTC  1938

Query 1801  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939  CCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAATTGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCT  2012

Query 1875  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013  TCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTGCTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAA  2086

Query 1949  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087  ATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCTCTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAA  2160

Query 2023  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  2096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161  GTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGGATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCG  2234

Query 2097  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  2170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235  CTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCCCTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAA  2308

Query 2171  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  2244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309  ACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAAGATGCTACAGAGGAAATCAGTGGA  2382

Query 2245  TTTCTT  2250
            ||||||
Sbjct 2383  TTTCTT  2388