Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481269
• Subject: XM_005246517.4
• Aligned Length: 1290
• Identities: 1219
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCCGCACGCCTTCTCCGAGGGTCCCTACGCGTCCTGGGCGGCCACCGTGCGCCGCGCCAGCTGCCCGCCGC  74
                                                                           .||.|.||...
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGACAGCATT  11

Query   75  GCGATGTTCTCATTCCGGAGGGGAAGAACGTCTAGAAACTCCTTCTGCTAAAAAATTAACAGATATAGGAATTC  148
            |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  GGTATGTTCTCATTCCGGAGGGGAAGAACGTCTAGAAACTCCTTCTGCTAAAAAATTAACAGATATAGGAATTC  85

Query  149  GAAGAATCTTTTCTCCAGAGCATGACATTTTCCGGAAAAGTGTAAGGAAGTTTTTCCAAGAAGAAGTGATTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  GAAGAATCTTTTCTCCAGAGCATGACATTTTCCGGAAAAGTGTAAGGAAGTTTTTCCAAGAAGAAGTGATTCCT  159

Query  223  CATCACTCAGAATGGGAGAAAGCTGGAGAAGTAAGTAGGGAGGTTTGGGAAAAAGCTGGAAAACAAGGACTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  CATCACTCAGAATGGGAGAAAGCTGGAGAAGTAAGTAGGGAGGTTTGGGAAAAAGCTGGAAAACAAGGACTGCT  233

Query  297  TGGTGTCAATATTGCAGAGCATCTTGGTGGAATTGGAGGGGATCTGTACTCCGCAGCTATTGTCTGGGAGGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  TGGTGTCAATATTGCAGAGCATCTTGGTGGAATTGGAGGGGATCTGTACTCCGCAGCTATTGTCTGGGAGGAGC  307

Query  371  AAGCTTATTCAAATTGTTCAGGCCCAGGTTTTAGTATTCATTCAGGTATTGTCATGTCCTATATTACAAACCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  AAGCTTATTCAAATTGTTCAGGCCCAGGTTTTAGTATTCATTCAGGTATTGTCATGTCCTATATTACAAACCAT  381

Query  445  GGCTCAGAAGAACAGATTAAGCACTTTATTCCCCAGATGACTGCAGGCAAATGTATTGGTGCAATAGCAATGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  GGCTCAGAAGAACAGATTAAGCACTTTATTCCCCAGATGACTGCAGGCAAATGTATTGGTGCAATAGCAATGAC  455

Query  519  AGAGCCTGGAGCTGGAAGTGACTTACAGGGAATAAAAACAAATGCTAAAAAGGATGGAAGTGACTGGATTCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  AGAGCCTGGAGCTGGAAGTGACTTACAGGGAATAAAAACAAATGCTAAAAAGGATGGAAGTGACTGGATTCTCA  529

Query  593  ATGGAAGCAAGGTGTTCATCAGTAATGGGTCATTAAGTGATGTTGTGATTGTAGTTGCGGTCACAAATCATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  ATGGAAGCAAGGTGTTCATCAGTAATGGGTCATTAAGTGATGTTGTGATTGTAGTTGCGGTCACAAATCATGAA  603

Query  667  GCTCCCTCCCCTGCCCATGGTATTAGCCTTTTTCTGGTGGAAAATGGAATGAAAGGATTTATCAAGGGACGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  GCTCCCTCCCCTGCCCATGGTATTAGCCTTTTTCTGGTGGAAAATGGAATGAAAGGATTTATCAAGGGACGAAA  677

Query  741  GCTACATAAAATGGGATTAAAAGCCCAGGATACCGCAGAACTATTCTTTGAAGATATACGGTTGCCAGCTAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GCTACATAAAATGGGATTAAAAGCCCAGGATACCGCAGAACTATTCTTTGAAGATATACGGTTGCCAGCTAGTG  751

Query  815  CCCTACTTGGAGAAGAGAATAAAGGCTTCTATTACATCATGAAAGAGCTTCCACAGGAAAGGCTGTTAATTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  752  CCCTACTTGGAGAAGAGAATAAAGGCTTCTATTACATCATGAAAGAGCTTCCACAGGAAAGGCTGTTAATTGCT  825

Query  889  GATGTGGCAATTTCAGCTAGTGAATTCATGTTTGAAGAAACCAGGAACTATGTTAAACAAAGAAAAGCTTTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  GATGTGGCAATTTCAGCTAGTGAATTCATGTTTGAAGAAACCAGGAACTATGTTAAACAAAGAAAAGCTTTTGG  899

Query  963  CAAAACAGTTGCTCACCTACAGACAGTGCAACATAAATTAGCAGAATTAAAAACACATATATGTGTAACCCGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  CAAAACAGTTGCTCACCTACAGACAGTGCAACATAAATTAGCAGAATTAAAAACACATATATGTGTAACCCGAG  973

Query 1037  CATTTGTGGACAACTGTCTCCAGCTGCATGAAGCGAAACGTTTGGACTCCGCCACTGCTTGCATGGCGAAATAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  CATTTGTGGACAACTGTCTCCAGCTGCATGAAGCGAAACGTTTGGACTCCGCCACTGCTTGCATGGCGAAATAT  1047

Query 1111  TGGGCATCTGAGTTACAAAATAGTGTAGCTTACGACTGTGTACAGCTCCATGGAGGTTGGGGATACATGTGGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048  TGGGCATCTGAGTTACAAAATAGTGTAGCTTACGACTGTGTACAGCTCCATGGAGGTTGGGGATACATGTGGGA  1121

Query 1185  GTACCCAATTGCAAAAGCTTATGTGGATGCCAGAGTTCAGCCAATCTATGGTGGTACAAATGAAATAATGAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122  GTACCCAATTGCAAAAGCTTATGTGGATGCCAGAGTTCAGCCAATCTATGGTGGTACAAATGAAATAATGAAGG  1195

Query 1259  AGCTGATTGCAAGAGAGATTGTCTTTGACAAG  1290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196  AGCTGATTGCAAGAGAGATTGTCTTTGACAAG  1227