Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480865
- Subject:
- XM_005271324.5
- Aligned Length:
- 1836
- Identities:
- 1661
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTAAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAA 74
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGGAGAAACAAAGAC 16
||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAACAGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGAC 148
Query 17 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 222
Query 91 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAAC------------------------------------------A 122
||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 223 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGA 296
Query 123 GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA 370
Query 197 ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT 270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT 444
Query 271 GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC 518
Query 345 AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCAGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC 418
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC 592
Query 419 GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG 666
Query 493 CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA 740
Query 567 ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA 814
Query 641 GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG 888
Query 715 TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA 962
Query 789 AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC 862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC 1036
Query 863 AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG 1110
Query 937 ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC 1184
Query 1011 TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC 1258
Query 1085 GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT 1332
Query 1159 CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA 1406
Query 1233 AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG 1480
Query 1307 AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA 1554
Query 1381 TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG 1454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG 1628
Query 1455 AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG 1702
Query 1529 AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA 1776
Query 1603 GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAACTGATGACTAC 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAACTGATGACTAC 1836