Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481305
• Subject: XM_006539279.3
• Aligned Length: 2076
• Identities: 1657
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGTGGCTACAGCAGGGGCTCAAGGGGCTGCCGGGACTGCTGTCGAGCAGCTGGGCCCGCCGCCTCCTCTGCCT  74
            ||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCTGCAGCAGCGCCTGAAGGGGCTGCCGGGGCTGCTGTCGAGCAGCTGGGCCCGCCGCCTCCTCTGCCT  74

Query   75  GCTTGGCCTCCTACTGCTGCTTCTGTGGTTTGGGGGGTCCGGCGCGCAGCGGGCGGCGGGCGGCCTGCACCTGC  148
            |||.||||||.|..|||||||.||||||||.|.|.|.|||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCGGCCTCTTGGTGCTGCTCCTGTGGTTCGCGAGCTCCGGGGCGCGGCGGGCGGCGGGCGGCCTGCACCTGC  148

Query  149  TGCCCTGGTCCTGGGGTGAGCCGGGCGCCACCGAGCCGTCTGCCTGCCTGGAGGCGGCCACCCGCGCCTGGCGC  222
            .|.|||||.||.|..|.||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CGTCCTGGGCCCGCAGCGAGCCGGGCGCCGCCGAGCCGTCTGCCTGTCTGGAGGCGGCCACCCGCGCGTGGCGC  222

Query  223  GGCCTGCGGGAGCGCGGCGAGGCGGTACCGCTGGGCCCTGGAGTGCCGGCCCTGGTGGCCAACGGCTTCCTGGC  296
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCCTGCGTGATCGCGGCGAGGCGGTGCCGCTTGGCCCCGGGGTGCCAGCCCTGGTGGCCAACGGCTTCCTGGC  296

Query  297  CCTGGACGTGGCTGC--CAATCGGCTGTGGGTGACTCCCGGGGAGCGGGAGCCCGCCGTGGCGCCGGACTTTGT  368
            .||||||  |.||.|  |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||
Sbjct  297  TCTGGAC--GCCTCCAACAACCGGCTGTGGGTGACGCCCGGAGAGCGGGAGCCTGCCGTGACGCCGGACTTCGT  368

Query  369  GCCCTTCGTGCAGCTGCGCCCGCTGAGCGCGCTGGCTGAAGCTGGAGAGGCGGTGCTGCTGCTGCGGGAGGGGC  442
            |||||||||||||||.||||||||||..|.|.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  369  GCCCTTCGTGCAGCTACGCCCGCTGAATGTGGTGGCCGAGGCTGGAGAGGCGGTGCTGCTTCTGCGGGAGGGCC  442

Query  443  TGCTGCGCCGCGTGCGTTGCCTGCAGCTGGGGTCCCCAGGTCCTTGCCCCGTGGCCGCCGG---CCCCGGGCCC  513
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||..|..||||   .|||||.||   ||||||||||
Sbjct  443  TGCTGCGCCGAGTGCGCTGCCTGCAGCTGGGGACCCCGGGCTCGGGCCC---TGCCGCTGGTGTCCCCGGGCCC  513

Query  514  GCCTCCGTCTCTGGCCTTGCCGCGGGGTCCGGCCGCGACTGCGTGCTGCTGCAAGAGGGCTTTCTGGCGCACAG  587
            |||||.|.|||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||.|||.|||||||||.|
Sbjct  514  GCCTCGGCCTCCGGGCTCTCCGCGGGGTCGGGCCGGGACTGCGTGCTACTGCAGGAGGACTTCCTGGCGCACCG  587

Query  588  GGGCCGACCCCACGTCTACCTGCAGCGCATCCAGCTCAACAACCCCACGGAGCGCGTGACCGCGCTGCAGACTG  661
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  588  AGGCCGACCCCACGTCTATCTGCAGCGCATCCAGCTCAACAATCCCACGGAGCGCGTGGCCGCGTTGCAGACTG  661

