Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481075
• Subject: XM_024452993.1
• Aligned Length: 2529
• Identities: 2470
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCG-------------------CGCT--------TCAG  47
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Sbjct    1  ---------------------------ATGGCCTACCCGTCTTTCCAGCGGACCATGCCGCTTGCAGCTGTGAG  47

Query   48  GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA  121
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Sbjct   48  GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA  121

Query  122  GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC  195
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Sbjct  122  GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC  195

Query  196  CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAA  269
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Sbjct  196  CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGGAATGTCTGCAGAGGTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAA  269

Query  270  CTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATG  343
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Sbjct  270  CTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGCAGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATG  343

Query  344  TGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAAC  417
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Sbjct  344  TGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGGGAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAAC  417

Query  418  GCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTT  491
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Sbjct  418  GCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCACCGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTT  491

Query  492  CCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACT  565
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Sbjct  492  CCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGCAGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACT  565

Query  566  CTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCC  639
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Sbjct  566  CTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAGGGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCC  639

Query  640  TACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCG  713
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Sbjct  640  TACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGACTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCG  713

Query  714  AAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACG  787
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Sbjct  714  AAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCTCCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACG  787

Query  788  TGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAAC  861
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Sbjct  788  TGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAGAGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAAC  861

Query  862  CGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGT  935
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Sbjct  862  CGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAAGAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGT  935

Query  936  GGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCAC  1009
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Sbjct  936  GGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCGAGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCAC  1009

Query 1010  CCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGC  1083
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Sbjct 1010  CCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGGCAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGC  1083

Query 1084  ATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCAC  1157
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Sbjct 1084  ATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGAGAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCAC  1157

Query 1158  GAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGA  1231
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Sbjct 1158  GAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGAAGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGA  1231

Query 1232  GTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTG  1305
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Sbjct 1232  GTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGACCCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTG  1305

Query 1306  CTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCT  1379
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Sbjct 1306  CTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGTCCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCT  1379

Query 1380  GGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGG  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  GGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTGGAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGG  1453

Query 1454  CCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAG  1527
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Sbjct 1454  CCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGCTCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAG  1527

Query 1528  GACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAG  1601
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Sbjct 1528  GACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGCACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAG  1601

Query 1602  GGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCG  1675
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Sbjct 1602  GGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCACTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCG  1675

Query 1676  TTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGT  1749
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Sbjct 1676  TTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGATCGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGT  1749

Query 1750  CCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAG  1823
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Sbjct 1750  CCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGCCGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAG  1823

Query 1824  CGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACA  1897
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Sbjct 1824  CGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCCTGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACA  1897

Query 1898  GCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCC  1971
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Sbjct 1898  GCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGTGAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCC  1971

Query 1972  TGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCC  2045
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Sbjct 1972  TGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGCGCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCC  2045

Query 2046  TGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGC  2119
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Sbjct 2046  TGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGGCGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGC  2119

Query 2120  TGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAA  2193
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Sbjct 2120  TGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTCCTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAA  2193

Query 2194  AGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCT  2267
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Sbjct 2194  AGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCTGGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCT  2267

Query 2268  GAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCA  2341
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Sbjct 2268  GAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGGACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCA  2341

Query 2342  ACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGT  2415
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Sbjct 2342  ACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAGGAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGT  2415

Query 2416  CCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCA  2489
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Sbjct 2416  CCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCGCAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCA  2489

Query 2490  CCTGGAAGAGAGC  2502
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Sbjct 2490  CCTGGAAGAGAGC  2502