Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480673
• Subject: XM_005274326.3
• Aligned Length: 1980
• Identities: 1830
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74

Query   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148

Query  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222

Query  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296

Query  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370

Query  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444

Query  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518

Query  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592

Query  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666

Query  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740

Query  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814

Query  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888

Query  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962

Query  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036

Query 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110

Query 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184

Query 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGA-  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258

Query 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257
                                                                                      
Sbjct 1259  ATCCTTTCTCTGCTACTGTAGATGCTGTTGATGATGCCATTCCAAGCTTAAATCCTTTCCTCACAAAAAGTAGT  1332

Query 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257
                                                                                      
Sbjct 1333  GGTGATGTTCACCTTTCCATTTCTTCAGATGTATCTACTTTTACTACTAGGACACCTACTCATGAAATGTTTGT  1406

Query 1258  -GGATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTG  1330
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTG  1480

Query 1331  GAAATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAAATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTG  1554

Query 1405  GCCTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATC  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATC  1628

Query 1479  TTTAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAG  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAG  1702

Query 1553  GTGAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACA  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACA  1776

Query 1627  ATGAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGAT  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGAT  1850

Query 1701  AGGATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTG  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTG  1924

Query 1775  TCATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGATACAGTTTATG  1830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGATACAGTTTATG  1980