Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480943
• Subject: XM_006499184.3
• Aligned Length: 2267
• Identities: 1992
• Gaps: 61

Alignment

Query    1  ATGGGAATAAAGGTTCAACGTCCTCGATGTTTTTTTGACATTGCCATTAACAATCAACCTGCTGGAAGAGTTGT  74
            |||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGATAAAGGTCCAGCGTCCTCGGTGTTTTTTTGACATTGCCATTAATAATCAACCTGCTGGAAGAGTTGT  74

Query   75  CTTTGAATTATTTTCTGATGTGTGCCCCAAAACATGCGAGAACTTTCGTTGTCTTTGTACAGGTGAAAAGGGGA  148
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  CTTTGAATTATTTTCCGATGTATGTCCCAAAACGTGTGAGAACTTTCGCTGCCTTTGCACAGGTGAAAAAGGGA  148

Query  149  CCGGGAAATCAACTCAGAAACCATTACATTATAAGAGTTGTCTCTTTCACAGAGTTGTCAAGGATTTTATGGTT  222
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CAGGGAAATCAACTCAGAAGCCATTACATTATAAGAGCTGTCTCTTTCATAGAGTTGTCAAGGATTTCATGGTT  222

Query  223  CAAGGTGGTGACTTCAG---------------------------------------------TGAAGACGAGAG  251
            ||.||||||||||||||                                             ||||||.|||||
Sbjct  223  CAGGGTGGTGACTTCAGTGAAGGGAATGGAAGAGGAGGAGAATCTATTTATGGAGGATTCTTTGAAGATGAGAG  296

Query  252  TTTCGCTGTTAAACACAACAAAGAATTTCTCTTGTCAATGGCCAACAGAGGGAAGGATACAAATGGTTCACAGT  325
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  TTTTGCTGTTAAACACAACAAAGAGTTTCTCTTATCAATGGCCAACAGAGGGAAGGATACAAATGGCTCTCAGT  370

Query  326  TCTTCATAACAACGAAACCAACTCCTCATTTAGATGGGCATCATGTTGTTTTTGGACAAGTAATCTCTGGTCAA  399
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  371  TCTTTATAACAACAAAACCAACTCCTCATTTAGATGGGCATCATGTTGTTTTTGGGCAAGTGATCTCTGGTCAG  444

Query  400  GAAGTTGTAAGAGAGATTGAAAACCAGAAAACAGATGCAGCTAGCAAACCGTTTGCGGAGGTACGGATACTCAG  473
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  445  GAAGTTGTGAGAGAGATTGAAAACCAGAAAACAGATGCCGCTAGCAAACCATTTGCTGAAGTTCGGATACTCAG  518

Query  474  TTGTGGAGAGCTGATTCCCAAATCTAAAGTTAAGAAAGAAGAAAAGAAAAGGCATAAATCATCATCATCTTCCT  547
            |||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||      .||.||.||||
Sbjct  519  TTGCGGAGAGCTGATTCCAAAGTCTAAGGTTAAGAAAGAAGAAAAGAAAAGGCATAA------GTCCTCGTCCT  586

Query  548  CCTCCTCATCTAGTGACTCAGATAGCTCAAGTGATTCTCAGTCCTCTTCTGATTCCTCTGATTCCGAAAGTGCT  621
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  587  CCTCCTCCTCCAGTGACTCAGACAGCTCAAGCGATTCTCAGTCCTCCTCTGAGTCTTCTGATTCTGAAAGCGCT  660

Query  622  ACTGAAGAGAAATCAAAGAAAAGAAAAAAGAAACATCGGAAAAATTCCCGAAAACACAAGAAAGAAAAGAAAAA  695
            .|.|||||.|||||.|..|||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  661  TCCGAAGAAAAATCCAGAAAAAGGAAAAAGAAACATAGGAAAAATTCCCGAAAGCATAAGAAGGAGAAGAAGAA  734

