Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481247
- Subject:
- NM_001278543.1
- Aligned Length:
- 1773
- Identities:
- 1617
- Gaps:
- 156
Alignment
Query 1 ATGAAGAATTCCAGGACATGGGCTTGGAGGGCGCCGGTGGAGCTATTTCTTCTCTGTGCTGCCCTGGGCTGTCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAGTTTGCCTGGCTCCAGAGGTGAAAGGCCACATTCCTTTGGGTCAAATGCAGTCAACAAGAGCTTTGCTAAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCAGACAGATGCGGAGTGTGGATGTTACCCTGATGCCCATTGATTGTGAGCTGTCTAGTTGGTCCTCTTGGACC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------ATGCGGAGTGTGGATGTTACCCTGATGCCCATTGATTGTGAGCTGTCTAGTTGGTCCTCTTGGACC 66
Query 223 ACATGTGACCCCTGTCAGAAGAAAAGGTACAGGTATGCCTACTTGCTCCAGCCCTCTCAGTTCCATGGGGAACC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 ACATGTGACCCCTGTCAGAAGAAAAGGTACAGGTATGCCTACTTGCTCCAGCCCTCTCAGTTCCATGGGGAACC 140
Query 297 GTGCAACTTCTCTGACAAGGAAGTCGAAGACTGTGTTACCAACAGACCATGCAGAAGTCAAGTGCGATGTGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 GTGCAACTTCTCTGACAAGGAAGTCGAAGACTGTGTTACCAACAGACCATGCAGAAGTCAAGTGCGATGTGAAG 214
Query 371 GCTTTGTGTGTGCACAGACAGGAAGGTGTGTAAACCGCAGACTTCTTTGCAATGGGGACAATGACTGTGGAGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 GCTTTGTGTGTGCACAGACAGGAAGGTGTGTAAACCGCAGACTTCTTTGCAATGGGGACAATGACTGTGGAGAC 288
Query 445 CAGTCAGATGAAGCAAACTGTAGAAGGATTTATAAAAAATGTCAGCATGAAATGGACCAATACTGGGGAATTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CAGTCAGATGAAGCAAACTGTAGAAGGATTTATAAAAAATGTCAGCATGAAATGGACCAATACTGGGGAATTGG 362
Query 519 CAGTCTGGCCAGTGGGATAAATTTGTTCACAAACAGTTTTGAGGGCCCAGTTCTTGATCACAGGTATTATGCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CAGTCTGGCCAGTGGGATAAATTTGTTCACAAACAGTTTTGAGGGCCCAGTTCTTGATCACAGGTATTATGCAG 436
Query 593 GTGGATGCTCCCCGCATTACATCCTGAACACGAGGTTTAGGAAGCCCTACAATGTGGAAAGCTACACGCCACAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 GTGGATGCTCCCCGCATTACATCCTGAACACGAGGTTTAGGAAGCCCTACAATGTGGAAAGCTACACGCCACAG 510
Query 667 ACCCAAGGCAAATACGAATTCATATTAAAAGAGTATGAATCATACTCAGATTTTGAACGCAATGTCACAGAGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 ACCCAAGGCAAATACGAATTCATATTAAAAGAGTATGAATCATACTCAGATTTTGAACGCAATGTCACAGAGAA 584
Query 741 AATGGCAAGCAAGTCTGGTTTCAGTTTTGGTTTTAAAATACCTGGAATATTTGAACTTGGCATCAGTAGTCAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 AATGGCAAGCAAGTCTGGTTTCAGTTTTGGTTTTAAAATACCTGGAATATTTGAACTTGGCATCAGTAGTCAAA 658
Query 815 GTGATCGAGGCAAACACTATATTAGGAGAACCAAACGATTCTCTCATACTAAAAGCGTATTTCTGCATGCACGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GTGATCGAGGCAAACACTATATTAGGAGAACCAAACGATTCTCTCATACTAAAAGCGTATTTCTGCATGCACGC 732
