Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480991
• Subject: NM_001042599.1
• Aligned Length: 3924
• Identities: 3874
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC  74

Query   75  TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC  148

Query  149  GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC  222

Query  223  TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT  296

Query  297  GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA  370

Query  371  GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT  444

Query  445  GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC  518

Query  519  CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT  592

Query  593  GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC  666

Query  667  GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT  740

Query  741  TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA  814

Query  815  CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC  888

Query  889  TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA  962

Query  963  AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC  1036

Query 1037  AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC  1110

Query 1111  ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT  1184

Query 1185  CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC  1258

Query 1259  TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT  1332

Query 1333  CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA  1406

Query 1407  TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG  1480

Query 1481  AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC  1554

Query 1555  CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT  1628

Query 1629  TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA  1702

Query 1703  CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA  1776

Query 1777  TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG  1850

Query 1851  CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT  1924

Query 1925  CCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATT  1998

Query 1999  GTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGA  2072

Query 2073  AACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAA  2146

Query 2147  CTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAA  2220

Query 2221  GGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTT  2294

Query 2295  CATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCC  2368

Query 2369  CAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAAC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAAC  2442

Query 2443  ATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACT  2516

Query 2517  CGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGC  2590

Query 2591  TAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCT  2664

Query 2665  CTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACT  2738

Query 2739  GATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAAC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAAC  2812

Query 2813  GTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGAC  2886

Query 2887  AGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTAT  2960

Query 2961  TCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGG  3034

Query 3035  ATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACT  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACT  3108

Query 3109  TCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGG  3182
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 3109  TCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGG-----------------------------------------------  3135

Query 3183  AAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTA  3256
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3136  -AACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTA  3208

Query 3257  GCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3209  GCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACC  3282

Query 3331  CTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3283  CTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTT  3356

Query 3405  TGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAAC  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357  TGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAAC  3430

Query 3479  AAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGAT  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3431  AAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGAT  3504

Query 3553  AATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCT  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3505  AATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCT  3578

Query 3627  CAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCA  3700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3579  CAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCA  3652

Query 3701  AGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTAC  3774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653  AGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTAC  3726

Query 3775  CTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGA  3848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3727  CTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGA  3800

Query 3849  ATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGG  3922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801  ATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGG  3874

Query 3923  --  3922
              
Sbjct 3875  TG  3876