Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480685
• Subject: XM_011510070.2
• Aligned Length: 2405
• Identities: 2086
• Gaps: 304

Alignment

Query    1  ATGGGCAGTGCAGCAGACGTGCGGTTCTCCCTGGGCACAACCACACACGCACCCCCAGGCGTGCATCGCCGCTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGTGCAGCAGACGTGCGGTTCTCCCTGGGCACAACCACACACGCACCCCCAGGCGTGCATCGCCGCTA  74

Query   75  CTCGGCATTGAGGGAAGAGTCTGCCAAGGACTGGGAGACTTCTCCACTGCCTGGGATGCTGGCCCCGGCAGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCGGCATTGAGGGAAGAGTCTGCCAAGGACTGGGAGACTTCTCCACTGCCTGGGATGCTGGCCCCGGCAGCTG  148

Query  149  GCCCTGCCTTTGACAGTGACCCTGAGATCTCCGACGTGGATGAGGATGAGCCAGGGGGTCTGGTGGGCTCTGCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCTGCCTTTGACAGTGACCCTGAGATCTCCGACGTGGATGAGGATGAGCCAGGGGGTCTGGTGGGCTCTGCG  222

Query  223  GATGTTGTCTCCCCCAGCGGCCACTCAGATGCCCAGACCCTGGCCATGATGCTGCAGGAGCAGCTGGATGCCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGTTGTCTCCCCCAGCGGCCACTCAGATGCCCAGACCCTGGCCATGATGCTGCAGGAGCAGCTGGATGCCAT  296

Query  297  CAATGAGGAAATCAGGATGATTCAGGAAGAGAAGGAGTCCACGGAGCTCCGCGCGGAGGAGATTGAGACGCGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATGAGGAAATCAGGATGATTCAGGAAGAGAAGGAGTCCACGGAGCTCCGCGCGGAGGAGATTGAGACGCGTG  370

Query  371  TAACCAGTGGCAGCATGGAAGCCCTAAACCTGAAGCAGCTGCGCAAGCGTGGTTCCATCCCCACCTCTCTGACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAACCAGTGGCAGCATGGAAGCCCTAAACCTGAAGCAGCTGCGCAAGCGTGGTTCCATCCCCACCTCTCTGACG  444

Query  445  GCCCTGTCCCTGGCCAGCGCGTCCCCACCACTCAGCGGCCGCTCCACACCTAAGCTCACCTCCCGCAGTGCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTGTCCCTGGCCAGCGCGTCCCCACCACTCAGCGGCCGCTCCACACCTAAGCTCACCTCCCGCAGTGCTGC  518

Query  519  CCAGGACCTGGACCGAATGGGGGTCATGACCCTGCCCAGTGACTTAAGAAAGCATAGGAGGAAGCTGCTGTCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGGACCTGGACCGAATGGGGGTCATGACCCTGCCCAGTGACTTAAGAAAGCATAGGAGGAAGCTGCTGTCGC  592

Query  593  CAGTGTCTCGGGAAGAGAACCGAGAGGATAAAGCCACCATAAAATGTGAGACTTCTCCTCCTTCCTCACCCAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTGTCTCGGGAAGAGAACCGAGAGGATAAAGCCACCATAAAATGTGAGACTTCTCCTCCTTCCTCACCCAGG  666

Query  667  ACGCTGCGGCTAGAGAAGCTTGGCCACCCAGCCCTGAGCCAGGAAGAAGGCAAGAGTGCCTTGGAGGATCAGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGCTGCGGCTAGAGAAGCTTGGCCACCCAGCCCTGAGCCAGGAAGAAGGCAAGAGTGCCTTGGAGGATCAGGG  740

Query  741  CAGCAACCCCAGCAGCAGCAACAGCAGCCAGGACTCCCTGCACAAGGGCGCCAAGCGAAAGGGCATCAAGTCGT  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCAACCCCAGCAGCAGCAACAGCAGCCAGGACTCCCTGCACAAGGGCGCCAAGCGCAAGGGCATCAAGTCGT  814

Query  815  CCATTGGCCGCCTGTTTGGGAAGAAGGAGAAGGGCAGGCTGATCCAGCTGAGTCGGGATGGAGCCACAGGCCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATTGGCCGCCTGTTTGGGAAGAAGGAGAAGGGCAGGCTGATCCAGCTGAGTCGGGATGGAGCCACAGGCCAT  888

Query  889  GTTCTGCTAACAGACTCCGAATTCAGTATGCAGGAGCCTATGGTGCCTGCCAAGCTGGGGACCCAGGCAGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTCTGCTAACAGACTCCGAATTCAGTATGCAGGAGCCTATGGTGCCTGCCAAGCTGGGGACCCAGGCAGAGAA  962

Query  963  GGACCGGCGGCTAAAGAAGAAACACCAGCTGCTTGAAGATGCCAGCAGGAAAGGAATGCCCTTTGCCCAGTGGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACCGGCGGCTAAAGAAGAAACACCAGCTGCTTGAAGATGCCCGCAGGAAAGGAATGCCCTTTGCCCAGTGGG  1036

Query 1037  ATGGTCCTACTGTGGTCTCCTGGTTGGAGCTCTGGGTGGGGATGCCTGCCTGGTATGTGGCAGCCTGCCGGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGTCCTACTGTGGTCTCCTGGTTGGAGCTCTGGGTGGGGATGCCTGCCTGGTATGTGGCAGCCTGCCGGGCC  1110

Query 1111  AACGTCAAGAGTGGTGCCATCATGTCCGCTCTGTCGGACACAGAGATCCAGCGGGAGATCGGCATCAGCAATGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACGTCAAGAGTGGTGCCATCATGTCCGCTCTGTCGGACACAGAGATCCAGCGGGAGATCGGCATCAGCAATGC  1184