Query 889 TCTGACCTTGAAGTAGCACATTACAAGCTGAAACCCAGAAGCCTCATGCTCCATTACGAGTTCCTTCAGAGAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 TCTGACCTTGAAGTAGCACATTACAAGCTGAAACCCAGAAGCCTCATGCTCCATTACGAGTTCCTTCAGAGAGT 806
Query 963 TAAGCGGCTGCCCCTGGAGTACAGCTACGGGGAATACAGAGATCTCTTCCGTGATTTTGGGACCCACTACATCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TAAGCGGCTGCCCCTGGAGTACAGCTACGGGGAATACAGAGATCTCTTCCGTGATTTTGGGACCCACTACATCA 880
Query 1037 CAGAGGCTGTGCTTGGGGGCATTTATGAATACACCCTCGTTATGAACAAAGAGGCCATGGAGAGAGGAGATTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CAGAGGCTGTGCTTGGGGGCATTTATGAATACACCCTCGTTATGAACAAAGAGGCCATGGAGAGAGGAGATTAT 954
Query 1111 ACTCTTAACAACGTCCATGCCTGTGCCAAAAATGATTTTAAAATTGGTGGTGCCATTGAAGAGGTCTACGTCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 ACTCTTAACAACGTCCATGCCTGTGCCAAAAATGATTTTAAAATTGGTGGTGCCATTGAAGAGGTCTACGTCAG 1028
Query 1185 TCTGGGTGTGTCTGTAGGCAAATGCAGAGGTATTCTGAATGAAATAAAAGACAGAAACAAGAGGGACACCATGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCTGGGTGTGTCTGTAGGCAAATGCAGAGGTATTCTGAATGAAATAAAAGACAGAAACAAGAGGGACACCATGG 1102
Query 1259 TGGAGGACTTGGTGGTCCTGGTACGAGGAGGGGCAAGTGAGCACATCACCACCCTGGCATACCAGGAGCTGCCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TGGAGGACTTGGTGGTCCTGGTACGAGGAGGGGCAAGTGAGCACATCACCACCCTGGCATACCAGGAGCTGCCG 1176
Query 1333 ACGGCGGACCTGATGCAGGAGTGGGGAGACGCTGTGCAGTACAACCCAGCCATCATCAAAGTTAAGGTGGAGCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 ACGGCGGACCTGATGCAGGAGTGGGGAGACGCTGTGCAGTACAACCCAGCCATCATCAAAGTTAAGGTGGAGCC 1250
Query 1407 TCTGTATGAACTAGTGACAGCCACAGATTTTGCCTATTCCAGCACAGTGAGGCAGAACATGAAGCAGGCACTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 TCTGTATGAACTAGTGACAGCCACAGATTTTGCCTATTCCAGCACAGTGAGGCAGAACATGAAGCAGGCACTGG 1324
Query 1481 AGGAGTTCCAGAAGGAAGTTAGTTCCTGCCACTGTGCTCCCTGCCAAGGAAATGGAGTCCCTGTCCTGAAAGGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 AGGAGTTCCAGAAGGAAGTTAGTTCCTGCCACTGTGCTCCCTGCCAAGGAAATGGAGTCCCTGTCCTGAAAGGA 1398
Query 1555 TCACGCTGTGACTGCATCTGTCCTGTTGGATCCCAAGGCCTAGCCTGTGAGGTCTCCTATCGGAAGAATACCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 TCACGCTGTGACTGCATCTGTCCTGTTGGATCCCAAGGCCTAGCCTGTGAGGTCTCCTATCGGAAGAATACCCC 1472
Query 1629 CATTGATGGGAAGTGGAATTGCTGGTCAAATTGGTCTTCATGCTCTGGAAGACGTAAGACAAGACAAAGGCAGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 CATTGATGGGAAGTGGAATTGCTGGTCAAATTGGTCTTCATGCTCTGGAAGACGTAAGACAAGACAAAGGCAGT 1546
Query 1703 GTAACAATCCACCTCCTCAAAATGGGGGTAGCCCCTGTTCAGGCCCTGCTTCAGAAACACTTGACTGCTCC 1773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 GTAACAATCCACCTCCTCAAAATGGGGGTAGCCCCTGTTCAGGCCCTGCTTCAGAAACACTTGACTGCTCC 1617