Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481087
• Subject: NM_178398.4
• Aligned Length: 1335
• Identities: 1152
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGAGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTGTTCGCCAACTTCAACCAGGATAACAC  74

Query   75  GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGTTATAAATTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCT  148
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGGTATAAGTTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCT  148

Query  149  ATGAATGCACCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTGGCCATCGTGAGC  222
            ||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.|||
Sbjct  149  ATGAATGCACTGACACTGAAGATGTCTGCATTGTGGAGAGATTGTTCTCAAGCAGCTTGGTGGCCATTGTCAGC  222

Query  223  CTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTACAGCTACTCCAA  296
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCAAAGCTCCCAGGAAGCTGAAGGTTTGCCATTTTAAGAAGGGAACTGAGATATGCAACTACAGCTACTCCAA  296

Query  297  CACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGTACATCCACAACA  370
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  297  CACTATCCTGGCTGTGAAGCTGAACAGGCAGCGGCTCATTGTGTGTCTGGAAGAGTCGCTCTACATACACAACA  370

Query  371  TTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGTGCGCTGTCAATC  444
            |.||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct  371  TCCGGGACATGAAGGTACTTCATACCATCCGAGAGACACCCCCAAACCCTGCAGGCTTGTGTGCACTGTCAATA  444

Query  445  AACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTTCGATACCATTAA  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  AACAATGACAACTGCTACTTGGCGTATCCAGGGAGTGCGAGCATTGGAGAGGTGCAGGTCTTCGACACCATTAA  518

Query  519  TTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACGCAAGTGGAACTA  592
            .||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  CTTGAGAGCTGCAAACATGATCCCAGCTCATGATAGTCCCTTAGCAGCCCTGGCTTTTGATGCAAGTGGGACCA  592

Query  593  AACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAAAAACTCTTTGAG  666
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct  593  AGCTTGCCACTGCTTCTGAGAAGGGGACTGTGATTCGGGTGTTTTCCATTCCAGAGGGACAGAAGCTGTTTGAG  666

Query  667  TTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGC  740
            ||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAGGAGAGGAGTGAAGAGGTGTGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGC  740

Query  741  CTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAGAGGAGCCCACCA  814
            .|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||..||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  ATCCAGCAACACCGAAACAGTGCACATCTTCAAACTTGAGGCTGTGAGGGAAAAACCTCCGGAAGAGCCCACCA  814

Query  815  CCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTGACAGAAATGTTC  888
            |||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTGGACTGGCTACTTTGGGAAGGTTCTCATGGCATCTACCAGCTACCTGCCCTCACAAGTGACAGAAATGTTC  888

Query  889  AACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTCGCTAGCCACAAT  962
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  889  AACCAGGGCAGGGCCTTCGCCACTGTCCGCCTGCCATTCTGTGGCCACAAAAACATCTGCTCACTAACCACAAT  962

Query  963  TCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGG  1036
            ||||||||||||.||||||.||||.||.||..|.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGAAGATCCCACGGTTGCTGGTAGGAGCATCAGATGGCTATTTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGG  1036

Query 1037  GCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAGATCTTGGACTCT  1110
            |.|||||||||||.||||||...||||||.||||.||.||||||.||||.|||||||.|||.|||.|.||||||
Sbjct 1037  GAGGCGAGTGTGCGCTGATGCGTCAGCACAGGCTTGATGGCAGTATGGAGACGACCAGTGAAATCGTAGACTCT  1110

Query 1111  GCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAAGGTACTTACGTGCCTTCATC  1184
            ||.|||||.|||||||||||||..||.|||||.||||||.||||.||.|..||||||.|.||.|||||.||.||
Sbjct 1111  GCATCTCATGACTGCCCCTTAGCAACACAGACGTACGGCACAGCAGCTGCCAAAGGTGCCTATGTGCCCTCGTC  1184

Query 1185  CCCAACGAGACTT---------------------------GCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCG  1231
            |||.||.||||||                           |||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCCCACAAGACTTGGGAAAGGGCAGGACGCCAACTTAGAAGCCTACACAGATGACCTGGGTGCTGTGGGTGGTG  1258

Query 1232  CCTGCCTGGAGGACGAGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACT  1305
            |.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CATGCCTAGAGGATGAAGCCAGCGCTCTGCGCCTGGATGAAGACAGCGAACATCCTCCCATGATTCTCCGGACT  1332

Query 1306  GAC  1308
            |||
Sbjct 1333  GAC  1335