Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481156
- Subject:
- NM_001134382.3
- Aligned Length:
- 3342
- Identities:
- 2441
- Gaps:
- 900
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTTGCAGAAGACGCTATTTCGTCGAGGGCGAGGCCCCCAGCAGTGAGACTGGCACATCCCTGGACAGCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCAGCCTACCCCCAGGGCCCCTTGGTGCCCGGTTCCAGCCTGAGCCCGGATCACTACGAGCACACGTCAGTGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GAGCCTATGGGCTGTACTCGGGGCCGCCGGGGCAACAGCAGCGCACGCGGAGGCCCAAGCTGCAGCACTCGACC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCCATCCTGCGCAAGCAGGCTGAGGAGGAGGCCATCAAGCGCTCACGCTCACTCTCCGAGAGCTATGAGCTCTC 296
Query 1 ----------------------------ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGG 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCGGACCTGCAGGACAAGCAGGTGGAGATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGG 370
Query 47 CCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAGTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAGTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCA 444
Query 121 GAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGT 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCTGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGT 518
Query 195 GCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGGTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCC 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGGTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCC 592
Query 269 CTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACCACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACCACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATC 666
Query 343 ACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCAAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCG 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCAAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCG 740
Query 417 CAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCCTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGC 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCCTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGC 814
Query 491 ACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAGATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAGATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAG 888
Query 565 GAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCAGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACG 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCAGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACG 962
Query 639 GGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGGCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCC 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGGCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCC 1036
Query 713 GGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGNGCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCA 786
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGAGCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCA 1110
Query 787 CCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCG 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCG 1184
Query 861 CAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCAAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGG 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCAAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGG 1258
Query 935 AGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGGCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAG 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGGCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAG 1332
Query 1009 AGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGGTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCAT 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGGTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCAT 1406
Query 1083 CAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTGACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGG 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTGACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGG 1480
Query 1157 AGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCCTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTG 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCCTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTG 1554
Query 1231 AACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGT 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGT 1628
Query 1305 CGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGC 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGC 1702
Query 1379 AGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGACTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAG 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGACTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAG 1776
Query 1453 GCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCGTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTT 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCGTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTT 1850
Query 1527 CAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTGGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTGGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGG 1924
Query 1601 CCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAG 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGACATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAG 1998
Query 1675 GACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGA 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGA 2072
Query 1749 ACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCAATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTG 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCAATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTG 2146
Query 1823 TGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCATCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTC 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCATCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTC 2220
Query 1897 TGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTT 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTT 2294
Query 1971 CCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGAC 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCAAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGAC 2368
Query 2045 AGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACC 2118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTCCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACC 2442
Query 2119 TCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGTGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATT 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGTGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATT 2516
Query 2193 CACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGGAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGA 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGGAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGA 2590
Query 2267 AGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATGTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTG 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATGTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTG 2664
Query 2341 AGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGCCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCG 2414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGCCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCG 2738
Query 2415 GGACCTCTCGGAAGCCG--------------------------------------------------GGGTCCA 2438
||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2739 GGACCTCTCGGAAGCCGGGAAGCGAGGGCGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGGTCCA 2812
Query 2439 TCAT---------------------------------------------------------------------- 2442
||||
Sbjct 2813 TCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGAGAGCTACATCAACACGAGAGTGTCCATCTCGCCCACACCAGACTATG 2886
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2887 CCCAACTCATCTTCCCTCCTGGGCTCCTTATTCGGGAGCAAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCTGCC 2960
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2961 CTCAGCCCCAGCCCTGCCACCCCCCCACCCACCGGTGGTCCTGCCTCACTTGCAGCACTCTGTGGCTGGCCACC 3034
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 3035 ACCTGGGGCCCCCAGAGGGGCTGCCGCAGGCCGCCATGCACGGGCATCACACCCAGTACTGCCACATGCAGAAC 3108
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 3109 CCTCCCCCGTACCACCATCACCACCACCACCACCCACCCCAGCACATCCAGCACGCACACCAGTACCACCACGG 3182
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 3183 CCCCCATGGGGGCCACCCAGCCTACGGGGCCCATGCCCACGGCCACCCGCCGCTGCCCTCGGCCCACGTGGGGC 3256
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 3257 ACACAGTGCACCACCATGGGCAGCCCCCTGCCCCGCCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAACCCAGCGGCATC 3330
Query 2443 ------------ 2442
Sbjct 3331 AGCACAATTGTG 3342