Query  696  GCGAAAGAAAAGCAAGAAGAGTGCATCTAGTGAGAGTGAAGCTGAAAATCTTGAAGCACAACCCCAGTCTACTG  769
            ||||||||||||||||||.||..||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  735  GCGAAAGAAAAGCAAGAAAAGCCCATCTAGTGAAAGTGAAGCAGAAAATGTTGATGCACAGCCCCAGTCTACTG  808

Query  770  TCCGTCCAGAAGAGATCCCTCCTATACCTGAAAATAGATTCCTAATGAGAAAAAGTCCTCCTAAAGCTGATGAG  843
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  809  TCCGTCCAGAAGAGATCCCTCCTATACCAGAAAATAGATTTCTAATGAGAAAAAGTCCTCCTAAAGCCGATGAC  882

Query  844  AAGGAAAGGAAAAACAGAGAGAGAGAAAGGGAAAGAGAGTGTAATCCACCTAACTCCCAGCCTGCTTCATACCA  917
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  AAGGAGAGGAAAAACAGAGAGAGAGAAAGAGAAAGAGAGTGTAATCCACCTAACTCCCAGCCTGCTTCATACCA  956

Query  918  GAGACGACTTTTAGTTACTAGATCTGGCAGGAAAATTAAAGGAAGAGGACCAAGGCGTTATCGAACTCCTTCCA  991
            |.|||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GCGACGATTCTTAGTTACTAGGTCTGGCAGGAAAATTAAAGGAAGAGGACCGAGGCGTTATCGAACTCCTTCCA  1030

Query  992  GATCCAGATCAAGGGATCGTTTCAGACGTAGTGAGACTCCTCCACATTGGAGGCAAGAGATGCAGAGAGCTCAA  1065
            ||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1031  GATCCAGATCGAGGGATCGATTCAGACGAAGTGAGACTCCTCCACATTGGAGACAAGAGATGCAGAGAGCTCAG  1104

Query 1066  AGAATGAGGGTATCAAGTGGTGAAAGATGGATCAAGGGGGATAAGAGTGAGTTGAATGAAATAAAAGAAAATCA  1139
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  AGAATGAGGGTGTCAAGTGGTGAAAGATGGATCAAAGGGGATAAGAGTGAGTTAAATGAAATAAAAGAAAATCA  1178

Query 1140  GAGAAGTCCAGTTAGAGTAAAAGAGAGAAAAATAACAGATCACAGGAATGTATCTGAGAGTCCAAACAGAAAAA  1213
            .||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|..|.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1179  AAGGAGCCCAGTTAGAGTAAAAGAGAAAAAAATAACAGATCACAGACACATGTCTGAGAGTCCAAACAGAAAAG  1252

Query 1214  ATGAAAAGGAGAAGAAAGTTAAAGACCATAAATCTAACAGCAAAGAGAGAGACATCAGAAGAAATTCAGAAAAA  1287
            ..||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  TAGAAAAGGAAAAGAAAGCTAAAGACCATAAATCTGAAAGCAAAGAGAGAGACATCAGAAGAAATTCAGAAAAA  1326

Query 1288  GAAGACAAGTAT---AAAAACAAAGTGAAGAAAAGGGCCAAATCTAAAAGTAGGAGTAAGAGCAAAGAGAAATC  1358
            ||.||.||.|||   ||||||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||.||||||||.||||.|||
Sbjct 1327  GATGATAAATATAACAAAAACAAAGTGAAGAAAAGGGGCAAATCCAAGAGTAGGAGCAAGAGCAAGGAGAGATC  1400

Query 1359  AAAGAGTAAAGAAAGAGATTCAAAACATAATAGAAATGAAGAAAAGAGGATGAGGTCAAGGAGTAAAGGAAGGG  1432
            .||||||||.||..||||.||.||.||.|..|||.|.|||||.||||||.||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1401  CAAGAGTAAGGAGCGAGACTCGAAGCACAGCAGACACGAAGACAAGAGGGTGAGGTCAAGAAGTAAAGAAAGGG  1474

Query 1433  ATCATGAAAATGTTAAAGAAAAAG-AAAAGCAGTCT-GATTCTAAAGGAAAAGATCAGGAAAGGAGTAGAAGTA  1504
            |||||||.|.|..||||||||||| ||||.||  || |||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1475  ATCATGAGACTACTAAAGAAAAAGAAAAACCA--CTGGATCCTAAAGGGAAAGATCAGGAAAGGAGTAGAAGCA  1546

