Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480675
• Subject: XM_006512540.3
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1338
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            |||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCA--------------------------------------------  696
            |||||||||||.||.|||||.|||||||||                                            
Sbjct  667  ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAGAGCCGCAGGTCTCTGCTGCCGCCTAGTAGTTCCCTGTCA  740

Query  697  --------------------------------------------------------------------------  696
                                                                                      
Sbjct  741  CAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATCCCTCGAGAATCCCTGC  814

Query  697  -----------------------------------------------GGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTA  723
                                                           |||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGTTGATCAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTTGGGGAAGTATGGATGGGTACCTGGAATGGAAATACAAAAGTA  888

Query  724  GCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCT  797
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCATAAAGACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGATCATGAAGAAGCT  962

Query  798  GAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGA  871
            ||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  GAAGCATGACAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGA  1036

Query  872  ACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATG  945
            .||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCAAAGGAAGTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGAAGTTGCCAAACCTTGTGGACATG  1110

Query  946  GCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1019
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGGCACAGGTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCACAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1184

Query 1020  CATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGT  1093
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185  CATTCTAGTGGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGCTCGGTTGATTGAAGACAATGAAT  1258

Query 1094  ACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACA  1167
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  ACACAGCAAGACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAGCGGCCCTGTATGGAAGGTTCACA  1332

Query 1168  ATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1241
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAAGTCTGACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1406

Query 1242  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCT  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCCCTGCCCACAGGACTGCCCGATCT  1480

Query 1316  CTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGC  1389
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||.||
Sbjct 1481  CCCTGCACGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCCCGACCTTCGAGTACTTGCAGGGC  1554

Query 1390  TTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACCTG  1446
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1555  TTCCTGGAGGACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAAAACCTG  1611