Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481109
- Subject:
- NM_001354703.2
- Aligned Length:
- 2094
- Identities:
- 1957
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGAGGCTCGCCGTGGGAGCCCTGCTGGTCTGCGCCGTCCTGGGGCTGTGTCTGGCTGTCCCTGATAAAACTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGATGGTGTGCAGTGTCGGAGCATGAGGCCACTAAGTGCCAGAGTTTCCGCGACCATATGAAAAGCGTCATTC 148
||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------ATGAAAAGCGTCATTC 16
Query 149 CATCCGATGGTCCCAGTGTTGCTTGTGTGAAGAAAGCCTCCTACCTTGATTGCATCAGGGCCATTGCGGCAAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 CATCCGATGGTCCCAGTGTTGCTTGTGTGAAGAAAGCCTCCTACCTTGATTGCATCAGGGCCATTGCGGCAAAC 90
Query 223 GAAGCGGATGCTGTGACACTGGATGCAGGTTTGGTGTATGATGCTTACCTGGCTCCCAATAACCTGAAGCCTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 GAAGCGGATGCTGTGACACTGGATGCAGGTTTGGTGTATGATGCTTACCTGGCTCCCAATAACCTGAAGCCTGT 164
Query 297 GGTGGCAGAGTTCTATGGGTCAAAAGAGGATCCACAGACTTTCTATTATGCTGTTGCTGTGGTGAAGAAGGATA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 GGTGGCAGAGTTCTATGGGTCAAAAGAGGATCCACAGACTTTCTATTATGCTGTTGCTGTGGTGAAGAAGGATA 238
Query 371 GTGGCTTCCAGATGAACCAGCTTCGAGGCAAGAAGTCCTGCCACACGGGTCTAGGCAGGTCCGCTGGGTGGAAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 GTGGCTTCCAGATGAACCAGCTTCGAGGCAAGAAGTCCTGCCACACGGGTCTAGGCAGGTCCGCTGGGTGGAAC 312
Query 445 ATCCCCATAGGCTTACTTTACTGTGACTTACCTGAGCCACGTAAACCTCTTGAGAAAGCAGTGGCCAATTTCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 ATCCCCATAGGCTTACTTTACTGTGACTTACCTGAGCCACGTAAACCTCTTGAGAAAGCAGTGGCCAATTTCTT 386
Query 519 CTCGGGCAGCTGTGCCCCTTGTGCGGATGGGACGGACTTCCCCCAGCTGTGTCAACTGTGTCCAGGGTGTGGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 CTCGGGCAGCTGTGCCCCTTGTGCGGATGGGACGGACTTCCCCCAGCTGTGTCAACTGTGTCCAGGGTGTGGCT 460
Query 593 GCTCCACCCTTAACCAATACTTCGGCTACTCAGGAGCCTTCAAGTGTCTGAAGAATGGTGCTGGGGATGTGGCC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 461 GCTCCACCCTTAACCAATACTTCGGCTACTCGGGAGCCTTCAAGTGTCTGAAGGATGGTGCTGGGGATGTGGCC 534
Query 667 TTTGTCAAGCACTCGACTATATTTGAGAACTTGGCAAACAAGGCTGACAGGGACCAGTATGAGCTGCTTTGCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 TTTGTCAAGCACTCGACTATATTTGAGAACTTGGCAAACAAGGCTGACAGGGACCAGTATGAGCTGCTTTGCCT 608
Query 741 GGACAACACCCGGAAGCCGGTAGATGAATACAAGGACTGCCACTTGGCCCAGGTCCCTTCTCATACCGTCGTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 GGACAACACCCGGAAGCCGGTAGATGAATACAAGGACTGCCACTTGGCCCAGGTCCCTTCTCATACCGTCGTGG 682
Query 815 CCCGAAGTATGGGCGGCAAGGAGGACTTGATCTGGGAGCTTCTCAACCAGGCCCAGGAACATTTTGGCAAAGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 CCCGAAGTATGGGCGGCAAGGAGGACTTGATCTGGGAGCTTCTCAACCAGGCCCAGGAACATTTTGGCAAAGAC 756
Query 889 AAATCAAAAGAATTCCAACTATTCAGCTCTCCTCATGGGAAGGACCTGCTGTTTAAGGACTCTGCCCACGGGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 AAATCAAAAGAATTCCAACTATTCAGCTCTCCTCATGGGAAGGACCTGCTGTTTAAGGACTCTGCCCACGGGTT 830
Query 963 TTTAAAAGTCCCCCCCAGGATGGATGCCAAGATGTACCTGGGCTATGAGTATGTCACTGCCATCCGGAATCTAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 TTTAAAAGTCCCCCCCAGGATGGATGCCAAGATGTACCTGGGCTATGAGTATGTCACTGCCATCCGGAATCTAC 904
Query 1037 GGGAAGGCACATGCCAAGAAGCCCCAACAGATGAATGCAAGCCTGTGAAGTGGTGTGCGCTGAGCCACCACGAG 1110
