Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481323
• Subject: NM_001077193.3
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1071
• Gaps: 265

Alignment

Query    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA  74

Query   75  CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct   75  CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA  148

Query  149  CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG  222
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG  222

Query  223  TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT  296
            .||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT  296

Query  297  TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA  370

Query  371  TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT  444
            ||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  371  TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT  444

Query  445  GTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTAC  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  GTGGGCCATGGAGTTAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAGAACAAACCCTCCCAC  518

Query  519  TCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAAC  592
            .||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  GCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTTACAAAACCCTAGAGC  592

Query  593  CTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGC  666
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGCCAGCATAGTCCAGGC  666

Query  667  AGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  AGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGGAAGCCGAGAGAACAG  740

Query  741  TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCAGCCCCGG  814
            |||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||               .|||
Sbjct  741  TGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACT---------------GCGG  799

Query  815  GCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACA  888
            ||.|||                                                                    
Sbjct  800  GCCCAG--------------------------------------------------------------------  805

Query  889  TCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC  962
                                                                                      
Sbjct  806  --------------------------------------------------------------------------  805

Query  963  ACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTC  1036
                                                                                      
Sbjct  806  --------------------------------------------------------------------------  805

Query 1037  TCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGAT  1110
                                             ||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  806  ---------------------------------TTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCACCCCCTCCACCAGAT  846

Query 1111  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  847  GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGAAGATGAGGAAGCTGC  920

Query 1185  AGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTG  1258
            ||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  921  AGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACTATATTGAGAAAGTTG  994

Query 1259  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATA  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  995  TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCAATCATCTATGTTATA  1068

Query 1333  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  AAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCCTGGGAACTATGTTGA  1142

Query 1407  ATCAATCATGCA-TATACTGAT  1427
            |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1143  ATCAATCATGCACTATACTGAT  1164