Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481156
• Subject: XM_017321533.1
• Aligned Length: 2980
• Identities: 2159
• Gaps: 542

Alignment

Query    1  ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA  74
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCTAGAACGCAAGTATGGGGGACGCCTCGTGACCCGCCATGCAGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTCCGCCA  74

Query   75  GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC  148
            .||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  ATACCAGATGAACAAGAACTTTGAGCGCCTGCGCAGCTCCATGTCGGAGAACCGCATGTCACGTCGCATTGTGC  148

Query  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGCCCCGAGAAGGTGCACAGCTCCTACTTTGAGGGAAAGCAG  222

Query  223  GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC  296
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|.||.|||||.|||||.||.|| |||| 
Sbjct  223  GTCTCTGTGACTAATGATGGCTCCCAGCTGGGGGCCCTGGTGCCATCAGAATGTGGAGACCTTAGTGA-CCCA-  294

Query  297  CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC  370
             .|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  295  -GCCCTCAAGTCTCCAGCCCCCTCCAGTGACTTTGCAGATGCCATCACGGAACTGGAGGATGCCTTCTCCAGGC  367

Query  371  AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC  444
            |.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|||.|||
Sbjct  368  AGGTGAAATCCCTGGCTGAATCCATCGATGATGCCCTCAATTGCCGCAGCCTACACAGTGAGGAGGTACCAGCC  441

Query  445  CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA  518
            ...||..||||.|||||.||||||||.||.|||.|..|||..||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  442  TCAGACACGGCCCGGGCTCGGGACACTGAGCCCAAACCAGGTCTACATGGCATGGACCACCGCAAACTGGATGA  515

Query  519  GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC  592
            ||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  516  GATGACAGCCTCGTATAGTGATGTGACCCTCTACATTGATGAGGAAGAGCTGTCACCACCGCTTCCACTCTCAC  589

Query  593  AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG  666
            ||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||.|||||||.|||||||..|||||||||
Sbjct  590  AGGCTGGCGATCGGCCCTCCAGCACAGAGTCGGACCTGCGGCTGAGGTCTGGGGGTGCAGCCCAGGACTACTGG  663

Query  667  GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGN  740
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||..|.
Sbjct  664  GCCTTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACAAGCTGCCGAAGCACACCATCACTGGAGCGGCCAGA  737

Query  741  GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG  814
            ||..|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  738  GCCACGGCTGCGGGTGGAGCACCTGCCCCTGCTTACCATTGAGCCACCCAGTGATAGCTCCGTGGAACTCAGTG  811

Query  815  ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC  888
            |||||||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  812  ACCGCTCAGATCGCAGCTCACTCAAGAGGCAGAGTGCCTATGAGCGCAGCCTCGGTGGGCAGCAGGGCAGCCCC  885

Query  889  AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG  962
            ||||||||.||||||.|.|||.|||||||..||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  886  AAGCATGGCCCCCACGGTGGCCCCCCCAAAGGCCTCCCCAGGGAGGAACCTGAATTGCGGCCTCGGCCCCCCAG  959

Query  963  GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG  1036
            .||.||.||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  960  ACCTCTTGAGAGTCACCTAGCCATCAATGGTTCAGCCAACCGGCAGAGCAAATCTGAGTCTGACTACTCAGATG  1033

Query 1037  GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT  1110
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1034  GGGACAATGACAGCATCAACAGCACCTCCAACTCCAATGACACCATAAACTGCAGCTCTGAGTCCTCATCACGG  1107

Query 1111  GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC  1184
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1108  GACAGCCTGCGGGAACAGACACTCAGCAAGCAGACATACCACAAGGAGACCCGCAACAGCTGGGACTCTCCAGC  1181

Query 1185  CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1258
            .||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TTTCAGCAACGATGTCATCCGTAAGAGGCATTACCGAATTGGCCTAAATCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1255

Query 1259  GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1332
            |..|||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  GCATCCAGTATCTCATTGAGCGCGGCTTCGTGCCCGACACGCCAGTGGGAGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1329

