Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481156
- Subject:
- XM_006505992.2
- Aligned Length:
- 2980
- Identities:
- 2159
- Gaps:
- 542
Alignment
Query 1 ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA 74
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCTAGAACGCAAGTATGGGGGACGCCTCGTGACCCGCCATGCAGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTCCGCCA 74
Query 75 GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC 148
.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 ATACCAGATGAACAAGAACTTTGAGCGCCTGCGCAGCTCCATGTCGGAGAACCGCATGTCACGTCGCATTGTGC 148
Query 149 TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 149 TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGCCCCGAGAAGGTGCACAGCTCCTACTTTGAGGGAAAGCAG 222
Query 223 GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC 296
|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|.||.|||||.|||||.||.|| ||||
Sbjct 223 GTCTCTGTGACTAATGATGGCTCCCAGCTGGGGGCCCTGGTGCCATCAGAATGTGGAGACCTTAGTGA-CCCA- 294
Query 297 CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC 370
.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 295 -GCCCTCAAGTCTCCAGCCCCCTCCAGTGACTTTGCAGATGCCATCACGGAACTGGAGGATGCCTTCTCCAGGC 367
Query 371 AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC 444
|.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|||.|||
Sbjct 368 AGGTGAAATCCCTGGCTGAATCCATCGATGATGCCCTCAATTGCCGCAGCCTACACAGTGAGGAGGTACCAGCC 441
Query 445 CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA 518
...||..||||.|||||.||||||||.||.|||.|..|||..||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 442 TCAGACACGGCCCGGGCTCGGGACACTGAGCCCAAACCAGGTCTACATGGCATGGACCACCGCAAACTGGATGA 515
Query 519 GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC 592
||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 516 GATGACAGCCTCGTATAGTGATGTGACCCTCTACATTGATGAGGAAGAGCTGTCACCACCGCTTCCACTCTCAC 589
Query 593 AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG 666
||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||.|||||||.|||||||..|||||||||
Sbjct 590 AGGCTGGCGATCGGCCCTCCAGCACAGAGTCGGACCTGCGGCTGAGGTCTGGGGGTGCAGCCCAGGACTACTGG 663
Query 667 GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGN 740
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||..|.
Sbjct 664 GCCTTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACAAGCTGCCGAAGCACACCATCACTGGAGCGGCCAGA 737
Query 741 GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG 814
||..|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 738 GCCACGGCTGCGGGTGGAGCACCTGCCCCTGCTTACCATTGAGCCACCCAGTGATAGCTCCGTGGAACTCAGTG 811
Query 815 ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC 888
|||||||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 812 ACCGCTCAGATCGCAGCTCACTCAAGAGGCAGAGTGCCTATGAGCGCAGCCTCGGTGGGCAGCAGGGCAGCCCC 885
Query 889 AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG 962
||||||||.||||||.|.|||.|||||||..||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 886 AAGCATGGCCCCCACGGTGGCCCCCCCAAAGGCCTCCCCAGGGAGGAACCTGAATTGCGGCCTCGGCCCCCCAG 959
Query 963 GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG 1036
.||.||.||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 960 ACCTCTTGAGAGTCACCTAGCCATCAATGGTTCAGCCAACCGGCAGAGCAAATCTGAGTCTGACTACTCAGATG 1033
Query 1037 GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT 1110
|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1034 GGGACAATGACAGCATCAACAGCACCTCCAACTCCAATGACACCATAAACTGCAGCTCTGAGTCCTCATCACGG 1107
Query 1111 GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC 1184
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1108 GACAGCCTGCGGGAACAGACACTCAGCAAGCAGACATACCACAAGGAGACCCGCAACAGCTGGGACTCTCCAGC 1181
Query 1185 CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG 1258
.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TTTCAGCAACGATGTCATCCGTAAGAGGCATTACCGAATTGGCCTAAATCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG 1255
Query 1259 GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC 1332
|..|||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GCATCCAGTATCTCATTGAGCGCGGCTTCGTGCCCGACACGCCAGTGGGAGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC 1329
Query 1333 AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA 1406
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1330 AAGGGCCTCAGCCGCCAGATGATCGGTGAGTTCCTGGGAAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGATGTGCTCGA 1403
Query 1407 CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC 1480
|||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1404 CTGTGTTGTGGACGAGATGGACTTCTCTGCCATGGAGCTAGATGAAGCCCTCCGGAAGTTCCAGGCACACATCC 1477
Query 1481 GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT 1554
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.
