Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480690
• Subject: XM_006526274.3
• Aligned Length: 2235
• Identities: 2042
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT  74
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGTCTTTAAAACCAAGAGTAGTGGATTTTGATGAGACATGGAACAAACTCCTAACTACAATCAAAGCTGTTGT  74

Query   75  CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC  148
            .|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATGTTGGAATATGTCGAGCGAGCAACATGGAATGACCGCTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC  148

Query  149  CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG  222
            |||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||.|||||
Sbjct  149  CTGAACCACTTGGAGAAAGACTTTATGCGGAAACAAAGATTTTTTTGGAAAGTCACGTTCGGCATTTGTATAAG  222

Query  223  AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA  296
            ||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  223  AGAGTTCTGGAGTCTGAAGAACAAGTGCTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAAGGCGCCGA  296

Query  297  CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|
Sbjct  297  CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAATACCCAGTATATTAAAAAGAATAAATTGACAGAAGCTGATATAC  370

Query  371  AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  444
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTATGGCTATGGTGGAGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  444

Query  445  AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG  518
            ||.||.|||||||||||.||||||..||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTTAATGGTTGAACCCCTTCAGAACATCCTCATCCGGATGCTGCTTCGAGAAATTAAAAATGATCGTGGTGG  518

Query  519  AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  592
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGATCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  592

Query  593  TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA  666
            |.|||||||||||||||||||.|||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  TTCCCTTAAAGTTTTATCAGGGAATATTCGTGTCTCCCTTTCTGACTGAAACGGGAGAATATTACAAGCAAGAA  666

Query  667  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAATTGTTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  740

Query  741  AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG  814
            ||||.|||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  741  AATTAGATGTCGAAAATATTTGCATCCAAGTTCATATACTAAAGTGATTCATGAGTGTCAGCAGCGGATGGTAG  814

Query  815  CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT  888
            ||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.|..||.||||..|||||||..||.||.||||||||||||
Sbjct  815  CAGACCACTTACAGTTCTTACATTCAGAGTGCCACAGCATCATTCAGCAAGAGAGGAAGAACGACATGGCAAAT  888

Query  889  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  889  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCAGTGGTTTACCTCATATGATTGAGGAGCTGCAGAAACATATCCATGA  962

Query  963  TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG  1036
            .||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CGAGGGCCTCAGAGCGACCAGTAACCTTACTCAGGAACATATGCCAACACTATTTGTGGAATCAGTTTTGGAAG  1036

Query 1037  TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG  1110
            |.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  TACATGGTAAATTCGTTCAACTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCTTTAGATAAG  1110

Query 1111  GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  1184
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTTACATCTGTTGTAAATTACAGAGAACCCAAGTCTGTTTGCAAAGCGCCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  1184

Query 1185  TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA  1258
            |||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1185  TGACAACTTGCTAAAGAAGTCAGCGAAGGGGATGACTGAAAATGAAGTGGAGGACAAGCTCACTAGCTTCATCA  1258

Query 1259  CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT  1332
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1259  CAGTTTTCAAGTACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAGAAGTTCTATGCAAGAATGCTAGCAAAACGTCTAATT  1332

Query 1333  CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1406
            ||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACGGGTTGTCTATGTCTATGGATTCTGAAGAAGCCATGATCAATAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1406

Query 1407  TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA  1480
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  TACCAGCAAGCTGCATCGAATGTATACAGACATGAGTGTCAGCGCTGATTTGAACAATAAGTTCAACAATTTCA  1480

Query 1481  TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT  1554
            |||.||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCAGAAACCAAGACACCGTGATTGACTTGGGGATTAGTTTCCAAATATATGTTCTTCAGGCTGGTGCGTGGCCT  1554

Query 1555  CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT  1628
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  CTCACTCAGGCTCCTTCATCTACATTTGCAATTCCCCAAGAGCTAGAGAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTGTT  1628

Query 1629  TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1702
            |||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTATAGCCAGCATTTCAGTGGACGGAAGCTGACATGGTTGCATTATCTCTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1702

Query 1703  ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1776
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATTTGGGAAAACCATATGTAGCTATGGTTACAACCTACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1776

Query 1777  ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT  1850
            ||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACTGTCAGCTACAAAGAACTTCAAGACAGTACCCAGATGAATGAAAAGGAGCTGACCAAAACAATCAAATCATT  1850

Query 1851  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATCGATGCAGAATCTTCATTTTCATTAAATA  1924

Query 1925  TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG  1998
            |||.|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||.||||.
Sbjct 1925  TGAGCTTCAGCAGTAAGAGAACAAAATTTAAGATTACTACGTCAATGCAGAAGGATACGCCACAAGAACTGGAA  1998

Query 1999  CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG  2072
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGACTAGAAGTGCTGTAGATGAGGACCGGAAAATGTATCTTCAAGCTGCTATTGTCCGCATCATGAAAGCACG  2072

Query 2073  AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA  2146
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2073  AAAAGTGCTTCGGCACAACGCCCTCATTCAAGAGGTAATCAGCCAGTCAAGAGCCAGGTTCAATCCCAGTATCA  2146

Query 2147  GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA  2220
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2147  GCATGATTAAGAAGTGCATAGAAGTTCTGATAGACAAACAGTACATCGAGCGCAGCCAAGCATCTGCAGATGAA  2220

Query 2221  TACAGCTACGTCGCG  2235
            |||||.||||||||.
Sbjct 2221  TACAGTTACGTCGCA  2235