Query 1185  CCTGCACCGGCTCAAGCTCCGCCTGGCCATTCAGGAGATGGTGTCATTGACCAGCCCCTCTGCCCCACCCACCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGCACCGGCTCAAGCTCCGCCTGGCCATTCAGGAGATGGTGTCATTGACCAGCCCCTCTGCCCCACCCACCT  1258

Query 1259  CCAGGACTTCTTCTGGGAATGTCTGGGTCACCCATGAAGAGATGGAAACTCTGGAAACATCTACTAAAACAGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGGACTTCTTCTGGGAATGTCTGGGTCACCCATGAAGAGATGGAAACTCTGGAAACATCTACTAAAACAGAC  1332

Query 1333  AGTGAGGAGGGCAGCTGGGCTCAGACCCTGGCCTATGGGGACATGAACCATGAGTGGATTGGGAATGAATGGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGAGGAGGGCAGCTGGGCTCAGACCCTGGCCTATGGGGACATGAACCATGAGTGGATTGGGAATGAATGGCT  1406

Query 1407  ACCCAGCCTGGGGCTCCCGCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGTGCCTGGTGGACGCCCGCATGCTGGACCACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCCAGCCTGGGGCTCCCGCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGTGCCTGGTGGACGCCCGCATGCTGGACCACC  1480

Query 1481  TCACCAAGAAGGACCTGCGGGTCCACCTGAAGATGGTGGACAGCTTCCATCGAACCAGTCTTCAGTATGGCATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCACCAAGAAGGACCTGCGGGTCCACCTGAAGATGGTGGACAGCTTCCATCGAACCAGTCTTCAGTATGGCATC  1554

Query 1555  ATGTGTCTGAAGAGGCTGAATTATGACCGGAAGGAGCTGGAGAAGAGGCGAGAGGAGAGCCAGCATGAGATCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGTGTCTGAAGAGGCTGAATTATGACCGGAAGGAGCTGGAGAAGAGGCGAGAGGAGAGCCAGCATGAGATCAA  1628

Query 1629  GGATGTGTTAGTCTGGACCAACGACCAGGTGGTTCATTGGGTCCAGTCTATTGGGCTCCGGGACTACGCAGGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGATGTGTTAGTCTGGACCAACGACCAGGTGGTTCATTGGGTCCAGTCTATTGGGCTCCGGGACTACGCAGGAA  1702

Query 1703  ACCTGCATGAGAGTGGTGTGCATGGAGCCTTGCTGGCCCTGGACGAGAACTTCGACCACAACACACTGGCCCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTGCATGAGAGTGGTGTGCATGGAGCCTTGCTGGCCCTGGACGAGAACTTCGACCACAACACACTGGCCCTG  1776

Query 1777  ATCCTCCAGATCCCCACACAGAACACCCAGGCACGCCAAGTGATGGAAAGAGAGTTCAATAACCTGTTGGCCTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCCTCCAGATCCCCACACAGAACACCCAGGCACGCCAAGTGATGGAAAGAGAGTTCAATAACCTGTTGGCCTT  1850

Query 1851  GGGCACAGACCGGAAGCTGGATGACGGGGATGACAAGGTGTTTCGCCGCGCGCCCTCCTGGAGGAAGCGCTTCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGCACAGACCGGAAGCTGGATGACGGGGATGACAAGGTGTTTCGCCGCGCGCCCTCCTGGAGGAAGCGCTTCC  1924

Query 1925  GGCCGCGGGAGCACCACGGTCGCGGCGGCATGCTCAGCGCTTCCGCGGAGACCCTCCCGGCGGGCTTCCGTGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCCGCGGGAGCACCACGGTCGCGGCGGCATGCTCAGCGCTTCCGCGGAGACCCTCCCGGCGGGCTTCCGTGTG  1998

Query 1999  TCCACCCTGGGGACCCTGCAGCCCCCACCGGCCCCGCCAAAGAAGATCATGCCTGAAGCTC--ACTCCC-----  2065
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |.||.|     
Sbjct 1999  TCCACCCTGGGGACCCTGCAGCCCCCACCGGCCCCGCCAAAGAAGATCATGCCTGAAGCTCCTAGTCTCGTCCG  2072

Query 2066  --ACTATC-------------TCTACGGACACAT--GCTCTCCGCCTTCCGGGAC-------------------  2103
              |||.||             |||..|.|.|.||  |..|.||.|||  |||.||                   
Sbjct 2073  TGACTTTCCGGTTGCCCTGGATCTCAGAATATATTCGTCCACCCCCT--CGGCACCCCATTACCCCGAGTCCCA  2144

Query 2104  --------------------------------------------------------------------------  2103
                                                                                      
Sbjct 2145  CCGTGTGTCCGTTGTAAGTCCGGTGGATGTGGCTGGGGTTTCCTGGTATTGTGGAGGCACCCAGGTTGTCCATG  2218

Query 2104  --------------------------------------------------------------------------  2103
                                                                                      
Sbjct 2219  CTTGGGATTCTGGGGGAAGGAGAGAAGGGCAGCTCAGGGTGGATGTGAAGCCACCCTTCCTCTTCTGGACCCAG  2292

Query 2104  --------------------------------------------------------------------------  2103
                                                                                      
Sbjct 2293  CCTGGTCTGCACTGCAACCTCCACCAGGACCAGGATCCTGGGCCACAGGCTGGGATGGTCCTTCCAAGAAAGGG  2366

Query 2104  -------------------------------------  2103
                                                 
Sbjct 2367  TCATTTCAGACGCAGCCCTGCTTGGGCTATTCAATCT  2403