Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481066
• Subject: XM_011515881.3
• Aligned Length: 3066
• Identities: 3057
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  74

Query   75  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  148

Query  149  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  222

Query  223  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  296

Query  297  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  370

Query  371  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  444

Query  445  CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTC---CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  518

Query  516  CTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCA  592

Query  590  AAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCC  666

Query  664  CTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCA  740

Query  738  GGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGG  814

Query  812  ATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCT  888

Query  886  GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG  962

Query  960  GCTCTATAAGTCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG  1033
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCTATAAGGCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG  1036

Query 1034  CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT  1110

Query 1108  CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA  1184

Query 1182  GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG  1258

Query 1256  GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC  1332

Query 1330  CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA  1406

Query 1404  GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG  1480

Query 1478  TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC  1554

Query 1552  ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGAC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGAC  1628

Query 1626  CAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG  1702

Query 1700  GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCGGAA  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCAGAA  1776

Query 1774  AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC  1850

Query 1848  GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG  1921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACAGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG  1924

Query 1922  GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC  1998

Query 1996  GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA  2072

Query 2070  GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA  2146

Query 2144  CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC  2220

Query 2218  AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGA  2291
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
Sbjct 2221  AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAG---GCGGGA  2291

Query 2292  GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT  2365

Query 2366  TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT  2439

Query 2440  CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA  2513

Query 2514  TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514  TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT  2587

Query 2588  GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588  GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT  2661

Query 2662  CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662  CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT  2735

Query 2736  GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC  2809

Query 2810  AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810  AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA  2883

Query 2884  CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA  2957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884  CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA  2957

Query 2958  AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958  AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC  3031

Query 3032  AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC  3063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032  AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC  3063