Sbjct 1478 GAGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATCGAGGCATTCAGCCAGCGGTACTGTGTCTGCAACCCA 1551
Query 1555 GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA 1628
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552 GGGGTGGTGCGACAGTTCCGGAACCCAGACACCATCTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTCAACACAGA 1625
Query 1629 CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG 1702
||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCAGAGCGCAAAATGAAGCTGGAGGACTTTGTCAAGAACCTCCGAGGTGTGG 1699
Query 1703 ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC 1776
|.||.|||||.|||||||||||.||||.|||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1700 ATGACGGTGAAGACATTCCCCGGGAGACGCTAATTGGGATCTATGAGCGAATCCGTAAGCGAGAACTGAAGACC 1773
Query 1777 AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCA 1850
||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774 AACGAGGACCACGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTTGAGAAGCTCATCGTGGGCAAGAAGCCGATTGGATCCCTGCA 1847
Query 1851 TCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG 1924
||..||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1848 TCATGGTCTTGGCTGTGTGCTGTCTCTTCCCCATCGACGACTAGTCTGCTACTGCCGGCTTTTTGAAGTTCCTG 1921
Query 1925 ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC 1998
||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1922 ACCCCAACAAACCCCAGAAGCTGGGACTACACCAGCGAGAGATCTTCCTGTTTAATGACCTCCTGGTGGTCACC 1995
Query 1999 AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1996 AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACATACAGCTTCCGGCAGTCCTTCTCCCTCTACGGCATGCAGGT 2069
Query 2073 CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG 2146
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||..|||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2070 CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTATCCCAATGGCATCCGGCTGACGTCTGCTGTCCCTGGAGCAGACATCAAAG 2143
Query 2147 TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG 2220
||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 2144 TGCTAATAAACTTCAACGCTCCCAATCCTCAGGACCGGAAGAAGTTCACTGACGACCTGCGGGAGTCTGTCGCT 2217
Query 2221 GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT 2294
|||||.||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2218 GAAGTGCAAGAGATGGAGAAACACCGAATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGTGTCGTGCGGCCCAGCAT 2291
Query 2295 GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG 2368
|||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2292 GTCACAGTGCTCCAGCCTCAAAAAGGAGTCAGGCAACGGGACACTGAGCAGGGCTTGCCTGGATGACAGCTATG 2365
Query 2369 CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGG-------- 2434
||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||| |||||
Sbjct 2366 CCAGTGGCGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCACTGAGAGACCTCTCAGAAG-CGGGGAAGCGAGG 2438
Query 2435 -------------------------------------------TCCATCAT----------------------- 2442
||||||||
Sbjct 2439 GCGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGCTCCATCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGA 2512
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2513 GAGCGACCTCAACACGAGAGTGCCCATCTCGCCCCCCCCAGCCCGTGCCTAACTCCTCCTCTCTCCTGGGTTCT 2586
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2587 TTGTTTGGGAGCAGGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCCACCCTCAGCCCCTCCCCCAGCACCCCCTCA 2660
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2661 CGCCCATCACCCTGGGCCCTCAGAAGGCCCACTGCATGGACATCATGCACAGTACTGCCATGCACAGCAGAATC 2734
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2735 CTCCGCCCTATCACCACCACCACCACTACCACCCACCCCCCCACCTGCAGCACACCCACCAGTACCACCATGGC 2808
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2809 CCACACGGCGGGCACCCCCCGTATGGGGCCCATGCACACAGCCACCCGCCTCTGCCCACAGCTCACCCTGGTCA 2882
Query 2443 -------------------------------------------------------------------------- 2442
Sbjct 2883 TGCAGGGCACTCAGCGCATCATCATGGGCAGCCCCCTGCCCCACCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAGCCCA 2956
Query 2443 -------------------- 2442
Sbjct 2957 GCGGCATCAGCACAGTTGTG 2976