Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000481171
Subject:
XM_017029600.2
Aligned Length:
1869
Identities:
1866
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAGAAAGTGCGGTTAAGGATTCTCAGCCTTCTCTTGATTTGGCAAGTGCTACCAGTGGAGATAAAAT  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCAGAAAGTACGGTTAAGGATTCTCAGCCTTCTCTTGATTTGGCAAGTGCTACCAGTGGAGATAAAAT  74

Query   75  AGTTACCGCCCAGGAAAATGGAAAAGCACCTGATGGGCAGACTGTAGCAGGTGAAGTGATGGGCCCTCAGAGAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTACCGCCCAGGAAAATGGAAAAGCACCTGATGGGCAGACTGTAGCAGGTGAAGTGATGGGCCCTCAGAGAC  148

Query  149  CTAGATCCAACTCTGGGAGAGAGCTTACTGATGAGGAAATTTTAGCCAGTGTAATGATTAAGAACCTGGATACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTAGATCCAACTCTGGGAGAGAGCTTACTGATGAGGAAATTTTAGCCAGTGTAATGATTAAGAACCTGGATACT  222

Query  223  GGAGAAGAAATACCTTTGAGTCTTGCAGAAGAGAAACTACCAACAGGCATTAATCCTCTCACTCTACACATCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGAAGAAATACCTTTGAGTCTTGCAGAAGAGAAACTACCAACAGGCATTAATCCTCTCACTCTACACATCAT  296

Query  297  GAGAAGGACAAAAGAATATGTAAGTAATGACGCGGCACAGTCAGATGATGAAGAGAAGTTACAGTCTCAGCCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGAAGGACAAAAGAATATGTAAGTAATGACGCGGCACAGTCAGATGATGAAGAGAAGTTACAGTCTCAGCCAA  370

Query  371  CAGATACTGATGGTGGAAGGTTAAAACAGAAAACGACTCAACTAAAGAAGTTTCTTGGAAAATCAGTAAAGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGATACTGATGGTGGAAGGTTAAAACAGAAAACGACTCAACTAAAGAAGTTTCTTGGAAAATCAGTAAAGAGA  444

Query  445  GCAAAGCACCTTGCTGAGGAATATGGTGAACGTGCTATAAATAAAGTTAAAAGTGTTAGAGATGAAGTGTTTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAAAGCACCTTGCTGAGGAATATGGTGAACGTGCTATAAATAAAGTTAAAAGTGTTAGAGATGAAGTGTTTCA  518

Query  519  TACTGATCAAGATGATCCTTCATCAAGTGATGATGAAGGAATGCCATACACAAGACCAGTTAAATTCAAAGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACTGATCAAGATGATCCTTCATCAAGTGATGATGAAGGAATGCCATACACAAGACCAGTTAAATTCAAAGCAG  592

Query  593  CACACGGTTTTAAAGGACCTTATGATTTTGATCAGATCAAAGTGGTGCAAGATCTTAGTGGTGAACATATGGGA  666
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACACGGTTTCAAAGGACCTTATGATTTTGATCAGATCAAAGTGGTGCAAGATCTTAGTGGTGAACATATGGGA  666

Query  667  GCTGTTTGGACCATGAAATTTTCTCACTGTGGCCGATTACTTGCCTCAGCTGGACAAGACAATGTAGTGAGAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGTTTGGACCATGAAATTTTCTCACTGTGGCCGATTACTTGCCTCAGCTGGACAAGACAATGTAGTGAGAAT  740

Query  741  ATGGGCTTTAAAAAATGCTTTTGACTATTTCAACAATATGCGAATGAAATACAATACTGAAGGACGTGTGTCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGGGCTTTAAAAAATGCTTTTGACTATTTCAACAATATGCGAATGAAATACAATACTGAAGGACGTGTGTCCC  814

Query  815  CATCACCCTCTCAGGAAAGTCTAAGTTCATCAAAATCGGATACAGATACAGGGGTATGCAGTGGAACTGATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATCACCCTCTCAGGAAAGTCTAAGTTCATCAAAATCGGATACAGATACAGGGGTATGCAGTGGAACTGATGAA  888

Query  889  GACCCTGATGATAAAAACGCACCCTTTCGGCAACGGCCATTTTGCAAATATAAAGGACATACTGCTGATCTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCTGATGATAAAAACGCACCCTTTCGGCAACGGCCATTTTGCAAATATAAAGGACATACTGCTGATCTCCT  962