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 GGGAAGGCACATGCCCAGAAGCCCCAACAGATGAATGCAAGCCTGTGAAGTGGTGTGCGCTGAGCCACCACGAG 978
Query 1111 AGGCTCAAGTGTGATGAGTGGAGTGTTAACAGTGTAGGGAAAATAGAGTGTGTATCAGCAGAGACCACCGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 AGGCTCAAGTGTGATGAGTGGAGTGTTAACAGTGTAGGGAAAATAGAGTGTGTATCAGCAGAGACCACCGAAGA 1052
Query 1185 CTGCATCGCCAAGATCATGAATGGAGAAGCTGATGCCATGAGCTTGGATGGAGGGTTTGTCTACATAGCGGGCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 CTGCATCGCCAAGATCATGAATGGAGAAGCTGATGCCATGAGCTTGGATGGAGGGTTTGTCTACATAGCGGGCA 1126
Query 1259 AGTGTGGTCTGGTGCCNGTCTTGGCAGAAAACTACAATAAGAGCGATAATTGTGAGGATACACCAGAGGCAGGG 1332
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127 AGTGTGGTCTGGTGCCTGTCTTGGCAGAAAACTACAATAAGAGCGATAATTGTGAGGATACACCAGAGGCAGGG 1200
Query 1333 TATTTTGCTGTAGCAGTGGTGAAGAAATCAGCTTCTGACCTCACCTGGGACAATCTGAAAGGCAAGAAGTCCTG 1406
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TATTTTGCTATAGCAGTGGTGAAGAAATCAGCTTCTGACCTCACCTGGGACAATCTGAAAGGCAAGAAGTCCTG 1274
Query 1407 CCATACGGCAGTTGGCAGAACCGCTGGCTGGAACATCCCCATGGGCCTGCTCTACAATAAGATCAACCACTGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 CCATACGGCAGTTGGCAGAACCGCTGGCTGGAACATCCCCATGGGCCTGCTCTACAATAAGATCAACCACTGCA 1348
Query 1481 GATTTGATGAATTTTTCAGTGAAGGTTGTGCCCCTGGGTCTAAGAAAGACTCCAGTCTCTGTAAGCTGTGTATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 GATTTGATGAATTTTTCAGTGAAGGTTGTGCCCCTGGGTCTAAGAAAGACTCCAGTCTCTGTAAGCTGTGTATG 1422
Query 1555 GGCTCAGGCCTAAACCTGTGTGAACCCAACAACAAAGAGGGATACTACGGCTACACAGGCGCTTTCAGGTGTCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 GGCTCAGGCCTAAACCTGTGTGAACCCAACAACAAAGAGGGATACTACGGCTACACAGGCGCTTTCAGGTGTCT 1496
Query 1629 GGTTGAGAAGGGAGATGTGGCCTTTGTGAAACACCAGACTGTCCCACAGAACACTGGGGGAAAAAACCCTGATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 GGTTGAGAAGGGAGATGTGGCCTTTGTGAAACACCAGACTGTCCCACAGAACACTGGGGGAAAAAACCCTGATC 1570
Query 1703 CATGGGCTAAGAATCTGAATGAAAAAGACTATGAGTTGCTGTGCCTTGATGGTACCAGGAAACCTGTGGAGGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 CATGGGCTAAGAATCTGAATGAAAAAGACTATGAGTTGCTGTGCCTTGATGGTACCAGGAAACCTGTGGAGGAG 1644
Query 1777 TATGCGAACTGCCACCTGGCCAGAGCCCCGAATCACGCTGTGGTCACACGGAAAGATAAGGAAGCTTGCGTCCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 TATGCGAACTGCCACCTGGCCAGAGCCCCGAATCACGCTGTGGTCACACGGAAAGATAAGGAAGCTTGCGTCCA 1718
Query 1851 CAAGATATTACGTCAACAGCAGCACCTATTTGGAAGCAACGTAACTGACTGCTCGGGCAACTTTTGTTTGTTCC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719 CAAGATATTACGTCAACAGCAGCACCTATTTGGAAGCAACGTAACTGACTGCTCGGGCAACTTTTGTTTGTTCC 1792
Query 1925 GGTCGGAAACCAAGGACCTTCTGTTCAGAGATGACACAGTATGTTTGGCCAAACTTCATGACAGAAACACATAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 GGTCGGAAACCAAGGACCTTCTGTTCAGAGATGACACAGTATGTTTGGCCAAACTTCATGACAGAAACACATAT 1866
Query 1999 GAAAAATACTTAGGAGAAGAATATGTCAAGGCTGTTGGTAACCTGAGAAAATGCTCCACCTCATCACTCCTGGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 GAAAAATACTTAGGAGAAGAATATGTCAAGGCTGTTGGTAACCTGAGAAAATGCTCCACCTCATCACTCCTGGA 1940
Query 2073 AGCCTGCACTTTCCGTAGACCT 2094
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 AGCCTGCACTTTCCGTAGACCT 1962