Query 1333  AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA  1406
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1330  AAGGGCCTCAGCCGCCAGATGATCGGTGAGTTCCTGGGAAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGATGTGCTCGA  1403

Query 1407  CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC  1480
            |||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1404  CTGTGTTGTGGACGAGATGGACTTCTCTGCCATGGAGCTAGATGAAGCCCTCCGGAAGTTCCAGGCACACATCC  1477

Query 1481  GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT  1554
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.
Sbjct 1478  GAGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATCGAGGCATTCAGCCAGCGGTACTGTGTCTGCAACCCA  1551

Query 1555  GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA  1628
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552  GGGGTGGTGCGACAGTTCCGGAACCCAGACACCATCTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTCAACACAGA  1625

Query 1629  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCAGAGCGCAAAATGAAGCTGGAGGACTTTGTCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1699

Query 1703  ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC  1776
            |.||.|||||.|||||||||||.||||.|||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1700  ATGACGGTGAAGACATTCCCCGGGAGACGCTAATTGGGATCTATGAGCGAATCCGTAAGCGAGAACTGAAGACC  1773

Query 1777  AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCA  1850
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774  AACGAGGACCACGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTTGAGAAGCTCATCGTGGGCAAGAAGCCGATTGGATCCCTGCA  1847

Query 1851  TCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG  1924
            ||..||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1848  TCATGGTCTTGGCTGTGTGCTGTCTCTTCCCCATCGACGACTAGTCTGCTACTGCCGGCTTTTTGAAGTTCCTG  1921

Query 1925  ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC  1998
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1922  ACCCCAACAAACCCCAGAAGCTGGGACTACACCAGCGAGAGATCTTCCTGTTTAATGACCTCCTGGTGGTCACC  1995

Query 1999  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1996  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACATACAGCTTCCGGCAGTCCTTCTCCCTCTACGGCATGCAGGT  2069

Query 2073  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||..|||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2070  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTATCCCAATGGCATCCGGCTGACGTCTGCTGTCCCTGGAGCAGACATCAAAG  2143

Query 2147  TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG  2220
            ||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct 2144  TGCTAATAAACTTCAACGCTCCCAATCCTCAGGACCGGAAGAAGTTCACTGACGACCTGCGGGAGTCTGTCGCT  2217

Query 2221  GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT  2294
            |||||.||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2218  GAAGTGCAAGAGATGGAGAAACACCGAATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGTGTCGTGCGGCCCAGCAT  2291

Query 2295  GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG  2368
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2292  GTCACAGTGCTCCAGCCTCAAAAAGGAGTCAGGCAACGGGACACTGAGCAGGGCTTGCCTGGATGACAGCTATG  2365

Query 2369  CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGG--------  2434
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||| |||||        
Sbjct 2366  CCAGTGGCGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCACTGAGAGACCTCTCAGAAG-CGGGGAAGCGAGG  2438

Query 2435  -------------------------------------------TCCATCAT-----------------------  2442
                                                       ||||||||                       
Sbjct 2439  GCGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGCTCCATCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGA  2512

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2513  GAGCGACCTCAACACGAGAGTGCCCATCTCGCCCCCCCCAGCCCGTGCCTAACTCCTCCTCTCTCCTGGGTTCT  2586

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2587  TTGTTTGGGAGCAGGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCCACCCTCAGCCCCTCCCCCAGCACCCCCTCA  2660

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2661  CGCCCATCACCCTGGGCCCTCAGAAGGCCCACTGCATGGACATCATGCACAGTACTGCCATGCACAGCAGAATC  2734

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2735  CTCCGCCCTATCACCACCACCACCACTACCACCCACCCCCCCACCTGCAGCACACCCACCAGTACCACCATGGC  2808

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2809  CCACACGGCGGGCACCCCCCGTATGGGGCCCATGCACACAGCCACCCGCCTCTGCCCACAGCTCACCCTGGTCA  2882

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2883  TGCAGGGCACTCAGCGCATCATCATGGGCAGCCCCCTGCCCCACCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAGCCCA  2956

Query 2443  --------------------  2442
                                
Sbjct 2957  GCGGCATCAGCACAGTTGTG  2976