Query 1505  AAGAGAAGTCTAAACAGTTAGAATCAAAGAGTAATGAGCATGATCACAGTAAAAGTAAGGAAAAGGATAGACGC  1578
            |||||||.||.||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1547  AAGAGAACTCCAAACAGGTAGAATCAAAAAGTAATGAACATGATCATAGCAAAAGTAAAGAAAAGGATAGACGT  1620

Query 1579  GCACAATCCAGGAGTAGAGAATGTGATATAACTAAAGGTAAACACAGTTATAATAGCAGAACAAGAGAACGAAG  1652
            |||||.|||||||||||||||.|.|||.|.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1621  GCACAGTCCAGGAGTAGAGAACGGGATCTGACTAAAAGTAAACACAGTTACAACAGTAGAACAAGGGAGCGGAG  1694

Query 1653  CAGAAGTAGGGACAGAAGCAGAAGAGTGCGATCAAGAACCCATGACAGAGATCGCAGCAGAAGCAAGGAGTACC  1726
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695  CAGAAGTAGGGACAGGAGCAGAAGAGTGCGGTCCAGAAGCCACGACAGAGATCGCAGCAGAAGCAAGGAGTACC  1768

Query 1727  ATAGATACAGAGAACAGGAATACAGGAGAAGAGGACGGTCACGAAGCCGAGAGAGAAGAACACCACCAGGAAGA  1800
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||..||||||   |.||||||.||
Sbjct 1769  ATAGATACAGAGAACAGGAGTATAGGAGAAGAGGAAGGTCACGAAGCCGGGATCGAAGAA---CGCCAGGACGA  1839

Query 1801  TCAAGAAGTAAAGATAGGAGGAGAAGGAGGAGAGACTCACGGAGCTCAGAGAGAGAAGAAAGTCAAAGCAGAAA  1874
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1840  TCGAGAAGTAAAGATAGGAGGAGAAGAAGGAGGGATTCCCGGAGCTCAGAGAGAGAAGAAAGTCAAAGTAGAAA  1913

Query 1875  CAAAGACAAATACAGAAACCAAGAGAGTAAGAGCTCACACAGAAAAGAAAATTCTGAGAGTGAGAAAAGAATGT  1948
            ||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1914  CAAAGATAAATATAGAAGCCAAGAAAGTAAGAGTTCACACAGAAAAGAAAATTCTGAGGGTGAGAAAAGAACGT  1987

Query 1949  ACTCTAAAAGTCGTGATCATAATAGCTCAAATAACAGCAGGGAAAAAAAGGCTGATAGAGATCAAAGTCCCTTC  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.
Sbjct 1988  ACTCTAAAAGTCGTGATCATAATAGCTCAAGTAATAACAGGGAAAAAAAGGCTGATAGAGAGCAAAGTCCAGTG  2061

Query 2023  TCAAAAATAAAACAAAGCAGTCAGGACAATGAATTAAAGTCCTCCATGTTGAAAAATAAGGAGGATGAGAAGAT  2096
            |||||||.|||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||..||.||||||.|.|||||.||.||||.
Sbjct 2062  TCAAAAACAAAGCAAAGCAGTCAGGACAATGAAGTGAAGTCCTCCACATTAAAAAATCAAGAGGACGAAAAGAC  2135

Query 2097  CAGATCCTCAGTGGAAAAAGAAAACCAAAAATCAAAAGGTCAAGAAAATGACCATGTACATGAAAAAAATAAAA  2170
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2136  CAGATCCCCGGTGGAAAAAGAAAACCAAAAATCAAAGGGTCAAGAAAATGACCATGTACATGACAAAAATAAAA  2209

Query 2171  AATTTGATCATGAATCAAGCCCTGGAACAGATGAAGACAAAAGCGGA  2217
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2210  AATGTGATCATGAATCAAGCCCTGGAACAGATGAAGACAAAAGTGGA  2256