Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480690
• Subject: NM_001324376.2
• Aligned Length: 2235
• Identities: 1842
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  444
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------ATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  51

Query  445  AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   52  AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG  125

Query  519  AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  199

Query  593  TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA  273

Query  667  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  347

Query  741  AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG  421

Query  815  CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT  495

Query  889  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA  569

Query  963  TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG  643

Query 1037  TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG  717

Query 1111  GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  791

Query 1185  TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA  865

Query 1259  CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT  939

Query 1333  CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1013

Query 1407  TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA  1087

Query 1481  TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT  1161

Query 1555  CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT  1235

Query 1629  TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1309

Query 1703  ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1383

Query 1777  ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384  ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT  1457

Query 1851  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA  1531

Query 1925  TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532  TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG  1605

Query 1999  CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606  CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG  1679

Query 2073  AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680  AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA  1753

Query 2147  GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754  GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA  1827

Query 2221  TACAGCTACGTCGCG  2235
            |||||||||||||||
Sbjct 1828  TACAGCTACGTCGCG  1842