Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481067
• Subject: XM_006514127.3
• Aligned Length: 1125
• Identities: 738
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGGGGTCCCAGGTCTCGGTGGAATCGGGAGCTCTGCACGTGGTGATTGTGGGTGGGGGCTTTGGCGGGATCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCAGCCAGCCAGCTGCAGGCCCTGAACGTCCCCTTCATGCTGGTGGACATGAAGGACTCCTTCCACCACAATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGCTGCTCTCCGAGCCTCCGTGGAGACAGGGTTCGCCAAAAAGACATTCATTTCTTACTCGGTGACTTTCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACAACTTCCGGCAGGGGCTAGTAGTGGGGATAGACCTGAAGAACCAGATGGTGCTGCTGCAGGGTGGCGAGGC  296
                                                            ||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGGTGTTGCTACAGGGTGGCGAGGC  26

Query  297  CCTGCCCTTCTCTCATCTTATCCTGGCCACGGGCAGCACTGGGCCCTTCCCGGGCAAGTTTAATGAGGTTTCCA  370
            |.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.
Sbjct   27  CTTGCCCTTCTCACATCTTATCCTGGCCACAGGCAGCACCGGACCCTTCCCTGGCAAGTTTAACGAGGTGTCCT  100

Query  371  GCCAGCAGGCCGCTATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAGGCAGGTCCAGCGCTCACGGTTCATCGTGGTGGTG  444
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  101  GCCAGCAGGCAGCCATCCAGGCCTATGAGGACATGGTGAAGCAGATCCAGCGCTCACAATTCATCGTGGTGGTG  174

Query  445  GGAGGAGGCTCGGCTGGAGTGGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACAGAATATCCTGAGAAAGAGGTCACTCTCAT  518
            |||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  175  GGAGGCGGCTCTGCAGGAGTAGAGATGGCAGCAGAGATTAAAACCGAGTACCCTGAGAAGGAGGTCACTCTTAT  248

Query  519  TCACTCCCAAGTGGCCCTGGCTGACAAGGAGCTCCTGCCCTCCGTCCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC  592
            .||||||..|||..|||||||.||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CCACTCCAGAGTACCCCTGGCCGACAAGGAACTCCTGCCCTGTGTGCGGCAGGAAGTGAAGGAGATCCTCCTCC  322

Query  593  GGAAGGGCGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAATCTGGAGGAGCTGCCTCTCAATGAGTATCGAGAG  666
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  323  GGAAGGGTGTGCAGCTGCTGCTGAGTGAGCGGGTGAGCAACCTGGAGGAACTGCCTCGCAATGAGTATCGGGAG  396

Query  667  TACATCAAAGTGCAGACGGACAAAGGCACAGAGGTGGCCACCAACCTGGTGATTCTCTGCACCGGCATCAAGAT  740
            ||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||.|.||||..||.||||||||
Sbjct  397  TACATCAAGGTGGAGACAGACAAGGGCACGGAGGTGGCCACCAACATGGTGATTGTGTGCAATGGGATCAAGAT  470

Query  741  CAACAGCTCCGCCTACCGCAAAGCATTT---GAGAGCAGACTAGCCAGCAGTGGTGCTCTGAGAGTGAACGAGC  811
            |||||||||.||||||||||..||||||   |||||.||.||.||.||||.|||||||||||.||||||||||.
Sbjct  471  CAACAGCTCTGCCTACCGCAGTGCATTTGCAGAGAGTAGGCTGGCTAGCAATGGTGCTCTGAAAGTGAACGAGT  544

Query  812  ACCTCCAGGTGGAGGGCCACAGCAACGTCTACGCCATTGGTGACTGTGCCGACGT---GAGGACGCCCAAGATG  882
            .||||||||||||.||..|||||||..|.||.||||||||||||||||||||  |   .|||| ||||||||||
Sbjct  545  TCCTCCAGGTGGAAGGTTACAGCAATATTTATGCCATTGGTGACTGTGCCGA--TACCAAGGA-GCCCAAGATG  615

Query  883  GCCTATCTTGCCGGCCTCCACGCCAACATCGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCTGTGAAGCAGCGGCCTCTCCA  956
            |||||.|..||.|||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||..||||||||.||||.|||.|
Sbjct  616  GCCTACCACGCTGGCCTGCATGCCAATGTTGCCGTGGCCAACATCGTCAACTCCATGAAGCAGAGGCCACTCAA  689

Query  957  GGCCTACAAGCCGGGTGCACTGACGTTCCTCCTGTCCATGGGGAGAAATGACGGTGTGGGCCAAATCAGTGGCT  1030
            .||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  690  AGCTTACAAGCCAGGTGCGCTGACATTCCTCCTGTCCATGGGCAGAAATGATGGCGTGGGTCAGATCAGTGGCT  763

Query 1031  TCTATGTGGGCCGGCTCATGGTTCGGCTGACCAAGAGCCGGGACCTGTTCGTCTCTACGAGCTGGAAAACCATG  1104
            ||||.||.|||||.||||||||.||||||.||||||||.|||||||..||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  764  TCTACGTAGGCCGCCTCATGGTGCGGCTGGCCAAGAGCAGGGACCTTCTCATCTCCACAAGCTGGAAAACCATG  837

Query 1105  AGGCAGTCTCCACCT  1119
            .|||||||||||||.
Sbjct  838  CGGCAGTCTCCACCG  852