Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480931
- Subject:
- XM_011509799.2
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 982
- Gaps:
- 369
Alignment
Query 1 ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCA---------TGG-----------------------------TC--- 33
||||| |.||.|...||||| |||| ||| ||
Sbjct 1 ATGGT----GGGGTCAGGGGCTT-CTCAGAGGAGGCCTGGAGTGGAAGGAGGAGTGAGAGATGAAGCCCTCACC 69
Query 34 -TTCCTGCAGCGTTAC---GGCTTCA------GCAGCGTGGG-----------------------CTTCACCTT 74
|||||.|||.|.||| ||| || |||| ||| ||||||..|
Sbjct 70 ATTCCTTCAGAGCTACCAGGGC--CAGAGGAGGCAG---GGGAAGGACCAAGGGCCTTGACATCACTTCACAAT 138
Query 75 CC---------TCCTGGCC---GCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCC---------AGGGCT------ 121
|| .|.|||.| ||||.| ||.| ||||.|..|||.||||.| .|||||
Sbjct 139 CCAAAAGGAAACCATGGACTAAGCCTCT-CCAT--AGTGTTTGACAGTGGTTCCTGGAGGAAGGGGCTATCTGG 209
Query 122 ---TTCTCCA----CT-CCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTT 187
.|||||| || ||| |||.|..||||| ||.|| |..||..|||||.| |||
Sbjct 210 TTCATCTCCAAAGCCTGCCT--CACAGGCGCCAC--------TGCCG---------TCCTCTTTGCTGTC-TTT 263
Query 188 GTGCGGGGGCCGTGCT-CATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGC 260
||.| ||| || ||| .|||.|||| || ||||| .||| ||||
Sbjct 264 GTCC---------GCTACA---------------ACC---ACAAAACCG-----AC---GCTGC-CCTC-TGGC 300
Query 261 -CCTGCTGGAG--------GTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAG 325
|| |||| ||...||.| .||||||.||| |.|||
Sbjct 301 ACC----GGAGCAACCACAGTAACGCGG-------ACAATGAATTT----TACTT------------------- 340
Query 326 TCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGC 399
|||
Sbjct 341 -----------------TCG------------------------------------------------------ 343
Query 400 GGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGC 473
||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 ----------------------CTACCCAAGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGC 395
Query 474 CTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCG 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCG 469
Query 548 TCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCA 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 TCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCA 543
Query 622 CTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGG 695
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGG 617
Query 696 CACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGG 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 CACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGG 691
Query 770 CTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTG 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 CTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTG 765
Query 844 GCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACAC 917
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 GCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACAC 839
Query 918 ATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTG 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTG 913
Query 992 CCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACG 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 CCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACG 987
Query 1066 TCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 TCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGG 1061
Query 1140 GCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAG 1213
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 GCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCCAGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAG 1134
Query 1214 GTGCCTGGCGAGCA---------------------------------------------------- 1227
||||||||||||||
Sbjct 1135 GTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTGGAGGAGGCAGACACTCAGGCC 1200