Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480906
- Subject:
- NM_011492.4
- Aligned Length:
- 1318
- Identities:
- 1111
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGGTGGACCCGCAGCAGCTGGGCATGTTCACGGAGGGCGAGCTGATGTCGGTGGGTATGGACACGTT 74
|||||.||||.||||||..|||.|.|||||.|.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGACGTGGCGGACCCCGAGCCGTTGGGCCTTTTCTCCGAGGGCGAGCTGATGTCGGTGGGCATGGACACCTT 74
Query 75 CATCCACCGCATCGACTCCACCGAGGTCATCTACCAGCCGCGCCGCAAGCGGGCCAAGCTCATCGGCAAGTACC 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCCACCGCATCGACTCCACCGAGGTAATCTACCAGCCGCGCCGCAAACGCGCCAAGCTCATCGGCAAGTACC 148
Query 149 TGATGGGGGACCTGCTGGGGGAAGGCTCTTACGGCAAGGTGAAGGAGGTGCTGGACTCGGAGACGCTGTGCAGG 222
||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||.|.
Sbjct 149 TGATGGGGGACCTGCTCGGGGAGGGCTCGTACGGCAAGGTGAAGGAGGTGCTGGACTCCGAGACCTTATGCCGC 222
Query 223 AGGGCCGTCAAGATCCTCAAGAAGAAGAAGTTGCGAAGGATCCCCAACGGGGAGGCCAACGTGAAGAAGGAAAT 296
|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 AGGGCGGTCAAGATCCTCAAGAAGAAAAAGCTGCGCAGGATCCCCAATGGAGAGGCCAACGTCAAGAAGGAGAT 296
Query 297 TCAACTACTGAGGAGGTTACGGCACAAAAATGTCATCCAGCTGGTGGATGTGTTATACAACGAAGAGAAGCAGA 370
.||.||.|||.||.||.|.|||||....|||||.||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CCAGCTGCTGCGGCGGCTGCGGCATCGGAATGTGATCCAGCTTGTGGACGTGCTGTACAATGAGGAGAAGCAGA 370
Query 371 AAATGTATATGGTGATGGAGTACTGCGTGTGTGGCATGCAGGAAATGCTGGACAGCGTGCCGGAGAAGCGTTTC 444
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 AGATGTATATGGTGATGGAGTACTGCGTATGTGGCATGCAGGAGATGCTGGACAGTGTGCCGGAGAAGCGCTTC 444
Query 445 CCAGTGTGCCAGGCCCACGGGTACTTCTGTCAGCTGATTGACGGCCTGGAGTACCTGCATAGCCAGGGCATTGT 518
||.||||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 CCTGTGTGCCAAGCTCATGGGTACTTCCGCCAGCTGATTGACGGCCTGGAATACCTACACAGCCAGGGCATTGT 518
Query 519 GCACAAGGACATCAAGCCGGGGAACCTGCTGCTCACCACCGGTGGCACCCTCAAAATCTCCGACCTGGGCGTGG 592
.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||..||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 519 TCACAAGGACATCAAGCCGGGCAACCTGCTACTCACCACCAATGGCACACTCAAGATCTCCGACCTCGGTGTTG 592
Query 593 CCGAGGCACTGCACCCGTTCGCGGCGGACGACACCTGCCGGACCAGCCAGGGCTCCCCGGCTTTCCAGCCGCCC 666
|||||||.||||||||.|||||.|.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 593 CCGAGGCCCTGCACCCTTTCGCTGTGGATGACACCTGCCGGACAAGCCAGGGCTCCCCGGCCTTCCAGCCTCCT 666
Query 667 GAGATTGCCAACGGCCTGGACACCTTCTCCGGCTTCAAGGTGGACATCTGGTCGGCTGGGGTCACCCTCTACAA 740
|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 667 GAGATTGCCAATGGACTGGACACCTTTTCAGGTTTCAAGGTGGACATCTGGTCAGCTGGGGTCACACTTTACAA 740
Query 741 CATCACCACGGGTCTGTACCCCTTCGAAGGGGACAACATCTACAAGTTGTTTGAGAACATCGGGAAGGGGAG-C 813
||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||| ||.|||| |
Sbjct 741 CATCACCACGGGCCTGTACCCATTTGAGGGGGACAATATCTACAAGCTCTTTGAGAACATTGGG-AGAGGAGAC 813
Query 814 TACGCCATCCCGGGCGACTGTGGCCCCCCGCTCTCTGACCTGCTGAAAGGGATGCTTGAGTACGAACCGGCCAA 887
|.|.|||||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||...|||||||.|.|||||.||.||||||||
Sbjct 814 TTCACCATCCCTTGTGACTGCGGCCCACCACTCTCTGACCTACTCCGAGGGATGTTGGAGTATGAGCCGGCCAA 887
Query 888 GAGGTTCTCCATCCGGCAGATCCGGCAGCACAGCTGGTTCCGGAAGAAACATCCTCCGGCTGAAGCACCAGTGC 961
|||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||.|..||.|
Sbjct 888 GAGGTTCTCCATCCGACAGATTAGGCAGCACAGCTGGTTCCGGAAGAAACACCCTCTGGCTGAGGCGCTCGTAC 961
Query 962 CCATCCCACCGAGCCCAGACACCAAGGACCGGTGGCGCAGCATGACTGTGGTGCCGTACTTGGAGGACCTGCAC 1035
|.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.
Sbjct 962 CTATCCCACCAAGCCCAGACACTAAGGACCGCTGGCGCAGTATGACTGTAGTGCCCTACCTGGAGGACCTGCAT 1035
Query 1036 GGC---GCGGACGAGGACGAG------GACCTCTTCGACATCGAGGATGACATCATCTACACTCAGGACTTCAC 1100
||| |||||.|||||.||| |||.|.||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036 GGCCGTGCGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGACTTGTTTGACATTGAGGACGGCATTATCTACACCCAGGACTTCAC 1109
Query 1101 GGTGCCCGGACAGGTCCCAGAAGAGGAGGCCAGTCACAATGGACAGCGCCGGGGCCTCCCCAAGGCCGTGTGTA 1174
.|||||.||||||||||..||||||||.|...||||.|||||||||.|||...|..|.||||||||.||.|||.
Sbjct 1110 AGTGCCTGGACAGGTCCTGGAAGAGGAAGTGGGTCAGAATGGACAGAGCCACAGTTTGCCCAAGGCTGTTTGTG 1183
Query 1175 TGAACGGCACAGAGGCGGCGCAGCTGAGCACCA-----AATCCAG--GGCGGAGGGCCGGG--CCCCCAACCCT 1239
||||.|||||||| |.|.|||||.||||.|| ||.|||| |||.|| ||.|| ||.||||||||
Sbjct 1184 TGAATGGCACAGA---GCCCCAGCTCAGCAGCAAGGTGAAGCCAGAAGGCCGA---CCTGGCACCGCCAACCCT 1251
Query 1240 GCCCGCAAGGCCTGCTCCGCCAGCAGCAAGATCCGCCGGCTGTCGGCCTGCAAGCAGCAG 1299
||.|||||||..|||| ||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GCGCGCAAGGTGTGCT---CCAGCAACAAGATCCGCCGGCTCTCGGCCTGCAAGCAGCAG 1308