Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480865
• Subject: XM_005271326.4
• Aligned Length: 1794
• Identities: 1661
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTAAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAA  74

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGAGAAACAAAGAC  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAACAGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGAC  148

Query   17  AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA  222

Query   91  ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAA  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAA  296

Query  165  ATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGA  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGA  370

Query  239  TCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCA  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCA  444

Query  313  TTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCAGAAAATTGAAACTAACTTT  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTT  518

Query  387  TGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAG  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAG  592

Query  461  AAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAA  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAA  666

Query  535  ATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGA  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGA  740

Query  609  AAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAA  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAA  814

Query  683  ATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTG  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTG  888

Query  757  GAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCA  962

Query  831  TAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAA  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAA  1036

Query  905  CCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTA  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTA  1110

Query  979  AAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAG  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAG  1184

Query 1053  AAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTA  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTA  1258

Query 1127  GGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAG  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAG  1332

Query 1201  GCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAAT  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAAT  1406

Query 1275  TGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTG  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTG  1480

Query 1349  AAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGT  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGT  1554

Query 1423  GAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAAT  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAAT  1628

Query 1497  ACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCC  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCC  1702

Query 1571  CAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACC  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACC  1776

Query 1645  ATTGAAACTGATGACTAC  1662
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTGAAACTGATGACTAC  1794