Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481156
• Subject: XM_024453845.1
• Aligned Length: 3018
• Identities: 2411
• Gaps: 606

Alignment

Query    1  ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA  74

Query   75  GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC  148

Query  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG  222

Query  223  GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC  296

Query  297  CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC  370

Query  371  AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC  444

Query  445  CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA  518

Query  519  GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC  592

Query  593  AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG  666

Query  667  GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGN  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  667  GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGA  740

Query  741  GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG  814

Query  815  ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC  888

Query  889  AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG  962

Query  963  GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG  1036

Query 1037  GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT  1110

Query 1111  GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC  1184

Query 1185  CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1258

Query 1259  GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1332

Query 1333  AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA  1406

Query 1407  CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC  1480

Query 1481  GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT  1554

Query 1555  GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA  1628

Query 1629  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1702

Query 1703  ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC  1776

Query 1777  AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 1777  AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCG--------------  1836

Query 1851  TCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG  1924
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837  ----------------GTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG  1894

Query 1925  ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895  ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC  1968

Query 1999  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT  2042

Query 2073  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG  2116

Query 2147  TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117  TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG  2190

Query 2221  GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191  GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT  2264

Query 2295  GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265  GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG  2338

Query 2369  CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCG-----------  2431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 2339  CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGAAGCGAGGG  2412

Query 2432  ---------------------------------------GGGTCCATCAT------------------------  2442
                                                   |||||||||||                        
Sbjct 2413  CGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGGTCCATCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGAG  2486

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2487  AGCTACATCAACACGAGAGTGTCCATCTCGCCCACACCAGACTATGCCCAACTCATCTTCCCTCCTGGGCTCCT  2560

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2561  TATTCGGGAGCAAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCTGCCCTCAGCCCCAGCCCTGCCACCCCCCCAC  2634

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2635  CCACCGGTGGTCCTGCCTCACTTGCAGCACTCTGTGGCTGGCCACCACCTGGGGCCCCCAGAGGGGCTGCCGCA  2708

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2709  GGCCGCCATGCACGGGCATCACACCCAGTACTGCCACATGCAGAACCCTCCCCCGTACCACCATCACCACCACC  2782

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2783  ACCACCCACCCCAGCACATCCAGCACGCACACCAGTACCACCACGGCCCCCATGGGGGCCACCCAGCCTACGGG  2856

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2857  GCCCATGCCCACGGCCACCCGCCGCTGCCCTCGGCCCACGTGGGGCACACAGTGCACCACCATGGGCAGCCCCC  2930

Query 2443  ----------------------------------------------------------  2442
                                                                      
Sbjct 2931  TGCCCCGCCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAACCCAGCGGCATCAGCACAATTGTG  2988