Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480690
• Subject: NM_001198779.1
• Aligned Length: 2274
• Identities: 2235
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGA  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGCCTGGCAAGGAATTTCAACACTACACTTGCACAATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGA  74

Query   36  AACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATG  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATG  148

Query  110  ACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACT  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACT  222

Query  184  AAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGAGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTAT  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGAGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTAT  296

Query  258  GTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCC  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCC  370

Query  332  AGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCA  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTCAGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCA  444

Query  406  CTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTAT  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGGAAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTAT  518

Query  480  CCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTA  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGGAGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTA  592

Query  554  TTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCT  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAATTCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCT  666

Query  628  CCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACA  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAAGCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACA  740

Query  702  GTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCAT  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGAAATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCAT  814

Query  776  ATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCAT  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAGCAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCAT  888

Query  850  AATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTT  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAATATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTT  962

Query  924  ACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGATGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGG  1036

Query  998  AAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTT  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAGTGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTT  1110

Query 1072  TTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAGGCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAA  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAGGCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAA  1184

Query 1146  GTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGA  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTGTGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGA  1258

Query 1220  CAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTT  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCACAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTT  1332

Query 1294  CAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGC  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATTCATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGC  1406

Query 1368  CATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGA  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTTTACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGA  1480

Query 1442  GTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATT  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTATCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATT  1554

Query 1516  AGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCC  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCTCTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCC  1628

Query 1590  CCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACAT  1663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATTTTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACAT  1702

Query 1664  GGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACTATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACA  1737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACTATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACA  1776

Query 1738  TACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCA  1811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAAACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCA  1850

Query 1812  GATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAA  1885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATTACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAA  1924

Query 1886  AGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATT  1959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATATGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATT  1998

Query 1960  ACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAAT  2033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAGCAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAAT  2072

Query 2034  GTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGG  2107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACGAAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGG  2146

Query 2108  TGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGAC  2181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCAGCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGAC  2220

Query 2182  AAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTACGTCGCG  2235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAATACAGCTACGTCGCG  2274