Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481283
• Subject: XM_006524028.2
• Aligned Length: 682
• Identities: 565
• Gaps: 65

Alignment

Query   1  ATGGGAGACGCTGGGAGCGAGCGCA-GCAAAGCGCCCAGCCTGCCGCCTCGCTGTCCCTGCGGCTTCTGGGGGT  73
                                   | |||||                                        |||
Sbjct   1  ------------------------ATGCAAA----------------------------------------GGT  10

Query  74  CCAGCAAGACTATGAATCTCTGTTCCAAATGCTTTGCTGATTTTCAAAAGAAACAGCCAGACGATGATTCCGCT  147
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.
Sbjct  11  CCAGCAAGACTATGAATCTCTGTTCCAAATGCTTTGCTGATTTTCAAAAGAAACAACCAGATGATGATTCCACC  84

Query 148  CCAAGTACAAGTAACAGCCAATCAGATTTGTTTTCCGAAGAGACCACCAGTGACAACAACAATACCTCGATAAC  221
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  85  CCAAGTACAAGTAACAGCCAATCAGATTTGTTTTCCGAAGAGACCACCAGTGACAACAACAATACCTCTGTAAC  158

Query 222  CACGCCAACTCTTAGTCCCAGCCAGCAGCCGCTTCCGACAGAACTGAATGTAACTTCACCGAGTAAAGAGGAGT  295
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 159  CACGCCAACTCTTAGTCCCAGCCAGCAGTCGCTCCCGACAGAACTGAATGTAACTTCACCGAGTACAGAGGAAT  232

Query 296  GTGGGCCATGCACAGACACAGCTCATGTCTCATTAATCACACCAACAAAAAGATCCTGTGGTACAGATTCACAG  369
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 233  GTGGGCCATGCACAGACACAGCTCATGTCTCATTAATTACACCAACCAAAAGATCCTGTGGTGCAGATTCACAG  306

Query 370  TCTGAGAATGAGGCTTCACCAGTAAAACGGCCACGACTACTTGAGAATACGGAACGGTCCGAGGAAACCAGTCG  443
           ||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||.|.|||||..|.||.|||.|.|||||.|.|.|.||
Sbjct 307  TCCGAGAACGAGGCCTCACCCGTGAAGCGACCGCGACTAGTAGAGAACCCCGAGCGGCCTGAGGAGAGCGGCCG  380

Query 444  ATCTAAACAGAAGAGTCGACGTCGGTGCTTCCAGTGCCAAACCAAACTGGAGCTGGTGCAGCAGGAATTGGGAT  517
           .||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 381  GTCGAAGCAGAAGAGCCGGCGCCGCTGCTTCCAGTGCCAGACCAAGCTGGAGCTGGTGCAGCAGGAACTGGGAT  454

Query 518  CGTGTCGCTGCGGTTATGTGTTCTGTATGTTACATCGCCTCCCCGAGCAGCACGACTGCACATTCGACCACATG  591
           |.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 455  CCTGTCGCTGTGGCTACGTGTTCTGTATGTTACATCGCCTCCCAGAGCAGCACGACTGTACGTTCGACCACATG  528

Query 592  GGCCGTGGCCGGGAGGAAGCCATCATGAAAATGGTGAAGCTGGACCGGAAAGTGGGGCGCTCCTGCCAGCGCAT  665
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529  GGCCGTGGCCGCGAGGAAGCCATCATGAAAATGGTGAAACTGGACCGGAAAGTGGGGCGCTCCTGCCAGCGCAT  602

Query 666  CGGGGAGGGGTGCTCC  681
           ||||||||||||||||
Sbjct 603  CGGGGAGGGGTGCTCC  618