Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481075
• Subject: XM_011540609.2
• Aligned Length: 2532
• Identities: 2402
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCGCGCTTCAGGGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGA  74

Query   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCAGTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCT  148

Query  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCCCAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATC  222

Query  223  TC------------------------------GGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT  266
            ||                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGGTGAGGGGCCGACTGACCTCTGACCTCAAGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGT  296

Query  267  GAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG  340
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGG  370

Query  341  ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGG  444

Query  415  AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTG  518

Query  489  CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGG  592

Query  563  ACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGAC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGAC  666

Query  637  CCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGA  740

Query  711  GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTG  814

Query  785  ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGG  888

Query  859  AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGT  962

Query  933  GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGT  1036

Query 1007  CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCC  1110

Query 1081  AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTC  1184

Query 1155  CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC  1228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGC  1258

Query 1229  AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGC  1332

Query 1303  GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGAC  1406

Query 1377  GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATG  1480

Query 1451  AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATC  1554

Query 1525  AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTG  1628

Query 1599  GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC  1672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGC  1702

Query 1673  CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTC  1776

Query 1747  TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAG  1820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 1777  TGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCA-------  1843

Query 1821  TAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGG  1894
                                                                                      
Sbjct 1844  --------------------------------------------------------------------------  1843

Query 1895  ACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG  1968
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844  ------------------AGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAG  1899

Query 1969  GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900  GCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCT  1973

Query 2043  TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC  2116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974  TCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGC  2047

Query 2117  CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC  2190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048  CGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAAC  2121

Query 2191  CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT  2264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2122  CAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTT  2195

Query 2265  CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG  2338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196  CCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGG  2269

Query 2339  CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT  2412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270  CCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCT  2343

Query 2413  GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT  2486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2344  GGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCT  2417

Query 2487  CCACCTGGAAGAGAGC  2502
            ||||||||||||||||
Sbjct 2418  CCACCTGGAAGAGAGC  2433