Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480957
• Subject: XM_017015926.1
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1286
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGTCACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGTCACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCT  74

Query   75  GAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCAATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCAATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCT  148

Query  149  CTGTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGAGCTACCTGGATTGCTAATTCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGAGCTACCTGGATTGCTAATTCAG  222

Query  223  GGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCCTTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCCTTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGG  296

Query  297  GCAGGTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAACAGAGTGGTTTAGATTAGAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAACAGAGTGGTTTAGATTAGAAT  370

Query  371  CCAAACAAGGAAAACGAATCAAAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATGACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAACAAGGAAAACGAATCAAAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATGACC  444

Query  445  GCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTTTGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTTTGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGG  518

Query  519  TAGAAAAAATGATGGAACATTTTCTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGAAAAAATGATGGAACATTTTCTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAATA  592

Query  593  GTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCCTTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCCTTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTC  666

Query  667  TCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATTTATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATTTATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGG  740

Query  741  TCAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGAAAGTGGAAGTCTCAAATCTCCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGAAAGTGGAAGTCTCAAATCTCCAC  814

Query  815  ACAGAAGAACATTAAGCTTTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAATTGTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAGAAGAACATTAAGCTTTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAATTGTGT  888

Query  889  TTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATTACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATTACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAA  962

Query  963  GAAAAATCCATTTGAAGAAAGCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAAATAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAAAATCCATTTGAAGAAAGCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAAATAA  1036

Query 1037  GAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGAAAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGAAAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGA  1110

Query 1111  AGATCTGATAAACTTAACAATGGGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGATCTGATAAACTTAACAATGGGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAAAA  1184

Query 1185  TCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAAATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAAATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCAT  1258

Query 1259  CTTCAAGTTTTCATATGAGTCCAACAAGCAATGAAGACCT------CAGGAAAATCCCGGACAGCAACCCCTTT  1326
            |||||||||      .|||||         |||  ||.||      .|.|..|.||||                
Sbjct 1259  CTTCAAGTT------GGAGTC---------ATG--GAGCTATATTCTATGTCATTCCC----------------  1299

Query 1327  GATGCCACTGCAGGGTATCGTAGTCTGACCTATGAAGAGGTTCTACAGGAGCTGGTGAAACACAAAGAACTCCT  1400
                                                                                      
Sbjct 1300  --------------------------------------------------------------------------  1299

Query 1401  TAGGAGGAAAGACACCCACATCCGGGAACTCGAGGACTACATCGACAACCTCCTTGTAAGGGTAATGGAAGAAA  1474
                                                                                      
Sbjct 1300  --------------------------------------------------------------------------  1299

Query 1475  CGCCCAGTATTCTCAGAGTGCCATATGAACCATCCAGGAAAGCTGGCAAATTCTCTAACAGT  1536
                                                                          
Sbjct 1300  --------------------------------------------------------------  1299