Query  662  TGGGGCCCACTGCCGGCCCAGCCCCCAAGGCCTTCACCAGTACCCTGGAGAAGGTCGGAGACCATCAGTTCCTC  735
            ||||||||||.||.|||||||.||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  662  TGGGGCCCACCGCAGGCCCAGTCCCCAAATCCTTCACCAGCACCCTGGAGAAGGTCGGAGATCACCAGTTTCTC  735

Query  736  CTCTACTCAGGCCGGTCCCCGCCTACGCCCA-CTGGGTTGGTGCACCTGGTGGTGGTGGCCGCCAAGAAGCTGG  808
            ||||||||.|||||||||.|.|| .|..||| |.|||.||||||||.||||.||||||.||.|.||||||.|.|
Sbjct  736  CTCTACTCGGGCCGGTCCACACC-CCTTCCATCGGGGCTGGTGCACTTGGTCGTGGTGACCTCTAAGAAGTTAG  808

Query  809  TGAACCGCCTCCAAGTGGCTCCCAAGACGCAGCTGGATGAGACGGTGCTGTGGGTGGTGCACGTCTCTGGCCCC  882
            |||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  809  TGAACAGGCTCCAGGTGGCTCCCAAGACACAGCTGGACGAGACGGTGCTGTGGGTGGTGCACATCTCTGGTCCC  882

Query  883  ATTAACCCCCAGGTGCCCAAAAGCAAAGCAGCCAAGGAGCTCAAGGCGCTGCAGGACTTGGCACGGAAGGAAAT  956
            ||..||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  883  ATCCACCCCCAGGTGCTCAAAAGCAAAGGAGCCAAGGAGCTCAAGGCGCTGCAGGACTTAGCACGGAAGGAGAT  956

Query  957  GCTGGAGCTCTTGGAGATGCCAGCGGCGGAGCTGCTTCAAGACCACCAGCTCCTCTGGGCTCAGCTCTTCAGCC  1030
            |||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  957  GCTGGAGCTGTTGGAGATGCCCGCCTCGGAGCTGCTTCAGGATCACCAGTACCTCTGGGCCCAGCTCTTCAGTC  1030

Query 1031  CAGGAGTGGAAATGAA---GATCACTGACACCCACAGGCCGTCTGGCCTCACCGTGAACCTGACGCTCTATTAC  1101
            |.||.|||||.|||||   ||||||.||..|.||||.|||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1031  CCGGTGTGGAGATGAAGAGGATCACGGATGCTCACACGCCATCTGGCCTGACCGTGAACCTGACCCTGTACTAC  1104

Query 1102  ATGCTCTCCTGCTCGCCAGCCCCGCTGCTCAGCCCCTCCCTGAGCCACAGGAAGCGAGACCAGATGGAGTCGAC  1175
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||.||.|||||||||.|.||
Sbjct 1105  ATGCTCTCCTGCTCTCCAGCCCCACTGCTCAGCCCCTCTCTGAGCCACAGGGAACGCGAGCAGATGGAGGCAAC  1178

Query 1176  GCTCAACTATGAAGATCACCGCTTCAGCGGGCACGCCACCATGCACGCCGAGAACCTGTGGCCGGGGCTGCTGT  1249
            |||||||||||||||.|||.|||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||.|
Sbjct 1179  GCTCAACTATGAAGACCACTGCTTCAGTGGCCATGCCACCATGCATGCCGAGAACCTGTGGCCTGGCCAGCTCT  1252

Query 1250  CCTCCGTCCAGCAGATCCTGCAGCTCTCTGACCTGTGGAGGCTGACCCTCCAGAAGAGTGGCTGCAAGGGGCTG  1323
            ||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1253  CCTCAGTGCAGCAGATCCTGCAGCTGGCTGACCTGTGGAAGTTGACCCTCCAGAAGCGCGGCTGCAAGGGGCTG  1326