Query  963  TGATCTTTCATGGTCTAAAAACTACTTTCTTCTTTCTTCTTCAATGGATAAAACAGTCAGATTATGGCACATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATCTTTCATGGTCTAAAAACTACTTTCTTCTTTCTTCTTCAATGGATAAAACAGTCAGATTATGGCACATTT  1036

Query 1037  CTCGAAGAGAATGCCTTTGCTGTTTTCAACATATAGATTTTGTCACTGCCATAGCTTTTCATCCAAGAGATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGAAGAGAATGCCTTTGCTGTTTTCAACATATAGATTTTGTCACTGCCATAGCTTTTCATCCAAGAGATGAC  1110

Query 1111  AGGTATTTTCTAAGTGGGTCTTTGGATGGAAAGCTCCGCCTTTGGAACATACCTGACAAAAAAGTGGCTTTGTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGTATTTTCTAAGTGGGTCTTTGGATGGAAAGCTCCGCCTTTGGAACATACCTGACAAAAAAGTGGCTTTGTG  1184

Query 1185  GAATGAAGTAGATGGTCAGACAAAATTGATCACAGCTGCAAATTTCTGTCAGAATGGCAAATATGCAGTGATTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAATGAAGTAGATGGTCAGACAAAATTGATCACAGCTGCAAATTTCTGTCAGAATGGCAAATATGCAGTGATTG  1258

Query 1259  GGACATATGATGGCAGATGTATTTTCTATGATACAGAGCATTTGAAATACCATACACAAATACATGTCCGATCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGACATATGATGGCAGATGTATTTTCTATGATACAGAGCATTTGAAATACCATACACAAATACATGTCCGATCT  1332

Query 1333  ACTAGAGGGCGCAACAAGGTTGGAAGAAAAATTACTGGCATTGAGCCTTTACCTGGAGAAAATAAGATATTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTAGAGGGCGCAACAAGGTTGGAAGAAAAATTACTGGCATTGAGCCTTTACCTGGAGAAAATAAGATATTGGT  1406

Query 1407  AACCTCAAATGACTCCAGAATCAGACTATATGATTTGAGAGATTTGTCACTATCCATGAAGTATAAGGGTTACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACCTCAAATGACTCCAGAATCAGACTATATGATTTGAGAGATTTGTCACTATCCATGAAGTATAAGGGTTACG  1480

Query 1481  TCAATAGCAGCAGCCAGATCAAAGCAAGTTTCAGCCATGATTTTACTTACCTCGTTAGTGGTTCAGAAGATAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCAATAGCAGCAGCCAGATCAAAGCAAGTTTCAGCCATGATTTTACTTACCTCGTTAGTGGTTCAGAAGATAAG  1554

Query 1555  TATGTTTATATCTGGAGTACCTACCATGACCTAAGCAAGTTTACTTCAGTCAGGAGAGATCGTAATGACTTCTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATGTTTATATCTGGAGTACCTACCATGACCTAAGCAAGTTTACTTCAGTCAGGAGAGATCGTAATGACTTCTG  1628

Query 1629  GGAAGGTATTAAAGCCCACAATGCAGTTGTTACATCAGCCATCTTTGCACCAAACCCAAGTTTGATGTTATCTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAAGGTATTAAAGCCCACAATGCAGTTGTTACATCAGCCATCTTTGCACCAAACCCAAGTTTGATGTTATCTT  1702

Query 1703  TGGATGTGCAATCTGAAAAATCAGAAGGGAACGAGAAAAGTGAAGATGCTGAAGTTTTGGATGCCACACCTTCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGATGTGCAATCTGAAAAATCAGAAGGGAACGAGAAAAGTGAAGATGCTGAAGTTTTGGATGCCACACCTTCT  1776

Query 1777  GGTATTATGAAGACAGATAACACAGAAGTTCTTCTCTCTGCTGACTTCACTGGAGCAATCAAAGTGTTTGTTAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTATTATGAAGACAGATAACACAGAAGTTCTTCTCTCTGCTGACTTCACTGGAGCAATCAAAGTGTTTGTTAA  1850

Query 1851  CAAAAGAAAAAATGTATCT  1869
            .||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TAAAAGAAAAAATGTATCT  1869