Query 1324  GTGAAGGTGGGTGCCCCAGGCATCCTGCAGGGCATGGTGCTCAGCTTCGGGGGGCTGCAGTTCACAGAGAACCA  1397
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1327  GTGAAGGTTGGCGCTCCGGGCATCCTGCAAGGCATGGTGCTCAGCTTCGGCGGGCTACAGTTCACAGAAAACCA  1400

Query 1398  CCTCCAGTTCCAGGCCGACCCCGACGTGCTGCAGAACAGCTATGCATTGCATGGCATCCGCTACAAGAACGACC  1471
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  CCTGCAGTTCCAGGCCGACCCCGAGGTGCTCCACAACAGCTATGCGCTTCACGGCATCCGCTACAAGAACGACC  1474

Query 1472  ATATCAACCTGGCCGTGCTGGCGGATGCCGAGGGCAAGCCCTACCTACACGAGTCCGTGGAGTCCCGTGGCCAG  1545
            |.|||||||||||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||.||.|.|||..||||||||||.|||||.
Sbjct 1475  ACATCAACCTGGCTGTGCTGGTGGACGCTGAGGGCAAGCCCTACCTGCATGTGTCTTTGGAGTCCCGAGGCCAA  1548

Query 1546  CCTGTCAAGATCTATGCCTGCAAGGCAGGCTGCCTGGACGAGCCAGTGGAGCTGACCTCGGCGCCCACGGGCCA  1619
            ||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||..|.||.||.||.|||||||||||.|.|||....|||||
Sbjct 1549  CCCGTCAAGATCTACGCCTGTGAGGCAGGCTGCCTCCATGACCCCGTAGAGCTGACCTCAGAGCCTGGAGGCCA  1622

Query 1620  CACCTTCTCGGTCATGGTGACACAGCCCATCACGCCACTGCTCTACATCTCCACCGACCTCACACACCTGCAGG  1693
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1623  CACCTTCTCTGTCATGGTGACCCAGCCCATCACACCACTGTTGTACATCTCCACCGACCTCACACATCTGCAGG  1696

Query 1694  ACCTGCGGCACACGCTGCACCTCAAGGCCATCCTGGCCCATGATGAGCACATGGCTCAGCAGGACCCCGGGCTG  1767
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1697  ACCTGCGGCACACGCTGCACCTTAAGGCCATCCTGGCCCACGATGAGCACATGGCCCAGCAGGATCCCGGCCTG  1770

Query 1768  CCCTTCCTCTTCTGGTTCAGCTTGGCCTCCCTCATCACCCTCTTCCACCTCTTCCTCTTCAAGCTCATCTACAA  1841
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1771  CCCTTCCTCTTCTGGTTCAGTGTGGCCTCCCTCATCACCCTCTTCCACCTCTTCCTCTTTAAACTCATCTATAA  1844

Query 1842  CGAGTACTGTGGGCCTGGAGCCAAGCCCCTCTGCAGGAGTAAGGAAGATCCCAG--TGTC--------------  1899
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||      ||||  |.||              
Sbjct 1845  TGAGTACTGTGGGCCTGGAGCCAAGCCCCTCTTCAGGAGCAAGG------CCAGGCTTTCAGGGAAAGCAGTCC  1912

Query 1900  --------------------------------------------------------------------------  1899
                                                                                      
Sbjct 1913  TTGGCCCTCAGGAGCAGGCAGCAGACGGAGGCAGGTCTGAGTTCCTCACGATGGAGGAACCAGTGGAGACTTGG  1986

Query 1900  --------------------------------------------------------------------------  1899
                                                                                      
Sbjct 1987  GTCGGAAAGCAGTGTGGAGAAGGTCTTCCAAGTAGCCAGCTTTTGGCCAGCTATCTAGAAAAGGAAGATCCCAG  2060

Query 1900  ----  1899
                
Sbjct 2061  TGTC  2064